Identificação
Identificação pessoal
- Nome completo
- Miguel Machuqueiro
Nomes de citação
- Machuqueiro, Miguel
Identificadores de autor
- Ciência ID
- D416-CB5B-AC3D
- ORCID iD
- 0000-0001-6923-8744
- Google Scholar ID
- vMBlK7AAAAAJ
- Researcher Id
- C-8012-2011
- Scopus Author Id
- 57221975472
Telefones
- Telefone
-
- 217500112 (Profissional)
Moradas
- Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa. Campo Grande, Edifício C8 (sala 8.5.52), 1749-016, Lisboa, Lisboa, Portugal (Profissional)
Websites
- http://mms.rd.ciencias.ulisboa.pt/ (Profissional)
Domínios de atuação
- Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Bioquímica
Idiomas
Idioma | Conversação | Leitura | Escrita | Compreensão | Peer-review |
---|---|---|---|---|---|
Português | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador proficiente (C1) | |
Inglês | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador proficiente (C1) | |
Francês | Utilizador elementar (A1) | Utilizador independente (B1) | Utilizador elementar (A1) | Utilizador elementar (A1) | |
Espanhol; Castelhano | Utilizador independente (B1) | Utilizador independente (B1) | Utilizador elementar (A1) | Utilizador independente (B1) | |
Italiano | Utilizador elementar (A1) | Utilizador independente (B1) | Utilizador elementar (A1) | Utilizador elementar (A1) | |
Alemão | Utilizador elementar (A1) | Utilizador elementar (A1) | Utilizador elementar (A1) | Utilizador elementar (A1) |
Formação
Grau | Classificação | |
---|---|---|
2003/04/24
Concluído
|
Doutoramento em Química Bioorgânica (Doutoramento)
Universidade de Berna, Suiça
"Chemical Models of Zinc-dependent Enzymes: Methyltransferases and Class II Aldolases" (TESE/DISSERTAÇÃO)
|
5 (0-6) |
1998/06/30
Concluído
|
Bioquímica (Licenciatura)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
"Simulação do Ciclo de Oxidação e Redução das Ubiquinonas num Modelo de Transporte Electrónico - Aplicação ao Peroxissoma" (TESE/DISSERTAÇÃO)
|
15 (0-20) |
Percurso profissional
Docência no Ensino Superior
Categoria Profissional Instituição de acolhimento |
Empregador | |
---|---|---|
2014/06/15 - 2019/04/30 | Professor Auxiliar Convidado (Docente Universitário) | Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal |
Outros
Categoria Profissional Instituição de acolhimento |
Empregador | |
---|---|---|
2019/05/01 - Atual | Investigador Auxiliar (CEEC-IND 2017) | Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal |
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal (...) |
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2009/06/15 - 2014/06/14 | Investigador Auxiliar (Ciência 2008) | Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal |
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal | ||
2006/09/16 - 2009/06/14 | Pós-Doutoramento (2º triénio) | Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal |
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal | ||
2003/09/01 - 2006/09/15 | Pós-Doutoramento (1º triénio) | Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal |
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal | ||
1999/04/09 - 2003/04/24 | Doutoramento em Química Bioorgânica | Universidade de Berna, Suiça |
Universidade de Berna, Suiça | ||
1996/10/01 - 1998/06/30 | Estágio de Licenciatura em Bioquímica (FCUL) | Instituto Rocha Cabral, Portugal |
Instituto Rocha Cabral, Portugal |
Projetos
Bolsa
Designação | Financiadores | |
---|---|---|
2022/03/01 - 2023/02/28 | A fast deep learning approach to improve protein pKa predictions
Investigador responsável
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
|
2001/04/01 - 2003/03/31 | Model Studies of Zn-dependent Methyltransferases
Bolseiro de Doutoramento
|
Schweizerischer Nationalfonds zur Förderung der wissenschaftlichen Forschung
Concluído
|
1999/04/01 - 2001/03/31 | Model Studies of Zn-dependent Methyltransferases
Bolseiro de Doutoramento
|
Schweizerischer Nationalfonds zur Förderung der wissenschaftlichen Forschung
Concluído
|
Projeto
Designação | Financiadores | |
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2019/09 - Atual | Understanding and exploiting the impacts of low pH on micro-organisms - EuroMicropH
CMST COST Action CA18113
Investigador
|
European Commission
Em curso
|
2019 - Atual | Physical Basis of Disease: The case of Dialysis Related Amyloidosis
PTDC/FIS-OUT/28210/2017
Investigador
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
|
2019 - Atual | Uncovering blind spots in halogen bonding applications
PTDC/QUI-QFI/28455/2017
Investigador
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
|
2019 - Atual | Deal with PAINS: strategies to identify membrane modulators
PTDC/BIA-BFS/28419/2017
Investigador
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
|
2019 - Atual | Targeting multi-resistant tuberculosis with new potent isoniazid derivatives: an integrated medicinal chemistry approach
PTDC/MED-QUI/29036/2017
Investigador
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
|
2018/09 - Atual | EUropean TOPology Interdisciplinary Action - Eutopia
CMST COST Action CA17139
Investigador
|
European Commission
Em curso
|
2018/09 - Atual | New diagnostic and therapeutic tools against multidrug resistant tumors - Stratagem
CMST COST Action CM17104
Investigador
|
European Commission
Em curso
|
2023/05/01 - 2024/04/30 | In silico study of peptidic dendrimers as transfection agents in RNA vaccines
Investigador responsável
Universidade de Lisboa Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
|
2021/03/01 - 2024/02/29 | Fármacos de ruténio-péptido: flechas para alvejar seletivamente o cancro da mama
PTDC/QUI-QIN/0146/2020
Investigador
Universidade de Lisboa Centro de Química Estrutural, Portugal
Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento, Portugal Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal |
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
|
2016/04/01 - 2019/09/30 | CpHMD-L simulations of pHLIP peptides: design of new tumor-targeted drug delivery systems
Investigador responsável
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia |
2013/07 - 2016/06 | Increasing the realism of membrane modelling in constant-pH molecular dynamics methods: inclusion of electrochemical gradients
and lipid titration
Investigador
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
|
2011/01/01 - 2014/06/30 | Adding realism to the molecular modeling of lipidic membranes: inclusion of pH effects
Investigador responsável
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
|
2010/01 - 2013/06 | Understanding structure-activity relationships in peptide dendrimers using a molecular modelling approach
Investigador
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
|
2010/01 - 2013/06 | Including protonation effects in the simulation of peptides and proteins in membrane environments
Investigador
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
|
2010/01 - 2013/03 | Study of pH-dependent protein misfolding using state-of-the-art molecular modeling methods
Investigador
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
|
2006/10/15 - 2009/06/14 | MEMBRANE-INDUCED STRUCTURAL CHANGES IN PROTEINS: A COMPUTER SIMULATION STUDY
SFRH/BPD/29358/2006
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
|
2003/10/01 - 2006/09/30 | EFEITO DO pH E DA OXI-REDUÇÃO NA ESTRUTURA E DINÂMICA DE BIOMOLÉCULAS: ESTUDOS DE MODELAÇÃO MOLECULAR
SFRH/BPD/14540/2003
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
|
Produções
Publicações
Artigo em revista |
|
Capítulo de livro |
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Atividades
Orientação
Título / Tema Papel desempenhado |
Curso (Tipo) Instituição / Organização |
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2021 - 2023 | Computational biophysics evaluation of promising smart metallodrug delivery systems
Orientador de Inês Domingos da Silva Pires
|
Biochemistry (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
2018 - 2023 | In silico tumor-targeting technologies for the evasion of acidity-induced multidrug resistance
Orientador de Tomás Fernandes da Silva
|
Theoretical Biochemistry (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
2018 - 2023 | A new generation of user-friendly and machine learning-accelerated methods for protein pKa calculations
Orientador de Pedro de Brito Pires Santos Reis
|
Theoretical Biochemistry (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
2020 - 2022 | PyBindE: Development of a Simple Python MM-PBSA Implementation for Estimating Protein-Protein and Protein-Ligand Binding Energies
Orientador de João Nuno Marques Vitorino
|
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
2020 - 2022 | Developing a computational method to calculate pH-dependent membrane permeabilities for anti-tumour drugs
Orientador de Pedro Miguel Sousa Suzano
|
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
2020 - 2022 | High-throughput virtual screening to identify non-covalent inhibitors of CRM1 with anti-tumoral potential
Orientador de João Gonçalo Nunes Sequeira
|
Bioinformatics (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
2019 - 2020 | Study of the interaction between the amyloid B peptide and the S100B protein using computational techniques
Orientador de Filipe Eduardo Pequito Rodrigues
|
Biochemistry (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
2019 - 2020 | The role of electrostatics in the mechanism of ATP/ADP Carrier function: an in silico study
Orientador de Nuno Filipe Baltazar Maia Costa de Oliveira
|
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
2016 - 2017 | Computational study of pH-dependent membrane insertion mechanism of pHLIP peptides
Orientador de Tomás Fernandes da Silva
|
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
2016 - 2017 | Improving pKa calculations of membrane inserting amino acids using replica exchange CpHMD simulations
Orientador de Pedro de Brito Pires Santos Reis
|
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
2016 - 2017 | Encapsulamento da Catequina EGCG no Lipossoma: Múltiplas Abordagens
Coorientador de Bárbara Rodrigues
|
Universidade Nova de Lisboa Departamento de Física, Portugal
|
2011 - 2016 | Studying the structural features of peptide dendrimers using a combined computational and experimental approach
Coorientador de Luís Carlos Santos Filipe
|
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
|
2014 - 2015 | Synthesis of new antibiotic glycosides and computational studies on their interaction with model lipid bilayers
Orientador de Rafael de Santana Nunes
|
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
2011 - 2015 | Molecular modeling and simulation of pH effects in lipid bilayers
Orientador de Diogo Ruivo dos Santos Vila Viçosa
|
Theoretical Biochemistry (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
2013 - 2014 | Cyclodextrins as anti-asthmatic drug carriers: an in silico study
Orientador de Bruno Emanuel de Sá Calçada
|
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
2012 - 2013 | Constant-pH MD simulations of higher complexity lipid bilayer models: PA/PC binary mixtures
Orientador de Hugo Alexandre Feiteira dos Santos
|
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
2011 - 2012 | Avaliação in silico da tioredoxina redutase como alvo para terapia anti-tumoral
Orientador de Ana Sofia Capacho
|
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
2010 - 2011 | Study of pH-dependent misfolding of surfactant protein C using state-of-the-art molecular modelling techniques
Coorientador de Catarina Carvalheda Santos
|
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
2009 - 2010 | Application of QM and MM methodologies to cytochrome c3: charge parametrization of the heme group for classic force fields
Orientador de João Manuel Almeida Henriques
|
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
2009 - 2010 | Reversibility of prion misfolding by constant-pH molecular dynamics simulations
Orientador de Diogo Vila Viçosa
|
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
Júri de grau académico
Tema Tipo de participação |
Nome do candidato (Tipo de grau) Instituição / Organização |
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---|---|---|
2023/01/04 | Overcoming Multidrug Resistance: search for human P-glycoprotein modulators and insights on drug efflux mechanism
Arguente principal
|
Cátia Alexandra Marques Bonito Ferreira (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
|
2022/12/12 | Analysis of residue interaction networks in molecular dynamics simulations
Arguente principal
|
Gonçalo Miguel Fonseca Monteiro (Mestrado)
Instituto Politécnico de Setúbal Escola Superior de Tecnologia do Barreiro, Portugal
|
2021/11/30 | SARS-CoV-2 membrane protein: from genomic data to structural new insights
Arguente principal
|
Manuel Maria Moura Neves Moreira Pires (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
|
2021/06/22 | Computational studies addressed to multifunctional enzyme complexes
Arguente principal
|
Carla Sílvia Silva Teixeira (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
|
2020/12/10 | The structural and functional role of CACNG2 mutations in psychiatric disorders
Arguente principal
|
Raquel Pina Gouveia (Mestrado)
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
|
2019 | Disclosing the aggregation mechanism of ß2-microglobulin in amyloid disease
Arguente
|
Rui Loureiro (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
2018 | Molecular modeling study of beta-lactogrlobulin dimerization: a first step to hypoallergen design for immunotherapy
Arguente principal
|
Lucie da Rocha (Mestrado)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
|
2017 | Reversing multidrug resistance (MDR) in cancer cells by targeting P-glycoprotein (Pgp)— Insights into the mechanism of MDR
reversal from in silico Pgp modeling
Arguente
|
Ricardo José Ferreira (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Farmácia, Portugal
|
2016 | Modelação molecular/Bioinformática estrutural da hemaglutinina do virus influenza
Arguente principal
|
Jorge Antunes (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
2013 | Estudos de Inibição Enzimática
Arguente principal
|
Marta Perez Gomes (Doutoramento)
Universidade do Porto, Portugal
|
2013 | Theoretical investigation of the energy of olefin- and sila-olefin insertion/ß-H elimination reactions of two late transition
metals – DFT MO calculations
Arguente
|
Rita Ferro (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
2012 | Propriedades Electrónicas de Espécies Hidrofóbicas Micro-solvatadas e em Solução
Arguente
|
Margarida Mateus (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
2011 | Molecular Modelling of transmembranar transporters for Chloride
Arguente principal
|
Igor Marques (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
|
Arbitragem científica em revista
Nome da revista (ISSN) | Editora | |
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2018 - Atual | Journal of Computational Biophysics and Chemistry (2737-4165) | World Scientific |
2018 - Atual | The Journal of Membrane Biology (0022-2631) | Springer |
2013 - Atual | PLOS ONE (1932-6203) | PLOS |
Entrevista / Programa (rádio / tv)
Programa | Tema | |
---|---|---|
2020/10/05 - Atual | 90 Segundos de Ciência | Science |
Membro de comissão
Descrição da atividade Tipo de participação |
Instituição / Organização | |
---|---|---|
2020/01/01 - 2024/12/31 | Member of the Coordination team of the BioISI research unit. Responsible for the Computational Biology Thematic Line.
Outro
|
Universidade de Lisboa Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas, Portugal |
2018/01/01 - 2019/12/31 | Member of the Coordination team of the Centro de Química e Bioquímica research unit. Responsible for budget and funding management.
Outro
|
Universidade de Lisboa Centro de Química e Bioquímica, Portugal |
Distinções
Outra distinção
2016 | Conference grant award (400 Euros) for the participation in the Protein Electrostatics Berlin in Berlin, Germany
Technische Universität Berlin Institut für Lebensmitteltechnologie und Lebensmittelchemie, Alemanha
|
2015 | 36 months grant for postdoctoral studies awarded by the Portuguese Foundation for Science and Technology in a highly competitive
call.
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
|
2013 | Conference grant award (900 Euros) for the participation in the 246th ACS Meeting in Indianapolis, USA
Fundação Luso-Americana, Portugal
|
2010 | Conference grant award (1200 Euros) for the participation in the Proton Transfer Electrostatics in Telluride, CO, USA.
Fundação Luso-Americana, Portugal
|
2009 | 5 years contract under the Ciência2008 program by the Portuguese Foundation for Science and Technology in a highly competitive
call.
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
|
2006 | 36 months grant for postdoctoral studies awarded by the Portuguese Foundation for Science and Technology in a highly competitive
call.
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
|
2003 | 36 months grant for postdoctoral studies awarded by the Portuguese Foundation for Science and Technology in a highly competitive
call.
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
|
1999 | 48 months grant for doctoral studies awarded by the Swiss National Science Foundation.
Schweizerischer Nationalfonds zur Förderung der wissenschaftlichen Forschung, Suiça
|
1997 | Prize awarded by the Portuguese office for the Ministry of Education under the program PRODEP for excellence in completion
of undergraduate studies.
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|