Rita Gonçalves Sobral de Almeida (7F1F-7412-A2C3)

Curriculum Vitae

Rita Gonçalves Sobral de Almeida

As molecular microbiologist, and head of the Lab of Molecular Microbiology of Bacterial Pathogens (MolMicro) at UCIBIO since 2015, I developed strong expertise in molecular biology, S. aureus mutant construction, transcriptomic and genomic approaches, protein-protein interactions, cell wall and membrane analysis. The MolMicro lab studies S. aureus mechanisms of antibiotic resistance, cell wall physiology, biofilm formation, interspecies and host-pathogen interactions. I am also assistant Professor since 2015 at FCT NOVA, responsible for the subjects ¿Methods in Molecular Biology¿, ¿Applied Microbiology¿ and ¿Biofilms in chronic infections¿ in which I lecture over 100 undergraduate and Msc students, yearly. After a degree in Biotechnology, I obtained my Ph.D. in Molecular Biology (ITQB-NOVA) in 2006. I was invited researcher at the Lab of Professor Alexander Tomasz, expert in S. aureus cell wall, at Rockefeller University (NY) from 2002 to 2007. I was twice (2011 and 2015) awarded a young investigator research grant by the European Society of Clinical Microbiology and Infectious diseases (ESCMID). Since then, I was PI of 2 research grants and co-PI of 2 other, at National competitive calls and team member of over 10 financed projects. During the last decade I established collaborations with over 15 national and overseas research groups, in fundamental and complementary fields, and experts on S. aureus antibiotic resistance. All these collaborations are ongoing, some already resulted in published works and most in co-supervision of PhD or Msc students. I supervised 3 post-docs, 11 PhD Theses (5 ongoing), 27 Msc Theses (4 ongoing), 7 visiting students (COST, H2020 RISE, Erasmus) and over 40 undergraduates. I published 40 peer-reviewed papers (h-index:17, scopus; 20 Scholars), some in high impact journals (Nat Microbiol, PLOS Path, PLOS Gen, AAC,), 8 conference proceedings, over 40 oral and 60 poster communications. I am currently Academic Editor for PLOS One and evaluator of Research Grants and Post-doctoral fellowships for the Swiss National Foundation (SNF).

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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo: Rita Gonçalves Sobral de Almeida
Género: Feminino

Nomes de citação

Rita G. Sobral

Identificadores de autor

Ciência ID: 7F1F-7412-A2C3
ORCID iD: 0000-0003-4533-7531

Endereços de correio eletrónico

rgs@fct.unl.pt (Profissional)

Moradas

Departamento de Ciências da Vida,. Faculdade de Ciências e Tecnologia, Universidade Nova de Lisboa, Quinta da Torre, 2829-516 , Caparica, Almada, Portugal (Profissional)

Websites

https://ucibio.pt/people/rita-sobral (Académico)

Domínios de atuação

Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia Molecular

Idiomas

Idioma	Conversação	Leitura	Escrita	Compreensão	Peer-review
Inglês	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C1)
Francês	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)
Espanhol; Castelhano	Utilizador elementar (A1)	Utilizador independente (B1)		Utilizador elementar (A1)
Italiano	Utilizador elementar (A1)	Utilizador independente (B1)		Utilizador elementar (A1)

Formação

	Grau	Classificação
2006 Concluído	Doutoramento em Ciências Biológicas (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal "Modulating Staphylococcus aureus cell physiology through a murein ligase" (TESE/DISSERTAÇÃO)	Aprovado por unanimidade
1998 Concluído	Química Aplicada (Licenciatura) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal "Stress response related genes in gram-positive bacteria" (TESE/DISSERTAÇÃO)	15

Percurso profissional

Ciência

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2010/12/30 - 2014/12/31	Investigador (Investigação)	Centro de Recursos Microbiológicos, CREM, Portugal

Docência no Ensino Superior

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2015/08/01 - Atual	Professor Auxiliar (Docente Universitário)	Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal

Outros

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2023/01/01 - Atual	Coordinator of the Master in Medical Microbiology	Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal

2015/01/01 - Atual	Assistant Researcher - Head of the Laboratory of Molecular Microbiology of Bacterial Pathogens	Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal

2013/09/01 - 2013/11/01	Invited Professor - Mestrado integrado em Genética Molecular e Biomedicina	Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal

2012/02/01 - 2012/07/31	Invited Professor - Mestrado integrado em Engenharia do Ambiente e Engenharia Química e Bioquímica.	Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal

2006/12/01 - 2010/12/30	Post-doctoral fellow	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal

2010/03/01 - 2010/08/31	Invited Adjunct Professor - Responsible for the Biochemistry Curricular Unit (Licenciatura em Engenharia Química)	Instituto Politécnico de Setúbal Escola Superior de Tecnologia do Barreiro, Portugal

2001/01/01 - 2006/11/22	Visiting PhD student - Laboratory of Microbiology (PI: A. Tomasz)	The Rockefeller University, Estados Unidos

2001/01/01 - 2006/11/22	PhD Student - Laboratory of Molecular Genetics (PI: H. de Lencastre)	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal

1997/10/01 - 2000/12/31	Research student - Fellowship IBET 1999 and fellowship ITQB 2000	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal

1996/07/01 - 1996/09/30	Erasmus Research trainee	Bangor University School of Electronic Engineering, Reino Unido

Projetos

Bolsa

	Designação	Financiadores
2007/01/01 - 2010/05/01	A NEW STAPHYLOCOCCAL DCW ISLAND CARRYING MURF, DDLA AND A FTSW/RODA HOMOLOG: ROLES IN CELL WALL SYNTHESIS, CELL DIVISION AND DRUG RESISTANCE SFRH/BPD/28760/2006 Bolseiro de Pós-Doutoramento Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2001/01/01 - 2005/01/01	Modulating Staphylococcus aureus cell physiology through a murein ligase SFRH/BD/3138/2000 Bolseiro de Doutoramento Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído

Projeto

	Designação	Financiadores
2022/01/01 - Atual	DIGIAqua – Digitalizando a Aquacultura: da análise preditiva à plataforma fotónica inteligente PTDC/EEI-EEE/0415/2021 Investigador Universidade de Aveiro, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Em curso
2022/01/01 - Atual	PROTEIOS - Protein Tunable Materials for Non-Invasive Sensing PTDC/CTM-CTM/3389/2021 Investigador REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Em curso
2018/10/01 - Atual	StaphOUT - Fighting Staphylococcus aureus - Peptidoglycan amidation as a new target PTDC/BIA-MIC/31645/2017 Investigador responsável REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Em curso
2021/01/01 - 2025/12/31	Instituto para a Saúde e a Bioeconomia LA/P/0140/2020 10.54499/LA/P/0140/2020 Investigador responsável Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento, Portugal Universidade de Lisboa Instituto de Bioengenharia e Biociências, Portugal Universidade NOVA de Lisboa, Portugal INESC Microsistemas e Nanotecnologias, Portugal Rede de Química e Tecnologia Laboratório Associado para a Química Verde, Portugal Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Em curso
2020/01/01 - 2023/12/31	Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas UIDB/04378/2020 10.54499/UIDB/04378/2020 Investigador responsável Universidade NOVA de Lisboa, Portugal Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal Rede de Química e Tecnologia Laboratório Associado para a Química Verde, Portugal Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal Universidade do Porto, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2020/01/01 - 2023/12/31	Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas UIDP/04378/2020 10.54499/UIDP/04378/2020 Investigador responsável Universidade NOVA de Lisboa, Portugal Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal Rede de Química e Tecnologia Laboratório Associado para a Química Verde, Portugal Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal Universidade do Porto, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2016/01 - 2019/12	NANOMATERIALS-BASED INNOVATIVE ENGINEERING SOLUTION TO ENSURE SUSTAINABLE SAFEGUARD TO INDOOR AIR grant.690968 Investigador	European Commission
2015/01/01 - 2019/04/30	Microfluidics Liquid Crystal Based Bifuncional Bacterial Infeccion Sensor PTDC/FIS-NAN/0117/2014 Investigador responsável REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2017/01 - 2017/12	Copper tolerance in Enterococcus faecium: unveiling the activity of a multicopper oxidase encoded by cueO gene and its gene transfer to Staphylococcus aureus 0000	Concluído
2013/07/01 - 2017/01/01	Amidation of the peptidoglycan of Gram-positive bacteria: an unexplored potential target for antibiotics PTDC/BIA-MIC/3195/2012 Investigador Centro de Recursos Microbiológicos, CREM, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2011/01/01 - 2013/12/31	Association of extracellular DNA to the Staphylococcus aureus surface: roles and mechanisms ESCMID project Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal	Concluído
2010/01/01 - 2013/06/30	Metabolic circuits in inflicted bacterial cell death PTDC/BIA-MIC/101375/2008 Investigador responsável Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2009 - 2012	Community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus (CA-MRSA) in Portugal: a pilot study focusing on an emerging public health concern Ref. P-99911 Investigador Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal	Fundação Calouste Gulbenkian Concluído
2008 - 2010	Regulatory networks on Staphylococcus aureus cell wall physiology POCTI/BIA-MIC/71168/2006 Investigador Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2005 - 2008	Regulation of cell wall synthetic genes and enzymes in beta-lactam resistant Staphylococcus aureus POCTI/BIA-MIC/58416/2004 Bolseiro de Investigação Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2001 - 2004	Functional Genomics and High Resolution Molecular Typing of Methicillin Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) FCG/47187 Bolseiro de Investigação Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal	Fundação Calouste Gulbenkian Concluído
2000 - 2004	Molecular evolution and molecular epidemiology of methicillin resistance in Staphylococcus aureus POCTI/ESP/34872/1999 Investigador Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
1997 - 1998	Stress response genes in gram-positive cocci PRAXIS XXI 2/2.1/BIO/1154/95 Bolseiro de Iniciação Científica Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído

Outro

	Designação	Financiadores
2019/10/01 - Atual	Cost Action 18238 - Ocean4Biotech Cost Action 18238 Investigador REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal	Horizon 2020 Em curso

Produções

Publicações

Artigo em conferência	Portela, R.; P.L. Almeida; Rita G. Sobral; C.R. Leal. "S. aureus and E. coli co-culture growth under shear". Trabalho apresentado em 7th Iberian Meeting on Rheology 2019 (IbeReo2019), Porto, 2019. Fernandes A.F.; L. Costa; J.R. Sousa; J. Zalocha; I.R. Grilo; Rita G. Sobral; S.P. Gaudencio; M.G. Almeida. "Biological activities of marine-derived actinomycetes: testing the aqueous extracellular phase of Streptomyces aculeolatus". Trabalho apresentado em 3rd International Congress of CiiEM Research and Innovation in Human and Health Sciences, 2019. Portela, R.; Franco, J.M.; Almeida, P.L.; Patrício, P.; Sobral, R.G.; Leal, C.R.. "Rheology of living cells". 2019. 10.1109/ENBENG.2019.8692466 Portela, R.; J.M. Franco; P. Patrício; P.L. Almeida; Rita G. Sobral; C.R. Leal. "Rotational and translational motion observed in Escherichia coli aggregates during shear". 2017. Portela, R.; J.M. Franco; P. Patrício; P.L. Almeida; Rita G. Sobral; C.R. Leal. "Living S. aureus bacteria rheology". Trabalho apresentado em XVIIth International Congress on Rheology (ICR2016), 2016. Franco, J.M.; P. Patricio; P.L. Almeida; R. Portela; Rita G. Sobral; C.R. Leal. "Cell necklaces behave as a soft glassy material". Trabalho apresentado em Proceedings of IbeReo2015, Coimbra, 2015. Portela, R.; P.L. Almeida; P. Patricio; T. Cidade; Rita G. Sobral; C.R. Leal. "Staphylococcus aureus strains rheology during growth". Trabalho apresentado em Ibereo 2013, Malaga, 2013. Portela, R.; M. Pereira; Rita Sobral; P.L. Almeida; C.R. Leal. "Bacterial growth screened by rheology.". Trabalho apresentado em Ibereo 2011 Conference - “Rheology trends: from nano to macro systems”, Caparica, 2011.
Artigo em revista	Selvi C. Ersoy; Richard A. Proctor; Warren E. Rose; Wessam Abdelhady; Sook-Ha Fan; Sabrina L. Madrigal; Ahmed M. Elsayed; et al. "Sensitizing methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) to cefuroxime: the synergic effect of bicarbonate and the wall teichoic acid inhibitor ticlopidine". Antimicrobial agents chemotherapy (2024): Aceite para publicação Soares, Maria Simone; Sobral, Rita Gonçalves; Santos, Nuno; Marques, Carlos; Almeida, Pedro Lúcio. "Liquid Crystal-based Immunosensor for the Optical Detection of Escherichia coli at Low Concentration Levels". IEEE Sensors Journal (2024): 1-1. http://dx.doi.org/10.1109/jsen.2024.3354057. Aceite para publicação • 10.1109/jsen.2024.3354057 Despoina Varamogianni-Mamatsi; Maria João Nunes; Vanda Marques; Thekla I. Anastasiou; Eirini Kagiampaki; Emmanouela Vernadou; Thanos Dailianis; et al. "Comparative Chemical Profiling and Antimicrobial/Anticancer Evaluation of Extracts from Farmed versus Wild Agelas oroides and Sarcotragus foetidus Sponges". Marine Drugs (2023): https://www.mdpi.com/1660-3397/21/12/612. 10.3390/md21120612 Marta Catalão; Mafalda Fernandes; Lorena Galdon; Clara F. Rodrigues; Rita G. Sobral; Susana P. Gaudêncio; Cristiana A. V. Torres. "Exopolysaccharide Production from Marine-Derived Brevundimonas huaxiensis Obtained from Estremadura Spur Pockmarks Sediments Revealing Potential for Circular Economy". Marine Drugs (2023): https://doi.org/10.3390/md21070419. 10.3390/md21070419 Sara Valente; Filipe Oliveira; Inês João Ferreira; Alexandre Paiva; Rita G. Sobral; Mário S. Diniz; Susana P. Gaudêncio; Ana Rita Cruz Duarte. "Hydrophobic DES Based on Menthol and Natural Organic Acids for Use in Antifouling Marine Coatings". ACS Sustainable Chemistry & Engineering (2023): https://doi.org/10.1021/acssuschemeng.3c01120. 10.1021/acssuschemeng.3c01120 Juliana Oliveira; Pedro L. Almeida; Rita G. Sobral; Nídia D. Lourenço; Susana P. Gaudêncio. "Marine-Derived Actinomycetes: Biodegradation of Plastics and Formation of PHA Bioplastics¿A Circular Bioeconomy Approach". Marine Drugs (2022): https://doi.org/10.3390/md20120760. 10.3390/md20120760 Selvi C. Ersoy; Barbara Gonçalves; Gonçalo Cavaco; Adhar C. Manna; Rita G. Sobral; Cynthia C. Nast; Richard A. Proctor; et al. "Influence of Sodium Bicarbonate on Wall Teichoic Acid Synthesis and ß-Lactam Sensitization in NaHCO 3 -Responsive and Nonresponsive Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus". Microbiology Spectrum (2022): https://doi.org/10.1128/spectrum.03422-22. 10.1128/spectrum.03422-22 Raquel Portela; Nuno A. Faria; Michael Mwangi; Maria Miragaia; Hermínia de Lencastre; Alexander Tomasz; Rita Gonçalves Sobral; Joanna B. Goldberg. "Analysis of a Cell Wall Mutant Highlights Rho-Dependent Genome Amplification Events in Staphylococcus aureus". Microbiology Spectrum (2022): https://doi.org/10.1128/spectrum.02483-21. 10.1128/spectrum.02483-21 Inês Silvestre; Vítor Borges; Sílvia Duarte; Nunes, Alexandra; Rita Sobral; Luís Vieira; João Paulo Gomes; Maria José Borrego. "Global gene expression analysis of Streptococcus agalactiae at the exponential growth phase". Cellular and Molecular Biology 68 7 (2022): 1-8. http://dx.doi.org/10.14715/cmb/2022.68.7.1. 10.14715/cmb/2022.68.7.1 Almeida, A.P.C.; Saraiva, J.N.; Cavaco, G.; Portela, R.P.; Leal, C.R.; Sobral, R.G.; Almeida, P.L.. "Crosslinked bacterial cellulose hydrogels for biomedical applications". European Polymer Journal 177 (2022): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85134886920&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.eurpolymj.2022.111438 António Pinto Almeida; Anelize Bauermeister; Luca Luppino; Inês R. Grilo; Juliana Oliveira; Joana R. Sousa; Daniel Petras; et al. "The Diversity, Metabolomics Profiling, and the Pharmacological Potential of Actinomycetes Isolated from the Estremadura Spur Pockmarks (Portugal)". Marine Drugs (2021): https://www.mdpi.com/1660-3397/20/1/21. 10.3390/md20010021 Florbela Pereira; Joana R. Almeida; Marisa Paulino; Inês R. Grilo; Helena Macedo; Isabel Cunha; Rita G. Sobral; Vitor Vasconcelos; Susana P. Gaudêncio. "Antifouling Napyradiomycins from Marine-Derived Actinomycetes Streptomyces aculeolatus". Marine Drugs 18 1 (2020): 63-63. https://doi.org/10.3390/md18010063. 10.3390/md18010063 Pereira, F.; Figueiredo, T.; de Almeida, R.F.M.; Antunes, C.A.C.; Garcia, C.; Reis, C.P.; Ascensão, L.; Sobral, R.G.; Rijo, P.. "Unveiling the mechanism of action of 7a-acetoxy-6ß-hydroxyroyleanone on an mrsa/visa strain: Membrane and cell wall interactions". Biomolecules 10 7 (2020): 1-17. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85087344220&partnerID=MN8TOARS. 10.3390/biom10070983 Portela, R.; Valcovo, F.; Almeida, P.L.; Sobral, R.G.; Leal, C.R.. "Antibiotic Activity Screened by the Rheology of S. aureus Cultures". Fluids 5 2 (2020): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85085998230&partnerID=MN8TOARS. 10.3390/fluids5020076 Bárbara V. Gonçalves; Raquel Portela; Ricardo Lobo; Teresa A. Figueiredo; Inês R. Grilo; Ana Madalena Ludovice; Hermínia de Lencastre; Jorge S. Dias; Rita G. Sobral. "Role of MurT C-Terminal Domain in the Amidation of Staphylococcus aureus Peptidoglycan". Antimicrobial Agents and Chemotherapy (2019): https://doi.org/10.1128/AAC.00957-19. 10.1128/AAC.00957-19 Portela, Raquel; Leal, Catarina R.; Almeida, Pedro L.; Sobral, Rita G.. "Bacterial cellulose: a versatile biopolymer for wound dressing applications". Microbial Biotechnology 12 4 (2019): 586-610. http://dx.doi.org/10.1111/1751-7915.13392. 10.1111/1751-7915.13392 Maugeri, G.; Lychko, I.; Sobral, R.; Roque, A.C.A.. "Identification and Antibiotic-Susceptibility Profiling of Infectious Bacterial Agents: A Review of Current and Future Trends". Biotechnology Journal 14 1 (2019): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85052470675&partnerID=MN8TOARS. 10.1002/biot.201700750 Reichmann, N.T.; Tavares, A.C.; Saraiva, B.M.; Jousselin, A.; Reed, P.; Pereira, A.R.; Monteiro, J.M.; et al. "SEDS–bPBP pairs direct lateral and septal peptidoglycan synthesis in Staphylococcus aureus". Nature Microbiology 4 8 (2019): 1368-1377. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85065766105&partnerID=MN8TOARS. 10.1038/s41564-019-0437-2 Sobral, R.; Tomasz, A.. "The staphylococcal cell wall". Microbiology Spectrum 7 4 (2019): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85070089993&partnerID=MN8TOARS. 10.1128/microbiolspec.GPP3-0068-2019 Espadinha, D.; Sobral, R.G.; Mendes, C.I.; Méric, G.; Sheppard, S.K.; Carriço, J.A.; Lencastre, H.; Miragaia, M.. "Distinct phenotypic and genomic signatures underlie contrasting pathogenic potential of staphylococcus epidermidis clonal lineages". Frontiers in Microbiology 10 AUG (2019): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85071949780&partnerID=MN8TOARS. 10.3389/fmicb.2019.01971 Portela, R.; Almeida, P.L.; Sobral, R.G.; Leal, C.R.. "Motility and cell shape roles in the rheology of growing bacteria cultures". European Physical Journal E 42 3 (2019): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85062224223&partnerID=MN8TOARS. 10.1140/epje/i2019-11787-9 Bauermeister, A.; Pereira, F.; Grilo, I.R.; Godinho, C.C.; Paulino, M.; Almeida, V.; Gobbo-Neto, L.; et al. "Intra-clade metabolomic profiling of MAR4 Streptomyces from the Macaronesia Atlantic region reveals a source of anti-biofilm metabolites". Environmental Microbiology 21 3 (2019): 1099-1112. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85062889469&partnerID=MN8TOARS. 10.1111/1462-2920.14529 Harrison, E.M.; Ba, X.; Coll, F.; Blane, B.; Restif, O.; Carvell, H.; Köser, C.U.; et al. "Genomic identification of cryptic susceptibility to penicillins and ß-lactamase inhibitors in methicillin-resistant Staphylococcus aureus". Nature Microbiology 4 10 (2019): 1680-1691. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85068179394&partnerID=MN8TOARS. 10.1038/s41564-019-0471-0 Leisico, Francisco; V. Vieira, Diana; Figueiredo, Teresa A.; Silva, Micael; Cabrita, Eurico J.; Sobral, Rita G.; Ludovice, Ana Madalena; et al. "First insights of peptidoglycan amidation in Gram-positive bacteria - the high-resolution crystal structure of Staphylococcus aureus glutamine amidotransferase GatD". Scientific Reports 8 1 (2018): http://dx.doi.org/10.1038/s41598-018-22986-3. 10.1038/s41598-018-22986-3 Joana Rita Gonçalves Araujo Rolo Mateus; Peder Worning; Jesper Boye Nielsen; Rita Sobral; Rory Bowden; Ons Bouchami; Peter Damborg; et al. "Evidence for the evolutionary steps leading to mecA-mediated ß-lactam resistance in staphylococci". PLoS Genetics 13 4 (2017): https://research.unl.pt/en/publications/evidence-for-the-evolutionary-steps-leading-to-mecamediated-lactam-resistance-in-staphylococci(ea431b4e-6ee9-4dd2-b0d2-b1055845d990).html. 10.1371/journal.pgen.1006674 Portela, R.; Patrício, P.; Almeida, P. L.; Sobral, R. G.; Franco, J. M.; Leal, C. R.. "Rotational tumbling of Escherichia coli aggregates under shear". Physical Review E 94 6 (2016): http://dx.doi.org/10.1103/physreve.94.062402. 10.1103/physreve.94.062402 R Portela; Pedro Patrício; P L Almeida; Rita Sobral; J. M. Franco; C R Leal. "Rotational tumbling of Escherichia coli aggregates under shear". Physical Review E 94 6 (2016): https://research.unl.pt/en/publications/rotational-tumbling-of-escherichia-coli-aggregates-under-shear(be1c1751-1c35-48da-a833-e20ffbfc6877).html. 10.1103/PhysRevE.94.062402 Filipa Siopa; Teresa Figueiredo; Raquel F. M. Frade; Iris Neto; Ana Meirinhos; Catarina P. Reis; Rita Sobral; Carlos A. M. Afonso; Patrícia Rijo. "Choline-Based Ionic Liquids". ChemistrySelect 1 18 (2016): 5909-5916. https://research.unl.pt/en/publications/cholinebased-ionic-liquids(808e811b-42da-46ed-a139-47d20399497e).html. 10.1002/slct.201600864 Patrício, P.; Almeida, P.L.; Portela, R.; Sobral, R.G.; Grilo, I.R.; Cidade, T.; Leal, C.R.. "Living bacteria rheology: Population growth, aggregation patterns, and collective behavior under different shear flows". Physical Review E - Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics 90 2 (2014): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84940331458&partnerID=MN8TOARS. 10.1103/PhysRevE.90.022720 Vieira, D.; Figueiredo, T.A.; Verma, A.; Sobral, R.G.; Ludovice, A.M.; De Lencastre, H.; Trincao, J.. "Purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of GatD, a glutamine amidotransferase-like protein from Staphylococcus aureus peptidoglycan". Acta Crystallographica Section F:Structural Biology Communications 70 5 (2014): 632-635. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84905435586&partnerID=MN8TOARS. 10.1107/S2053230X14007298 Figueiredo, T.A.; Ludovice, A.M.; Sobral, R.G.. "Contribution of peptidoglycan amidation to beta-lactam and lysozyme resistance in different genetic lineages of staphylococcus aureus". 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Physical Review E - Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics 87 3 (2013): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84875496516&partnerID=MN8TOARS. 10.1103/PhysRevE.87.030701 Figueiredo, T.A.; Sobral, R.G.; Ludovice, A.M.; de Almeida, J.M.F.; Bui, N.K.; Vollmer, W.; de Lencastre, H.; Tomasz, A.. "Identification of genetic determinants and enzymes involved with the amidation of glutamic acid residues in the peptidoglycan of Staphylococcus aureus". PLoS Pathogens 8 1 (2012): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84857491427&partnerID=MN8TOARS. 10.1371/journal.ppat.1002508 Sobral, R.G.; Jones, A.E.; Des Etages, S.G.; Dougherty, T.J.; Peitzsch, R.M.; Gaasterland, T.; Ludovice, A.M.; De Lencastre, H.; Tomasz, A.. "Extensive and genome-wide changes in the transcription profile of Staphylococcus aureus induced by modulating the transcription of the cell wall synthesis gene murF". Journal of Bacteriology 189 6 (2007): 2376-2391. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-33947175462&partnerID=MN8TOARS. 10.1128/JB.01439-06 Sobral, R.G.; Ludovice, A.M.; De Lencastre, H.; Tomasz, A.. "Role of murF in cell wall biosynthesis: Isolation and characterization of a murF conditional mutant of Staphylococcus aureus". Journal of Bacteriology 188 7 (2006): 2543-2553. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-33645243418&partnerID=MN8TOARS. 10.1128/JB.188.7.2543-2553.2006 Gardete, S.; Ludovice, A.M.; Sobral, R.G.; Filipe, S.R.; De Lencastre, H.; Tomasz, A.. "Role of murE in the Expression of ß-Lactam Antibiotic Resistance in Staphylococcus aureus". Journal of Bacteriology 186 6 (2004): 1705-1713. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-1542317110&partnerID=MN8TOARS. 10.1128/JB.186.6.1705-1713.2004 Sobral, R.G.; Ludovice, A.M.; Gardete, S.; Tabei, K.; De Lencastre, H.; Tomasz, A.. "Normally functioning murF is essential for the optimal expression of methicillin resistance in Staphylococcus aureus". Microbial Drug Resistance 9 3 (2003): 231-241. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0041353701&partnerID=MN8TOARS. 10.1089/107662903322286436 De Lencastre, H.; Wu, S.W.; Pinho, M.G.; Ludovice, A.M.; Filipe, S.; Gardete, S.; Sobral, R.; et al. "Antibiotic resistance as a stress response: Complete sequencing of a large number of chromosomal loci in Staphylococcus aureus strain COL that impact on the expression of resistance to methicillin". Microbial Drug Resistance 5 3 (1999): 163-175. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0032755508&partnerID=MN8TOARS.
Capítulo de livro	Portela, R.; Almeida, P.L.; Sobral, R.G.; Leal, C.R.. "S. aureus and E. coli Co-culture Growth Under Shear". 108-112. 2020. 10.1007/978-3-030-27701-7_23 Sobral, R.; Tomasz, A.. "The staphylococcal cell wall". 574-591. 2019.
Poster em conferência	ARAÚJO, MARIANA; Faria, Nuno A.; Gonçalo, Margarida ; Nakonieczna, Joanna ; Torres, Carmen; Campanile, Floriana; Netto dos Santos, Katia; Rita G. Sobral; Miragaia, Maria. "Genomic profile of Staphylococcus aureus from Atopic Dermatitis collected worldwide". Trabalho apresentado em 34th European Congress of Clinical Microbiology & Infectious Diseases (34thECCMID), 2024. ARAÚJO, MARIANA; Faria, Nuno A.; Gonçalo, Margarida ; Nakonieczna, Joanna ; Torres, Carmen; Campanile, Floriana; Netto dos Santos, Katia; Rita G. Sobral; Miragaia, Maria. "Staphylococcus aureus from atopic dermatitis have specific genomic signatures". Trabalho apresentado em Microbiotec'23 - Congress of Microbiology and Biotechnology, 2023. Faria, Nuno A.; ARAÚJO, MARIANA; Joanna Nakonieczna; Rita G. Sobral; Miragaia, Maria. "Atopic Dermatitis microenvironment favours Staphylococcus aureus growth and promotes antibiotic resistance". Trabalho apresentado em Congress of Microbiology and Biotechnology 2023, 2023. Sequeira, AR; Portela, RP; Dias, J.S.; Rita G. Sobral. "Role of Skf system of Staphylococcus aureus in inter-species interactions". Trabalho apresentado em 2nd Microbiome PT Summit, 2023. Costa-Camilo, Eduardo; Rita G. Sobral; Pinheiro, Carla. "Antimicrobial and antioxidant activity of cork polar extractives". Trabalho apresentado em 2nd Microbiome PT Summit, 2023. Santos, A; Gonçalves, Inês; Rita G. Sobral; Sá-Nogueira, Isabel. "Characterization of a Type I ABC Transporter in Staphylococcus aureus". Trabalho apresentado em IV International Meeting of the Portuguese Society of Genetics, 2023. Cavaco, G.; Soares, SM; Grilo, Inês Ramos; Pina, AS; Roque, ACA; Marques, C; Miragaia, Maria ; Rita G. Sobral; Almeida, PL. "Liquid Crystal based bacterial infection biossensor". Trabalho apresentado em 28th International Liquid Crystal Conference (ILCC 2022), 2022. Cavaco G.; J. Saraiva; Portela, R.; C.R. Leal; R.G. Sobral; Almeida, P.L.. Autor correspondente: Almeida, P.L.. "Treating Burn Wounds With Bacterial Cellulose". Trabalho apresentado em 32nd European Congress of Clinical Microbiology & Infectious Diseases (ECCMID 2022), 2022. Cavaco G.; A.C. Fanico; Gonçalves, B.V.; N. Faria; M. Miragaia; R.G. Sobral. Autor correspondente: R.G. Sobral. "New factors of lysozyme resistance in Staphylococcus aureus associated with peptidoglycan amidation.". Trabalho apresentado em 32nd European Congress of Clinical Microbiology & Infectious Diseases (ECCMID), 2022. B.V. Gonçalves; Cavaco G.; De Lencastre, H.; L.J. Mota; R.G. Sobral. Autor correspondente: R.G. Sobral. "The role of peptidoglycan amidation in host immune response". Trabalho apresentado em 32nd European Congress of Clinical Microbiology & Infectious Diseases (ECCMID), 2022. Ana P. C. Almeida; João Saraiva ; Raquel Portela; Maria Helena Figueiredo Godinho; Rita G. Sobral; Pedro Marques de Almeida. Autor correspondente: Pedro Marques de Almeida. "Bacterial Cellulose Based Hydrogel For Wound Dressing Application". Trabalho apresentado em 3 rd Condensed Matter Physics National Conference, Lisbon, 2022. Portela, R.; M. Silva; B.V. Gonçalves; J.S. Dias; A. Rosato ; R.G. Sobral. Autor correspondente: R.G. Sobral. "Skf System, a Promising New Bacteriocin System of Staphylococcus aureus". Trabalho apresentado em 5th Annual Texas Medical Center Antimicrobial Resistance & Stewardship Conference, 2022. Portela, Raquel; Oliveira, Ricardo N. S.; Tostão, Alicia; Gonçalves, Bárbara V.; Rita G. Sobral; Pauleta, Sofia R.. "Detoxification of toxic intermediates produced by oxygen reduction in human pathogens". Trabalho apresentado em MicroBioTec, 2021. Barreiro, Daniela S.; Oliveira, Ricardo N. S.; Gonçalves, Bárbara; Rita G. Sobral; Pauleta, Sofia R.. Autor correspondente: Pauleta, Sofia R.. "Copper Proteins form Pathogenic Bacteria - Metal Homeostasis and Denitrification". Trabalho apresentado em International Workshop on Chemistry of Group 11 Elements, 2020. Gonçalves, B.V.; Portela, R.; R. Lobo; T.A. Figueiredo; Grilo, I.R.; A.M. Ludovice; De Lencastre, H.; J.S. Dias; R.G. Sobral. Autor correspondente: R.G. Sobral. "Zooming in on MurT C-terminal domain – impact of specific residues on peptidoglycan amidation in S. aureus.". Trabalho apresentado em The Great Wall Symposium, 2019. Grilo, I.R.; C.A.C. Madeira; A.M. Ludovice; R.G. Sobral. Autor correspondente: R.G. Sobral. "Molecular features of the GL-DNA interaction and effects on hydrolytic activity.". 2019. Cavaco G.; A.M. Ludovice; H. de Lencastre; R.G. Sobral. Autor correspondente: R.G. Sobral. "Structural modifications in the peptidoglycan influence the autolytic system of S. aureus". Trabalho apresentado em The Great Wall Symposium, 2019. Luca Luppino; Grilo, I.R.; G. Fonseca; C. Rodrigues; R.G. Sobral; Gaudêncio, S.P.. "Deep sea actinomycetes from Estremadura Spur, Continental Portugal, targeted as antimicrobial agents.". Trabalho apresentado em XVI International Symposium on Marine Natural Products (XVI MaNaPro), 2019. Costa, Clarinda; Guilherme Morais; Miguel Mates; Branco, Paula S.; Susana P. Gaudêncio; Rita G. Sobral; Grilo, Inês R.; et al. "Dry Powder Formulations for Antibiotic Pulmonary Delivery". Trabalho apresentado em 6th Portuguese Young Chemists Meeting, 2018. Miguel Mateus ; Guilherme Morais; Costa, Clarinda; Branco, Paula S.; Grilo, Inês R.; Rita G. Sobral; Susana P. Gaudêncio; Bonifácio, Vasco D.B.; Aguiar-Ricardo, Ana. "One-Pot reaction: A sustainable and green approach for drug modification". Trabalho apresentado em 6th Portuguese Young Chemists Meeting, 2018. Costa, Clarinda; Guilherme Morais; Miguel Mateus ; Branco, Paula S.; Susana P. Gaudêncio; Rita G. Sobral; Grilo, Inês R.; et al. "Development of Dry Powder Formulations Containing Antibacterial Compounds". Trabalho apresentado em 12th International Symposium on Supercritical Fluids, 2018.
Resumo em conferência	Gonçalves, Bárbara; Barreiro, Daniela S.; Rita G. Sobral; Pauleta, Sofia R.. Autor correspondente: Pauleta, Sofia R.. "The role of the multicopper oxidase in copper homeostasis in gram positive pathogens". Trabalho apresentado em Congress of Microbiology and Biotechnology, Coimbra, 2019. Gonçalves, Bárbara; Barreiro, Daniela S.; Pauleta, Sofia R.; Rita G. Sobral. "Dealing with copper stress - multicopper oxidases in pathogenic Gram-positive bacteria". Trabalho apresentado em XXVI Encontro Nacional da Sociedade Portuguesa de Química, Porto, 2019.

Propriedade Intelectual

Patente	S.P. Gaudencio; Rita G. Sobral; F. Pereira; I. Santos-Sanches; S. Gonçalves; V. Vasconcelos; I. Cunha; J. Almeida. 2018. "Use of napiradiomycins with antifouling activity and thereof compositions". Concedida/Emitida
Pedido provisório de patente	2020. "Protein for detecting the presence of peptidoglycan, muropeptides or bacterial cells, sensor and uses thereof". Protegido

Outros

Outra produção

Global gene expression analysis of Streptococcus agalactiae at exponential growth phase. 2020. Silvestre, I.; Borges, V.; Duarte, S.; Nunes, A.; Sobral, R.; Vieira, L.; Gomes, J.P.; Borrego, M.J.. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85098862062&partnerID=MN8TOARS.
10.1101/2020.11.13.381939
Molecular Networking to target the isolation of novel isoprenoids derivatives from marine-derived actinomycetes. 2019. Anelize Bauermeister; Florbela Pereira; Inês R. Grilo; Alejandra Prieto-davó; Rita Sobral; Norberto Lopes; Susana P. Gaudencio. https://novaresearch.unl.pt/en/publications/8a66f788-e8a9-44ce-8606-b215f86daaf6.
10.3389/conf.FMARS.2018.06.00160

Atividades

Apresentação oral de trabalho

	Título da apresentação	Nome do evento Anfitrião (Local do evento)
2023/05/31	Liquid Crystal-based polarization immunosensor for Escherichia coli detection	Optical sensors 2023 (SPIE) (prague, República Checa)
2022/11/10	Liquid Crystal based bacterial infection biossensor	7th International Colloquium 'Physics of Materials' (Bucareste, Roménia)
2022/04/26	Rheology of Bacterial Cellulose wound dressing membranes	Annual European Rheology Conference 2022 (AERC2022) (Espanha)
2022/04/23	Impact of peptidoglycan amidation on cell surface properties and biofilm formation in Staphylococcus aureus	32nd European Congress of Clinical Microbiology & Infectious Diseases (ECCMID) (lisbon, Portugal)
2021/11/23	Marine-derived actinobacteria produce bioplastics while degrading (micro)plastics?	Congress of Microbiology and Biotechnology 2021 (MicroBiotec’21) (Portugal)
2020/07/20	Temperature influence in the rheology of living S. aureus cultures	11th Liquid Matter Conference (Liquids 2020) (Praga)
2019/11/01	Tackling bacterial resistance using antibiotics as ionic liquids and organic salts	5 th International Electronic Conference of Medicinal Chemistry
2019/04/13	Strategies of adaptation of Staphylococcus epidermidis lineages to commensal and pathogenic lifestyle	29th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID) (amesterdão, Países Baixos)
2019	S. aureus and E. coli co-culture growth under shear.	7th Iberian Meeting on Rheology 2019 - IbeReo2019. (Porto, Portugal)
2019	Ionic Liquids Derived from ß-Lactam Antibiotics Against Resistant Bacteria.	3rd International Caparica Conference in Antibiotic Resistance (Caparica, Portugal)
2019	Impact of peptidoglycan amidation on the autolysis of Staphylococcus aureus.	IV NOVAhealth Genetics Workshop (Lisboa, Portugal)
2019	Modifying the cell wall of Staphylococcus aureus – role in antibiotic resistance and interactions with the environment.	Mini-symposium - Biological insights into pathogenicity in staphylococci. (Oeiras, Portugal)
2018/07/05	Molecular Networking to target the isolation of novel isoprenoids derivatives from marine-derived actinomycetes.	International Meeting on Marine Research. 10.3389/conf.FMARS.2018.06.00160 (Peniche, Portugal)
2018/04/21	Adaptation of Staphylococcus epidermidis from commensalism towards pathogenicity.	28th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID) (Madrid, Espanha)
2018/04/17	Shear flow complex motion in Escherichia coli aggregates.	Annual European Rheology Conference. (Sorrento, Itália)
2018/03/09	The staphylococcal surface – an interaction platform with the host	IV Semana da Bioengenharia. Symposium - The War Against Infections. Instituto Superior Técnico, Universidade de Lisboa. (Lisboa, Portugal)
2017/12/07	Genomic adaptation strategies of Staphylococcus epidermidis from commensal to pathogen	MICROBIOTEC17 –Congress of Microbiology and Biotechnology (Porto, Portugal)
2017/12/04	Blue Biotechnological potential of antimicrobial natural products from marine-derived actinomycetes	2nd International Caparica Christmas Congress on Translational Chemistry (IC3TC 2017) (Caparica, Portugal)
2017/10/02	The cell wall of Staphylococcus aureus - implications in antibiotic resistance and interaction with the host	3º Workshop de Genética – NOVASAÚDE (Portugal)
2017/09/06	Rotational and translational motion observed in Escherichia coli aggregates during shear.	Iberian Meeting on Rheology 2017, IbeReo2017 (Valencia, Espanha)
2017/09/03	Hybrid-isoprenoids from MAR4 strains isolated from Madeira Archipelago as a source of antimicrobial compounds with biotechnological potential.	10thEuropean Conference of Marine Natural Products. (Creta, Grécia)
2017/07/26	Staphylococcus aureus: antibiotic resistance and interaction with the host	Biomolecular Engineering Symposium (Portugal)
2017/07/16	Ocean Treasures: Marine actinomycetes as a source of antimicrobial compounds with industrial applications	XXV Encontro Nacional da Sociedade Portuguesa de Química (Lisboa, Portugal)
2017/06/11	GL-DNA interaction affects the peptidoglycan hydrolytic activity of GL.	19thConference on Bacilli & Gram-positive Bacteria (Berlim, Alemanha)
2016/08/08	Living S. aureus bacteria rheology	The XVIIth International Congress on Rheology (ICR2016) (Kyoto, Japão)
2016/06/02	Essential core residues of MurT/GatD complex for peptidoglycan amidation in Staphylococcus aureus.	XL Portuguese Genetics Conference (Coimbra, Portugal)
2016/05/30	Staphylococcus aureus - transcriptomic analysis of a cell wall impaired mutant	2nd Genetics Workshop (Lisboa, Portugal)
2016/03/09	Exploring the key factors for the success of clonal complex 2 (cc2), the main Staphylococcus epidermidis lineage	IMMEM XI (ESCMID-ESGEM conference), International Meeting on Microbial Epidemiological Markers. (Lisboa, Portugal)
2016/03/09	Evolution of the skin commensal Staphylococcus epidermidis in hospital environment: insights from an early collection.	IMMEM XI (ESCMID-ESGEM conference), International Meeting on Microbial Epidemiological Markers (Lisboa, Portugal)
2015/09/07	Cell necklaces behave as a soft glassy material.	Iberian Meeting on Rheology (IbeReo2015) (Coimbra, Portugal)
2015/06/10	The importance of GL-eDNA binding for biofilm formation in Staphylococcus aureus	59th Wind River Conference on Prokaryotic Biology (Aspen, Estados Unidos)
2015/05/25	Time series analysis of the transcriptome of a S. with an impaired cell wall	XXXIX Jornadas Portuguesas de Genética (Braga, Portugal)
2015/05/25	Establishment of MurT/GatD complex as a new virulence factor – role in host evasion	XXXIX Jornadas Portuguesas de Genética
2014/12	DNA binding at the surface of Staphylococcus aureus - the role of Atl	Mini-Symposium - Two bacterial pathogens and a way to kill them ITQB, UNL (Portugal)
2014/06	How to tackle a tiny but powerful enemy? Fundamental approaches to bacterial physiology	Science conferences at noon ITQB, UNL (Portugal)
2013/10	How can rheology help study growth and death of bacteria	9th Ibero-American Workshop on Complex Fluids (Brasil)
2013/09	Bacterial autolysins trim cell surface peptidoglycan to prevent detection by the host	3rd Symposium – The dynamics of peptidoglycan structure and function. (França)
2013/09	Real-time rheology of actively growing Staphylococcus aureus.	International Soft Matter Conference. (Roma, Itália)
2013/09	Staphylococcus aureus strains rheology during growth	Ibereo2013 Fundamental and Applied Rheology (Malaga, Espanha)
2012/08	Rheological characterization of bacterial growth in the presence of antibiotics	The XVIth International Congress on Rheology (Lisboa, Portugal)
2011/12	Genome comparison of a Staphylococcus aureus mutant showing decreased antibiotic resistance and its revertant strain	MICROBIOTEC’11 (Braga, Portugal)
2011/03	Peptidoglycan structure and antibiotic resistance in Staphylococcus aureus	CREM, Centro de Recursos Microbiológicos, FCT, UNL (Caparica, Portugal)
2011	Bacterial growth screened by rheology	IbeReo 2011-Rheology trends: from nano to macro systems (Caparica, Portugal)
2010/02	Resistance to antibiotics – molecular mechanisms	Escola Superior de Tecnologia, Instituto Politécnico de Setúbal (Setúbal, Portugal)
2009/11	A new enzyme involved in the N-acetylation of muramic acid residues of peptidoglycan in Staphylococcus aureus: Impact on growth, oxacillin resistance and lysozyme sensitivity	Microbiotec09 (Vilamoura, Portugal)
2009	Global expression analysis of a Staphylococcus aureus mutant with an impaired cell wall	Microbiotec09 (Vilamoura, Portugal)
2008/10	A new player in the peptidoglycan biosynthesis of Staphylococcus aureus	Pathophysiology of Staphylococci (Bad Staffelstein, Alemanha)
2007/06	Microarray approach to the study of a murF insertion mutant	4th Conference on Functional Genomics of Gram-Positive Microorganisms (Tirrenia, Itália)
2003/09	Cell wall biosynthesis and b-lactam resistance in Staphylococcus aureus - the contribution of auxiliary gene murF	43rd Interscience Congress on Antimicrobial Agents and Chemotherapy (ICAAC) (Chicago, Estados Unidos)

Orientação

	Título / Tema Papel desempenhado	Curso (Tipo) Instituição / Organização
2023/09/03 - Atual	Exploring the role of a new two-peptide system of Staphylococcus aureus in the interaction with other bacteria and the host Orientador de Ana Rita Sequeira	Genética Molecular e Biomedicina (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2023/09/03 - Atual	Characterization of the human proteome and the influence of the Mediterranean diet Coorientador de Eduardo Costa-Camilo	Microbiologia (Mestrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2023/09/03 - Atual	Targeted actinomycete isolation from the River Tagus Bay and Sesimbra sediments, taxonomic characterization, and evaluation of antimicrobial potential Coorientador de Miguel Coelho	Biotecnologia (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2023/09/03 - Atual	Targeted actinomycete isolation from the Azores Archipelago sediments, taxonomic characterization, and evaluation of antimicrobial potential Coorientador de Tiago Correia	Biotecnologia (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2021/10/01 - Atual	Deciphering the role of mycobacterial peptidoglycan modifications in host immune recognition and antibiotic resistance of Mycobacterium tuberculosis Coorientador de Cátia Raquel Lopes Silveiro	Programa doutoral em Farmácia (Doutoramento) Universidade de Lisboa Faculdade de Farmácia, Portugal
2021/03/01 - Atual	Biochemical and functional characterization of enzymes from Neisseria gonorrhoeae and Staphylococcus aureus important for the infection process Coorientador de Daniela Sofia Colaço Barreiro	Bioquímica (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2018 - Atual	The role of peptidoglycan amidation in the structure of Staphylococci population – impact on biofilm formation Orientador de Gonçalo Cavaco	Biologia (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2022/09/02 - 2023/12/18	Characterization of an ABC-Type I importer in Staphylococcus aureus Coorientador de Ana Catarina Pinguelo Martins dos Santos	Microbiologia Médica (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2022/09/02 - 2023/11/22	Targeted Actinomycete Isolation from Macaronesia, Taxonomic Characterization and Evaluation of Antimicrobial potential Coorientador de Daniela Parreira	Bioquímica (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2022/09/02 - 2023/11/09	Search for bioactive compounds with antioxidant and antibacterial activity in seaweed species from the Portuguese coast Coorientador	Bioquímica (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2017 - 2022/12/20	A new target inside an old molecule: glutamate amidation of peptidoglycan Orientador de Barbara Gonçalves	Biologia (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2021/09/01 - 2022/12/06	Structural characterization of the c-terminal domain of endolysin plymw2 and interaction with the peptidoglycan of Staphylococcus aureus Coorientador de Marlene Pimentel Leite	Bioquímica (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2021/10/01 - 2022/05/24	Bacterial Cellulose for Biomedical Applications Coorientador de João Saraiva	Ciências de Engenharia Biomédica (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2020/10/01 - 2022/02/25	Targeted actinomycete isolation from the Estremadura Spur, taxonomic characterization and evaluation of antimicrobial potential Coorientador de Anilton Ianga	Química Bioorgânica (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2020/09/01 - 2022/02/25	Novel alkylaminophenols as antibacterial agents against Staphylococcus aureus infections Coorientador de Bárbara André Alves	Genética Molecular e Biomedicina (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2020/09/01 - 2022/01/19	Insights into the copper tolerance in Staphylococcus aureus Coorientador de Alicia Tostão	Microbiologia Médica (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2020/09/09 - 2022/01/17	Influence of peptidoglycan amidation on lysozyme resistance of Staphylococcus aureus Orientador de Ana Catarina Laço Fanico	Genética Molecular e Biomedicina (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2020/09/01 - 2022/01/17	Caracterization of the role of the scwdABC system of Staphylococcus aureus in inter-species and host interactions Orientador de Miguel Patinho Silva	Genética Molecular e Biomedicina (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2020/09/01 - 2022/01/14	Development and optimization of a bacterial infection biosensor using recombinant staphylococcal proteins Orientador de Pedro Miguel Reis Ganhão	Genética Molecular e Biomedicina (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2020/09/01 - 2022/01/12	Evaluation of Quaternary Ammonium Surfactants as prophylactic options for Streptococcus agalactiae infections Coorientador de Carolina Borges Ferreira	Genética Molecular e Biomedicina (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2016/07/01 - 2021/08/31	Development of a bacterial infection sensor based on S. aureus recombinant proteins Orientador de Inês Ramos Grilo	Pós-doutoramento (Outra) REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
2021/07/01 - 2021/07/31	Biotechnological studies of jellyfish and actinomycetes collected off Tagus River - Short Term Scientific Mission (STSM). COST Action Ocean4Biotech (CA18238). Orientador de Jan Ulcar	COST Action Ocean4Biotech (CA18238) (Curso de aperfeiçoamento / especialização) REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
2015 - 2021/03/02	Contribution of genomics and transcriptomics to the understanding of the biological role of DNases in Streptococcus agalactiae Coorientador de Inês Silvestre	Biologia (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2019/09/01 - 2021/01/15	Influence of a nisin-biogel on virulence factors expression by Staphylococcus aureus isolates from Diabetic Foot Infections Coorientador de Carolina de Oliveira Jesus	Genética Molecular e Biomedicina (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2020/02/10 - 2020/11/09	Biodiversity of marine bacteria in ocean sediments from the pockmarks of the Estremadura Spur Coorientador de António Pinto Almeida	Bolsa Pós-doutoramento António Coutinho (Curso de aperfeiçoamento / especialização) REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
2020/09/01 - 2020/10/31	Biotechnological study of the chemical diversity of dinoflagellates Orientador de Nathalia Peixoto Nocchi Carneiro	Short Term Scientific Mission (STSM). COST Action Ocean4Biotech (CA18238) (Curso de aperfeiçoamento / especialização) REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
2014 - 2019/12	New studies in the resistance to beta-lactams and in cell wall damage survival in Staphylococcus aureus: an integrated approach Orientador de Raquel Portela	Biologia (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2018 - 2019/07	Functionalization of recombinant proteins for matrix conjugation in a bifunctional infection sensor Orientador de José Diogo Anastácio	Biotecnologia (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2014 - 2019	Identification of key factors for the success of the main Staphylococcus epidermidis genetic lineage Coorientador de Diana Espadinha	Biologia (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2017 - 2018/11	Activity of the major autolysin of Staphylococcus aureus Atl in the presence of extracellular DNA Orientador de Catarina Madeira	Bioquímica para a Saúde (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa, Portugal
2017 - 2018	Peptidoglycan amidation of Staphylococcus aureus and bacterial cell physiology Coorientador de Gonçalo Cavaco	Microbiologia Médica (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa, Portugal
2015 - 2016	Anti-biofilm activity of natural products from marine actinobacteria for the development of antifouling dyes Coorientador de Helena Macedo	Bioquímica (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2011 - 2016	Origin and evolution of the ß–lactam resistance determinant in staphylococci Coorientador de Joana Rolo Mateus	Biologia (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2011 - 2016	Unfolding the physiological roles of the binding of Atl to eDNA in S. aureus Coorientador de Inês R. Grilo	Biologia (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2014 - 2015	Characterization of the major autolysin of S. aureus Orientador de Joana Silva	Microbiologia Médica (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa, Portugal
2014 - 2015	Gold nanoprobes for assessing expression of critical genes in the infection pathway of MRSA Orientador de Andreia Fortuna	Biotecnologia (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2013 - 2014	A new antimicrobial target in Staphylococcus aureus – amidation of peptidoglycan Orientador de Barbara Gonçalves	Genética Molecular e Biomedicina (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2013 - 2014	Role of DUF1727 domain in the amidation of peptidoglycan of Staphylococcus aureus Orientador de Ricardo Lobo	Ciências Biofarmacêuticas (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Farmácia, Portugal
2008 - 2014	Amidation of Peptidoglycan in Staphylococcus aureus - Identification of MurT-GatD enzymatic complex and insights into the biological role of this secondary modification Coorientador de Teresa A. Figueiredo	Biologia (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2008 - 2009	Regulatory characterization of S. aureus dcw islands Coorientador de Inês R. Grilo	Genética Molecular e Biomedicina (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal

Organização de evento

	Nome do evento Tipo de evento (Tipo de participação)	Instituição / Organização
2021/01/21 - 2021/01/25	Workshop "Scientific writing" (remoto) (2021/01/21 - 2021/01/25) Oficina (workshop) (Presidente da Comissão Organizadora)	Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal

Participação em evento

	Descrição da atividade Tipo de evento	Nome do evento Instituição / Organização
2023 - 2023	European Researchers´night Exposição	Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
2021/09/24 - 2021/09/24	European Researchers night Exposição	European Researchers night Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
2018 - 2018	European researchers night Exposição	European Researchers night Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal

Júri de grau académico

	Tema Tipo de participação	Nome do candidato (Tipo de grau) Instituição / Organização
2022/11/22	Ecological Interactions in Pseudomonas aeruginosa – Staphylococcus aureus mixed biofilms: deciphering co-infection in cystic fibrosis airways Arguente principal	Andreia Patrícia Alves Magalhães (Doutoramento) Universidade do Minho, Portugal
2022/02/04	Detection and characterization of rickettsias and other zoonotic agents in wild animals e their ectoparasites Presidente do júri	Inês Campos Freitas (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2022/02/02	Identification of new drugs against Neisseria gonorrhoeae through a strategy of repositioning in silico Presidente do júri	André Pinho de Pina (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2022/01/25	Virulence potencial of Staphylococcus aureus from skin and soft tissue infections Presidente do júri	Ketlyn Flora de Oliveira (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2022/01/25	Anatomy of the disease-related Dis3L2 ribonuclease: dissecting the amino acids responsible for substrate specificity Presidente do júri	Susana Margarida Marques Costa (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2022/01/24	Human polyomaviruses in waste and environmental waters in the Lisbon Metropolitan Area Presidente do júri	Ana Carolina de Oliveira Condez (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2022/01/24	Zap1 is required for Candida glabrata response to fluconazole Presidente do júri	Gonçalo dos Santos Afonso (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2022/01/11	Carbapenem Resistance in Clostridioides difficile Arguente principal	Aristides Mendes (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2021/02/08	Significance of mycobacterial peptidoglycan amidation in host immune recognition and antibiotic resistance Arguente principal	Mariana Ferreira Balula Marques (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Farmácia, Portugal
2021/01/26	Characterization of protein-protein interactions in the Bacillus subtilis AraNPQ-MsmX transporter Arguente principal	Joana Raquel Encarnação Almeida (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2021/01/13	Screening for carbapanemases at the emergency service of clinical pathology of the São José hospital Arguente principal	Vera Lúcia Martins Fevereiro Ruivo de Sousa (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2019/12	Phenotypic and genotypic characterization of Salmonella spp. isolates in Portugal Arguente	Leonor Silveira (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2019/12	New studies in the resistance to beta-lactams and in cell wall damage survival in Staphylococcus aureus: an integrated approach Orientador	Raquel Pereira Portela (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2019/06	Functionalization of recombinant proteins for matrix conjugation in a bifunctional infection sensor Orientador	José Diogo Anastácio (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2018/11	Molecular biology in the context of the emergency service of clinical pathology of the CHLC-Hospital de S. José Arguente principal	Sónia Marujo (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2018/11	Activity of the major autolysin of Staphylococcus aureus Atl in the presence of extracellular DNA Orientador	Catarina Madeira (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2017/12	The role of a new S. aureus hydrolase in Peptidoglycan degradation Arguente principal	Jéssica Gomes (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2017/11	Development of a laboratorial procedure of Next Generation Sequencing for DNA unviable for Sanger sequencing Arguente principal	Oleksandra Zabolotnya (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2017/06	Abietane Cationic Amphiphiles (ACA)-loaded polymeric microspheres to tackle resistant bacteria Arguente principal	Íris Branco Neto (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Farmácia, Portugal
2016/04	Unfolding the physiological roles of the binding of Atl to eDNA in S. aureus Orientador	Maria Inês Ramos Grilo (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2016/04	A minimal version of a Protein Tyrosine Phosphatase Arguente principal	Luis Silva (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2016/01	Characterization of the major autolysin of S. aureus Orientador	Joana Silva (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2015/11	Gold nanoprobes for assessing expression of critical genes in the infection pathway of MRSA Orientador	Andreia Fortuna (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2014/12	Amidation of Peptidoglycan in Staphylococcus aureus - Identification of MurT-GatD enzymatic complex and insights into the biological role of this secondary modification Orientador	Teresa Figueiredo (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2014/12	A new antimicrobial target in Staphylococcus aureus – amidation of peptidoglycan Orientador	Barbara Vitorino Gonçalves (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2014/11	Role of DUF1727 domain in the amidation of peptidoglycan of Staphylococcus aureus Orientador	Ricardo Lobo (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Farmácia, Portugal
2013/12	Study of the Role of Wall Teichoic Acids in the Localization of Staphylococcus aureus Cell Wall Synthesis protein PBP4 Arguente principal	Gabriela Henriques (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2011/03	Structural and Functional Analyses Reveal That Staphylococcus aureus Antibiotic Resistance Factor HmrA Is a Zinc-dependent Endopeptidase Arguente principal	Tiago Botelho (Doutoramento) Instituto de Biología Molecular de Barcelona, Espanha
2009/12	Regulatory characterization of S. aureus dcw islands Orientador	Maria Inês Ramos Grilo (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal

Arbitragem científica em revista

	Nome da revista (ISSN)	Editora
2022 - Atual	Microbiology spectrum
2021 - Atual	Proceedings of the National Academy of Sciences
2021 - Atual	Journal of Antimicrobial Chemotherapy
2019 - Atual	PLoS Pathogens (1553-7374)	Public Library of Science
2019 - Atual	MicrobiologyOpen (2045-8827)	Wiley (John Wiley & Sons)
2019 - Atual	Nature Chemical Biology (1552-4469)	Springer Science and Business Media LLC
2013 - Atual	PLoS ONE (1932-6203)	Public Library of Science
2010 - Atual	Microbial Drug Resistance (1931-8448)	Mary Ann Liebert

Comissão de avaliação

	Descrição da atividade Tipo de assessoria	Instituição / Organização	Entidade financiadora
2022/01 - Atual	Member of evaluation body of SNSF Swiss Postdoctoral Fellowships Avaliador
2016 - Atual	Evaluator of grant applications for the Swiss National Foundation. Avaliador

Curso / Disciplina lecionado

	Disciplina	Curso (Tipo)	Instituição / Organização
2021/10 - Atual	Molecular and Celular Biology	Licenciatura em Engenharia Química e Bioquímica (Licenciatura)	Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2021/07/01 - Atual	Biofilms in chronic diseases	Microbiologia Médica (Mestrado)	Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2016/09 - Atual	Applied Microbiology	Genética Molecular e Biomedicina (Mestrado integrado)	Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2016/09 - Atual	Applied Microbiology	Biologia Celular e Molecular (Licenciatura)	Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2015/03 - Atual	Laboratory methodologies in Biology II	Biologia Celular e Molecular (Licenciatura)	Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2015/03 - Atual	Microbiology B	Biologia Celular e Molecular (Licenciatura)	Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2013/03 - Atual	Microbiology C	Engenharia do Ambiente (Mestrado integrado)	Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2013/01 - Atual	Laboratory rotations	Genética Molecular e Biomedicina (Mestrado integrado)	Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2013/09 - 2015/01	Regulation of genetic expression	Genética Molecular e Biomedicina (Mestrado integrado)	Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2013/02 - 2013/04	Introduction to scientific research program	Biologia Celular e Molecular (Licenciatura)	Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2010/01 - 2010/09	Biochemistry	Engenharia Química (Licenciatura)	Instituto Politécnico de Setúbal Escola Superior de Tecnologia do Barreiro, Portugal

Membro de comissão

	Descrição da atividade Tipo de participação	Instituição / Organização
2023/05/01 - Atual	Member of the Executive Committee of the Applied Molecular Biosciences Unit (UCIBIO) Membro	Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
2021/01/01 - Atual	Membro da Comissão Científica do Mestrado em Microbiologia Médica (Universidade Nova de Lisboa - FCT, FCM, IHMT, ITQB) Membro	Universidade Nova de Lisboa, Portugal

Distinções

Prémio

2015	Research Grant Award 2015 European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Suiça
2011	Research Grant award 2011 European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Suiça