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Graduate degree in Evolutionary and Developmental Biology and master degree in Human Biology and Environment, from Faculdade de Ciências, Universidade de Lisboa (Lisbon, Portugal). Participated as master fellow in two research projects. Currently, I am a PhD student at Instituto de Tecnologia Química e Biológica (ITQB), Universidade Nova de Lisboa (Oeiras, Portugal), under the supervision of Doctor Célia Miguel. In my PhD project I aim to investigate key developmental processes relevant for periderm formation using cork oak as model system.
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Susana Fernandes Torres Lopes

Nomes de citação

  • Susana Lopes
  • Susana T. Lopes

Identificadores de autor

Ciência ID
9217-B39B-B067
ORCID iD
0000-0002-5326-9500

Endereços de correio eletrónico

  • sflopes@fc.ul.pt (Profissional)
  • susanalopes@itqb.unl.pt (Profissional)

Moradas

  • Instituto de Biologia Química e Tecnológica (ITQB). Av. da República, Estação Agronómica Nacional, 2780-157, Oeiras, Oeiras, Portugal (Profissional)

Websites

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Inglês Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B1)
Formação
Grau Classificação
2016/04 - 2020
Em curso
 Biology (Doutoramento)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2010 - 2012
Concluído
 Human Biology and Environment (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
"Forensic Entomology: DNA Barcoding for Coleoptera Identification" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 18
2007 - 2010
Concluído
 Biology (Licenciatura)
Especialização em Evolutionary and Developmental Biology
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
"n/a" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 14
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2015/01/01 - 2016/03/31 Investigador (Investigação) Instituto de Biologia Experimental e Tecnológica, Portugal
Instituto de Biologia Experimental e Tecnológica, Portugal
2013/03/05 - 2014/07/04 Investigador (Investigação) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal

Outras Carreiras

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2021/02/01 - Atual Técnico Superior (Técnico Superior) GenoMed, Portugal
GenoMed, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2015 - 2016 Promoting a functional and comparative understanding of the conifer genome- implementing applied aspects for more productive and adapted forests.
info:eu-repo/grantAgreement/EC/FP7/289841/EU
Bolseiro de Investigação
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2013 - 2014 Comparative genomics approach to unravelling a new sexual reproduction system in fungi
info:eu-repo/grantAgreement/FCT/3599-PPCDT/112799/PT
Bolseiro de Investigação
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em conferência
  1. Andreia S. Rodrigues; Inês Chaves; Bruno Costa; Yao-Cheng Lin; Susana T. Lopes; Sónia Correia; Yves Van de Peer; Andreas Bohn; Célia M. Miguel. "Identification of regulatory miRNA-target nodes across embryo development in Pinus pinaster". Trabalho apresentado em Proceedings of the Fourth International Conference of the IUFRO Unit 2.09.02, 2016.
    Publicado
Artigo em revista
  1. "MiR160 interacts in vivo with Pinus pinaster ARF18 target site and negatively regulates its expression during conifer somatic embryo development". Frontiers in Plant Science (2022):
    Aceite para publicação
  2. Lopes, Susana T; Sobral, Daniel; Costa, Bruno; Perdiguero, Pedro; Chaves, Inês; Costa, Augusta; Miguel, Célia M. "Phellem versus xylem: genome-wide transcriptomic analysis reveals novel regulators of cork formation in cork oak". Tree Physiology (2019): http://dx.doi.org/10.1093/treephys/tpz118.
    10.1093/treephys/tpz118
  3. Rodrigues, Andreia S.; Chaves, Inês; Costa, Bruno Vasques; Lin, Yao-Cheng; Lopes, Susana; Milhinhos, Ana; Van de Peer, Yves; Miguel, Célia M.. "Small RNA profiling in Pinus pinaster reveals the transcriptome of developing seeds and highlights differences between zygotic and somatic embryos". Scientific Reports 9 1 (2019): http://dx.doi.org/10.1038/s41598-019-47789-y.
    Publicado • 10.1038/s41598-019-47789-y
  4. Maia, Teresa M.; Lopes, Susana T.; Almeida, João M. G. C. F.; Rosa, Luiz H.; Sampaio, José Paulo; Gonçalves, Paula; Coelho, Marco A.. "Evolution of Mating Systems in Basidiomycetes and the Genetic Architecture Underlying Mating-Type Determination in the YeastLeucosporidium scottii". Genetics 201 1 (2015): 75-89. http://dx.doi.org/10.1534/genetics.115.177717.
    Publicado • 10.1534/genetics.115.177717
  5. Susana T. Lopes; Catarina G. Dourado; Ana Rita Oliveira; Israel Faria e Silva; Ana Farinha; Maria Teresa Rebelo; Deodália Dias. "Molecular Identification of Western-Palaearctic Leaf Beetles (Coleoptera, Chrysomelidae)". Journal of the Entomological Research Society 17 2 (2015): 93-101.
    Acesso aberto • Publicado
Capítulo de livro
  1. Milhinhos, Ana; Lopes, Susana; Miguel, Célia. "microRNA-Mediated Regulation of Plant Vascular Development and Secondary Growth". In Plant microRNAs, 143-168. Springer International Publishing, 2020.
    Publicado • 10.1007/978-3-030-35772-6_8
Poster em conferência
  1. Ana Alves; Andreia Rodrigues; Susana T. Lopes; Pedro Perdiguero; Bruno Costa; Inês Chaves; Ana Confraria; Célia M. Miguel. "Validation of in vivo interaction between miRNAs and their putative target transcripts playing a crucial role in conifer embryogenesis". Trabalho apresentado em IUFRO Tree Biotechnology, 2019.
  2. Susana T. Lopes; Daniel Sobral; Bruno Costa; Pedro Perdiguero; Inês Chaves; Augusta Costa; Célia M. Miguel. "Insights into periderm formation through transcriptomic analysis". Trabalho apresentado em . EMBO - New shores in land plant evolution, 2018.
  3. Ana Alves; Andreia Rodrigues; Susana T. Lopes; Pedro Perdiguero; Bruno Costa; Inês Chaves; Célia M. Miguel. "Characterizing functional roles of candidate miRNAs in conifer embryogenesis". Trabalho apresentado em EMBO - New shores in land plant evolution, 2018.
  4. Susana T. Lopes; Daniel Sobral; Bruno Costa; Pedro Perdiguero; Inês Chaves; Augusta Costa; Célia M. Miguel. "Understanding the molecular pathways underlying periderm formation". Trabalho apresentado em Plant Biology Europe (PBE), 2018.
  5. Susana T. Lopes; Bruno Costa; Pedro Perdiguero; Inês Chaves; Augusta Costa; Célia M. Miguel. "Transcriptional analysis of Quercus suber periderm samples". Trabalho apresentado em Plant Apoplastic Diffusion Barriers (PADiBa) Symposium, 2017.
  6. Andreia S. Rodrigues; Inês Chaves; Andreas Bohn; Ana Milhinhos; Susana T. Lopes; André Rodrigues; Célia M. Miguel. "Uncovering the embryo microRNA transcriptome of the conifer Pinus pinaster". Trabalho apresentado em IUFRO Tree Biotechnology Conference, 2015.
  7. Marco A. Coelho; Susana T. Lopes; Teresa Maia; José Paulo Sampaio; Paula Gonçalves. "Evolution of sex determination in red yeasts: exploring the impact of genomic structural variation". Trabalho apresentado em XX Jornadas de Biologia de Leveduras “Professor Nicolau Van Uden”, 2014.
  8. Teresa Maia; Susana T. Lopes; José Paulo Sampaio; Paula Gonçalves; Marco A. Coelho. "Molecular characterization of the mating system of Leucosporidium scottii sets tetrapolarity as a transversal feature common to all Basidiomycota". Trabalho apresentado em XX Jornadas de Biologia de Leveduras “Professor Nicolau Van Uden”, 2014.
  9. Marco A. Coelho; Susana T. Lopes; Teresa Maia; José Paulo Sampaio; Paula Gonçalves. "Genetic and genomic insights into the sexual reproductive systems in red yeasts". Trabalho apresentado em 12th European Conference on Fungal Genetics (ECFG12), 2014.
  10. Marco A. Coelho; Susana T. Lopes; Teresa Maia; José Paulo Sampaio; Paula Gonçalves. "Evolution from fungal mating systems: insights from red yeasts genomes". Trabalho apresentado em MicroBiotec ’13, 2013.
  11. Teresa Maia; Marco A. Coelho; Susana T. Lopes; Paula Gonçalves; José Paulo Sampaio. "Hints on the evolution of mating systems in basidiomycetes coming from the order Leucosporidiales". Trabalho apresentado em MicroBiotec'13, 2013.
Tese / Dissertação
  1. Susana T. Lopes. "Forensic Entomology: DNA Barcoding for Coleoptera Identification". Mestrado, Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, 2012.
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2019 Candidate genes involved in cork cambium activity and phellem differentiation highlighted by transcriptomic analysis Plant Apoplastic Diffusion Barriers (PADiBa) Symposium
(Alemanha)
2019 Identification of molecular regulators involved in the formation of Quercus suber cork tissues IUFRO Tree Biotechnology
(Estados Unidos)
2018 Transcriptional identification and characterization of differentially expressed miRNAs involved in conifer embryogenesis 5th 2.09.02 Working Party Conference - Clonal Trees in the Bioeconomy Age: Opportunities and Challenges
(Portugal)
2017 Differentiation of suberized phellem cells: unravelling transcriptional and post-transcriptional regulatory mechanisms Plant Apoplastic Diffusion Barriers (PADiBa) Symposium
(Portugal)
2013 Evolution and comparative genomics of the pseudo-bipolar sexual reproduction system in red yeasts EMBO Conference - Comparative Genomics of Eukaryotic Microorganisms: Complexity Patterns in Eukaryotic Genomes
(Espanha)

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento 		Nome do evento
Instituição / Organização
2019/02/04 - 2019/02/08 Entry Level Bioinformatics Course
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
2018/07/09 - 2018/07/13 Hands-on Workshop on High-throughput Microscopy
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2016/05/03 - 2016/05/06 Research Skills Development Course
Universidade Nova de Lisboa Nova School of Business and Economics, Portugal
2012/01/23 - 2012/01/27 Practical Course on Phylogenetics
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2011/09/12 - 2011/09/13 Forensic Entomology Workshop
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal