???global.info.a_carregar???
ANA MARGARIDA PIRES DE ALMEIDA MOTA FERNANDES. Completed the Mestrado integrado in Biomedical Engineering in 2010/12 by Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia and Doutoramento in Biomedical and Biophysical Engineering in 2022 by Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências. Is Invited Assistant Professor in Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências. Published 10 articles in journals. Has 1 section(s) of books. Organized 4 event(s). Participated in 14 event(s). Supervised 4 MSc dissertation(s). Has received 5 awards and/or honors. Participates and/or participated as Other in 3 project(s), Principal investigator in 1 project(s), Research Fellow in 2 project(s) and Researcher in 3 project(s). Works in the area(s) of Engineering and Technology with emphasis on Medical Engineering with emphasis on Medical Engineering.
Ler resumo completo ↓
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
ANA MARGARIDA PIRES DE ALMEIDA MOTA FERNANDES

Nomes de citação

  • Mota, Ana M.

Identificadores de autor

Ciência ID
8E19-7453-3890
ORCID iD
0000-0002-1931-294X

Domínios de atuação

  • Ciências da Engenharia e Tecnologias - Engenharia Médica - Engenharia Médica

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês Utilizador independente (B2) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Espanhol; Castelhano Utilizador elementar (A2) Utilizador elementar (A2) Utilizador elementar (A1) Utilizador independente (B2) Utilizador elementar (A1)
Formação
Grau Classificação
2016 - 2022
Concluído
 Biomedical and Biophysical Engineering (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
"Enhanced Digital Breast Tomosynthesis diagnosis using 3D visualization and automatic classification of lesions" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 Approved with Distinction
2005 - 2010/12
Concluído
 Biomedical Engineering (Mestrado integrado)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
"Noise minimization in Positron Emission Mammography images by optimization of acquisition time and voxel size" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 16
Percurso profissional

Docência no Ensino Superior

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2022/09 - Atual Professor Auxiliar Convidado (Docente Universitário) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2016 - 2018 Assistente Estagiário (Docente Universitário) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2015/03 - 2015/12 Improvement of image quality and dose reduction in digital breast tomosynthesis using statistical image reconstruction algorithms
PTDC/BBBIMG/3310/2012
Bolseiro de Investigação
Universidade de Lisboa Instituto de Biofísica e Engenharia Biomédica, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2014/10 - 2015/02 Establishment of an open database for evaluation of partial volume correction techniques in brain PET/MR studies
COST Action TD1007
Visiting Scientist
European Cooperation in Science and Technology, Bélgica

University College London Hospitals, Reino Unido
European Cooperation in Science and Technology

University College London Hospitals
Concluído
2014/03 - 2014/08 Improvement of image quality and dose reduction in digital breast tomosynthesis using statistical image reconstruction algorithms
PEst-OE/SAU/UI0645/2014
Bolseiro de Investigação
Universidade de Lisboa Instituto de Biofísica e Engenharia Biomédica, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído

Outro

Designação Financiadores
2024/09 - Atual COST Action CA22118: “Radionuclide theragnostics for personalised medicine (RATIONALE)”
CA22118
Investigador
Em curso
2024/05 - Atual FOCUS Research (Factors Of Concentration Under Socials)
FOCUS
Investigador responsável
Universidade de Lisboa Instituto de Biofísica e Engenharia Biomédica, Portugal
Em curso
2024/01 - Atual European project No. 101057699: “RadioVal | International Clinical Validation of Radiomics Artificial Intelligence for Breast Cancer Treatment Planning”
101057699
Investigador
Universitat de Barcelona Facultat de Matemàtiques i Informàtica, Espanha
Em curso
2020 - Atual Project FCT-IBEB Strategic Project UIDB/00645/2020
UIDB/00645/2020
Investigador
Universidade de Lisboa Instituto de Biofísica e Engenharia Biomédica, Portugal
Em curso
2012/01 - 2013/05 Quality in Image Guided Radiotherapy
CAML
Outra
Centro Académico de Medicina de Lisboa, Portugal
Concluído
2010 - 2010 Clear-PEM Consortium
Clear-PEM
Master Student
Universidade de Lisboa Instituto de Biofísica e Engenharia Biomédica, Portugal
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em conferência
  1. M. Simões; N. Matela; A.M. Mota; P. Almeida. "PS01.20 AUTOMATIC BREAST DENSITY CLASSIFICATION ON TOMOSYNTHESIS IMAGES". 2024.
    10.1016/j.ejmp.2024.104022
  2. A.M. Mota; N. Matela; P. Almeida. "PP25.06 ENHANCING IMAGE QUALITY IN PEDIATRIC RENAL SCINTIGRAPHY: A PATH TOWARDS DOSE REDUCTION". 2024.
    10.1016/j.ejmp.2024.103858
  3. Mota, Ana; Clarkson, Matthew; Almeida, Pedro; Matela, Nuno. "Detection of Microcalcifications in Digital Breast Tomosynthesis using Faster R-CNN and 3D Volume Rendering". Trabalho apresentado em 15th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies - BIOIMAGING, 2022.
    10.5220/0010938800003123
  4. Mota, Ana M.; Clarkson, Matthew J.; Orvalho, Lurdes; Almeida, Pedro; Matela, Nuno. "Calculation of transfer functions for volume rendering of breast tomosynthesis imaging". 2020.
    10.1117/12.2559932
  5. Paulo, Soraia F.; Martins, João; Mota, Ana M.; Abreu, Elisa Melo; Niza, João; Matela, Nuno; Jorge, Joaquim A.; Lopes, Daniel S.. "The Underrated Dimension: How 3D Interactive Mammography Can Improve Breast Visualization". 2017.
    10.1007/978-3-319-68195-5_36
  6. Polat, Adem; Matela, Nuno; Mota, Ana M.; Yildirim, Isa. "Implementation of majorization-minimization (MM) algorithm for 3D total variation minimization in DBT image reconstruction". 2016.
    Publicado • 10.1109/nssmic.2016.8069493
  7. Mota, Ana M.; Oliveira, Nuno; Matela, Nuno. "3D Total Variation Minimization Filter for Breast Tomosynthesis Imaging". Trabalho apresentado em IWDM 2016, Malmo, 2016.
    Publicado • 10.1007/978-3-319-41546-8_63
  8. Mota, A.M.; Matela, N.; Oliveira, N.; Almeida, P.. "An iterative algorithm for total variation minimization in DBT imaging". 2016.
    10.1201/b19241-21
  9. Mota, Ana M.; Matela, Nuno; Oliveira, Nuno; Almeida, Pedro. "An iterative algorithm for Total Variation minimization in DBT imaging". Trabalho apresentado em VipIMAGE 2015, Tenerife, 2015.
    Publicado
Artigo em revista
  1. Marta Arsénio; Ricardo Vigário; Mota, Ana M.. "Recovering Image Quality in Low-Dose Pediatric Renal Scintigraphy Using Deep Learning". Journal of Imaging (2025):
    Aceite para publicação
  2. Manon A. G. Bakker; Maria de Lurdes Ovalho; Nuno Matela; Ana M. Mota. "Decoding Breast Cancer: Using Radiomics to Non-Invasively Unveil Molecular Subtypes Directly from Mammographic Images". Journal of Imaging (2024): https://doi.org/10.3390/jimaging10090218.
    10.3390/jimaging10090218
  3. Ana M. Mota; João Mendes; Nuno Matela. "Breast Cancer Molecular Subtype Prediction: A Mammography-Based AI Approach". Biomedicines (2024): https://doi.org/10.3390/biomedicines12061371.
    10.3390/biomedicines12061371
  4. Mota, Ana M.; João Mendes; Matela N. Autor correspondente: Mota, Ana M.. "Digital Breast Tomosynthesis: Towards Dose Reduction through Image Quality Improvement". Journal of Imaging 9 6 (2023): 119-119. http://dx.doi.org/10.3390/jimaging9060119.
    10.3390/jimaging9060119
  5. Mota, Ana M.; Matthew J. Clarkson; Pedro Almeida; Nuno Matela. "Automatic Classification of Simulated Breast Tomosynthesis Whole Images for the Presence of Microcalcification Clusters Using Deep CNNs". Journal of Imaging (2022): https://doi.org/10.3390/jimaging8090231.
    10.3390/jimaging8090231
  6. Mota, Ana M.; Clarkson, Matthew J.; Almeida, Pedro; Matela, Nuno. Autor correspondente: Mota, Ana M.. "An Enhanced Visualization of DBT Imaging Using Blind Deconvolution and Total Variation Minimization Regularization". IEEE Transactions on Medical Imaging 39 12 (2020): 4094-4101. http://dx.doi.org/10.1109/tmi.2020.3013107.
    10.1109/tmi.2020.3013107
  7. Mota, Ana M.; Clarkson, M.J.; Almeida, P.; Peralta, L.; Matela, N.. "Impact of total variation minimization in volume rendering visualization of breast tomosynthesis data". Computer Methods and Programs in Biomedicine 195 (2020): 105534. http://dx.doi.org/10.1016/j.cmpb.2020.105534.
    10.1016/j.cmpb.2020.105534
  8. Mota, Ana M.; Clarkson, Matthew J.; Almeida, Pedro; Matela, Nuno. "Optimization of Breast Tomosynthesis Visualization through 3D Volume Rendering". Journal of Imaging 6 7 (2020): 64. http://dx.doi.org/10.3390/jimaging6070064.
    10.3390/jimaging6070064
  9. Oliveira, N.; Mota, Ana M.; Matela, N.; Janeiro, L.; Almeida, P.. "Dynamic relaxation in algebraic reconstruction technique (ART) for breast tomosynthesis imaging". Computer Methods and Programs in Biomedicine 132 (2016): 189-196. http://dx.doi.org/10.1016/j.cmpb.2016.05.001.
    10.1016/j.cmpb.2016.05.001
  10. Mota, Ana M.; Matela, Nuno; Oliveira, Nuno; Almeida, Pedro. "Total variation minimization filter for DBT imaging". Medical Physics 42 6Part1 (2015): 2827-2836. http://dx.doi.org/10.1118/1.4919680.
    10.1118/1.4919680
Capítulo de livro
  1. Mota, A.M.; Almeida, P.; Mátela, N.. "Digital breast tomosynthesis: A review of population-based screening/clinical trials". 25-74. 2016.
Resumo em conferência
  1. Marta Arsénio; Ricardo Vigário; Mota, Ana M.. "Total variation filter in dose reduction by improving image quality in Pediatric Scintigraphy". Trabalho apresentado em 37th Annual Congress of the European Association of Nuclear Medicine, 2024.
    Publicado
  2. Mota, Ana M.; Schott, Jonathan; Cuplov, Vesna; Hutton, Brian; Thielemans, Kris; Drobnjak, Ivana; Dickson, John; et al. "Establishment of an open database of realistic simulated data for evaluation of partial volume correction techniques in brain PET/MR". Trabalho apresentado em 4th PSMR Conference on PET/MR and SPECT/MR, Ilha de Elba, 2015.
    Publicado • 10.1186/2197-7364-2-s1-a44

Propriedade Intelectual

Pedido provisório de patente
  1. 2025. "GastroNet".
    Protegido
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2023 Advanced medical imaging tools to improve cancer detection and reduce radiation dose to the patients Physics Department seminars
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências (Portugal)
2021 Breast Imaging Processing with Tomosynthesis New Technologies in Diagnosis and Radiation Therapy (Seminar)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências (Portugal)
2019 Advances in medical imaging (breast tomosynthesis and PET-MRI) Seminar on the Master's Degree in Radiation Applied to Health Technologies
Escola Superior de Tecnologia da Saúde de Lisboa - Instituto Politécnico de Lisboa (Portugal)
2018 Breast imaging with Tomosynthesis New Technologies in Diagnosis and Radiation Therapy (Seminar)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências (Portugal)
2015 An iterative algorithm for Total Variation minimization in DBT imaging 5th Eccomas Thematic Conference on Computational Vision and Medical Image Processing
(Tenerife, Espanha)
2012 TRS 457 Dosimetry in Diagnostic Radiology: An International Code of Practice Seminar of Medical Physics Unit of the Radiotherapy Service
Hospital de Santa Maria (Lisboa, Portugal)

Orientação

Título / Tema
Papel desempenhado 		Curso (Tipo)
Instituição / Organização
2024 - Atual AI-assisted data analysis and reports for the Linac commission
Orientador
 MSc in Engineering Physics (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2024 - Atual Breast cancer subtype prediction based on AI and tomosynthesis images
Orientador
 MSc in Biomedical Engineering and Biophysics (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2024/02/01 - 2024/12/04 Reducing administered activity by improving image quality in pediatric scintigraphy
Orientador
 Engenharia Biomédica (Mestrado)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2024/03/01 - 2024/07/10 Extracting relevant radiomic features from mammogram images associated with molecular subtypes of breast cancer
Orientador
 Master (Mestrado)
Rijksuniversiteit Groningen Faculty of Science and Engineering, Países Baixos

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação) 		Instituição / Organização
2024 - Atual IBEB's Open Day (2024)
Exposição (Membro da Comissão Organizadora)
 Universidade de Lisboa Instituto de Biofísica e Engenharia Biomédica, Portugal
2018/02/22 - 2018/02/22 PhD Conference of Physics Department (2018/02 - 2018/02) Universidade de Lisboa, Portugal
2017/05 - 2017/05 MR-PET School at PSMR2017 (Conference on PET-MRI and SPECT-MRI) (Member of the organizing committee) (2017/05/27)
Oficina (workshop) (Membro da Comissão Organizadora)
2017 - 2017 6th Conference on PET-MRI and SPECT-MRI: PSMR 2017 (2017 - 2017)
Conferência (Membro da Comissão Organizadora)

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento 		Nome do evento
Instituição / Organização
2024 - 2024 Objective Evaluation of Oral Presentations (teacher training course)
Universidade de Lisboa, Portugal
2022 - 2022 Welcoming New Teachers and Researchers (workshop)
Oficina (workshop)
Universidade de Lisboa, Portugal
2019/09/16 - 2019/09/20 5th International School on Imaging with Medical Applications - SSIMA 2019
Universitatea Politehnica din Bucure¿ti, Roménia
2015/04/27 - 2015/04/30 2nd International Training School on PET-MRI Engineering
European Cooperation in Science and Technology Action TD1007, Reino Unido
2015/03/04 - 2015/03/08 27th European Congress of Radiology
European Society of Radiology, Áustria
2013/11/07 - 2013/11/09 1st National Meeting of Medical Physics and Biomedical Engineering
Sociedade Portuguesa de Física, Portugal
2013/04/30 - 2013/04/30 Radiobiology (curricular unit)
Universidade de Lisboa Instituto de Medicina Molecular, Portugal
2012/11/23 - 2012/11/24 Ethics and Scientific Integrity (advanced course)
Centro Académico de Medicina de Lisboa, Portugal
2012/11/16 - 2012/11/16 Metrology of Ionizing Radiation and Clinical Applications (workshop)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Tecnico Campus Tecnológico e Nuclear, Portugal
2012/11/10 - 2012/11/10 Detectors for Hadrontherapy and Related Medical Aspects (short course)
Laboratório de Instrumentação e Física Experimental de Partículas, Portugal

Centro Hospitalar Lisboa Norte EPE, Portugal
2012/09/26 - 2012/10/27 Applied Biostatistics (advanced course)
Centro Académico de Medicina de Lisboa, Portugal
2012/05/30 - 2012/06/01 Launching your research career: complementary skills training (advanced course)
Centro Académico de Medicina de Lisboa, Portugal
2010/07/05 - 2010/07/16 Leadership Course
Academia Militar, Portugal
2009/10/26 - 2009/10/29 Nuclear Magnetic Resonance Course
Oficina (workshop)
CEFITEC FCT/UNL, Portugal

Júri de grau académico

Tema
Tipo de participação 		Nome do candidato (Tipo de grau)
Instituição / Organização
2025/02/28 Developing a novel dashboard to detect and monitor lung cancer cachexia
Arguente principal
 Sara Isabel Silva Manso (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2024/03/11 Mechanical Design of a Poly-articulated Prosthetic Hand
Presidente do júri
 Beatriz Mocinho Rodrigues (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2024/02/14 Machine Learning Algorithm for the prediction of the direction of growth of Macular Neovascularization
Presidente do júri
 João Pedro Candeias da Silva Santos (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2024 Machine Learning for Knee Contact Force Prediction
Presidente do júri
 Daniel da Costa Simão (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2024 Assessing the Aftereffects of Closed-Loop Amplitude Modulated Transcranial Alternating Current Stimulation on Parieto-Occipital Alpha Oscillations
Presidente do júri
 Teresa Meireles Carneiro (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2024 Work-related Upper Body Postures Classification and Segmentation
Presidente do júri
 Diogo Sózinho (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2023 Comparison of different image reconstruction algorithms for Digital Breast Tomosynthesis and assessment of their potential to reduce radiation dose
Arguente principal
 Raquel Silva Diogo (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2023 Reconstruction of Microwave Imaging using Machine Learning
Presidente do júri
 Catarina Moura (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2023 Medical Microwave Imaging of MRI-based Axillary region models via 3D Finite Difference Time Domain modelling
Presidente do júri
 Pedro Cidadão (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2023 Development of an upper limb exoskeleton digital twin in immersive virtual reality
Presidente do júri
 Tiago Manuel Cortes Lomba (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2023 Investigating suitable strategies to detect the lack of balance due to different external perburbations based on wearable sensors
Presidente do júri
 Ana Maria Vieira De Almeida (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2023 Targeted tDCS in Sensorimotor Networks: A Functional Connectivity Study
Presidente do júri
 Vasco Fontes Marques Da Silva (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2023 Assessing Brain Functional Connectivity in Parkinson’s Disease using Explainable Artificial Intelligence Methods
Vogal
 Leonor Maria Oliveira Pires (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2023 Automatic detection and segmentation of malignant lesions from [18F]FDG PET/CT images using machine learning techniques: application in lymphomas
Presidente do júri
 Miriam Norinha Gomes Sobral (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2023 Validation of manual brain lesion tracing methods in clinical neuroscience
Presidente do júri
 Catarina Maria Inácio Fonseca (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Arbitragem científica em conferência

Nome da conferência Local da conferência
2024/11 - 2025/01 BIOIMAGING 2025, the 12th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies.
2024 - 2024 Reviewer for the 27th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, MICCAI 2024
2023 - 2023 Reviewer for the 26th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, MICCAI 2023

Arbitragem científica em revista

Nome da revista (ISSN) Editora
2021/03 - Atual Academic Radiology Elsevier
2021 - Atual Frontiers in Oncology| Radiation Oncology (Member of Editorial Board as Review Editor) FRONTIERS MEDIA
2025/03 - 2025/12 Cancers | Guest Editor for the Special Issue "Advances in Breast Cancer Imaging: From Detection to Personalized Diagnosis" MDPI

Comissão de avaliação

Descrição da atividade
Tipo de assessoria 		Instituição / Organização Entidade financiadora
2024 - 2024 Member of the Jury for the selection of candidates for a Research Fellowship (project "DC4MND - Multidimensional mechanistic investigations of trans spinal direct current stimulation in motorneuron disease")
Membro
 FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal Fundação para a Ciência e a Tecnologia

Membro de associação

Nome da associação Tipo de participação
2024 - Atual International Cancer Imaging Society Member
2011 - Atual Medical Physics Division of the Portuguese Physics Society Member

Membro de comissão

Descrição da atividade
Tipo de participação 		Instituição / Organização
2025/03 - Atual Member of the Oncology working group at RedeSAÚDE, University of Lisbon
Membro
 Universidade de Lisboa, Portugal
2024/09 - Atual Member of the Pedagogical Committee for the BSc degree in Biomedical Engineering and Biophysics of the Faculty of Sciences of the University of Lisbon
Membro
 Universidade de Lisboa, Portugal
2016/09/01 - 2020 Pedagogical Commission of PhD Program in Biomedical Engineering and Biophysics (Representative of the PhD students) Universidade de Lisboa, Portugal

Revisão ad hoc de artigos em revista

Nome da revista (ISSN) Editora
2025/02 - Atual European Journal of Medical Research Springer Nature
2025/02 - Atual BMC Pregnancy and Childbirth Springer Nature
2025/02 - Atual Journal of Medical Imaging SPIE
2024 - Atual Computers in Biology and Medicine Elsevier
2024 - Atual Journal of Imaging Informatics in Medicine
2025/02 - 2025/02 Scientific Reports Springer Nature
2025/02 - 2025/02 Diagnostics MDPI
2018 - 2018 IEEE Transactions on Medical Imaging Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE)
2017 - 2017 Journal of X-Ray Science and Technology IOS Press

Tutoria

Tópico Nome do aluno
2016 - Atual Implementation of majorization-minimization (MM) algorithm for 3D total variation minimization in DBT image reconstruction Adem Polat
2023 - 2034 LOTUS band Joana Carvoerio, Ana Costa, Sara Fontoura, Hugo Vieira
2023 - 2023 ASSENCIS: Catheter & Protection System Cassandra Gouveia; Marta Monteiro; Mariana Peixoto; Margarida Pedrosa; Bianca Alves
2022 - 2022 Automatic classification of masses and MC's by deep CNN's using whole DBT images Noa Hoogeweg
Distinções

Prémio

2024 2nd place in the H-INNOVA Digital Health Summit Call for Projects competition in the student category with their projec
H-INNOVA - Health Innovation HUB, Portugal
2024 Biomedicines Travel Award
Biomedicines MDPI, Suiça
2023 Finalist of the 4th edition of H-INNOVA HUB 2023
Universidade da Madeira, Portugal
2015 Best Student Paper Award
2014 Best poster presentation