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João Manuel de Oliveira e Silva Rodrigues. Completed the Doutoramento in Doutoramento em Engenharia Electrotécnica in 2004 by Universidade de Aveiro, Mestrado in Mestrado em Engenharia Electrónica e Telecomunicações (pré-Bolonha) in 1995 by Universidade de Aveiro and Licenciatura in Licenciatura em Engenharia Electrónica e Telecomunicações (pré-Bolonha) in 1992 by Universidade de Aveiro. Is Assistant Professor in Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática. Published 22 articles in journals. Has 15 section(s) of books. Participates and/or participated as Researcher in 4 project(s). Works in the area(s) of Engineering and Technology with emphasis on Electrotechnical Engineering, Electronics and Informatics. In their professional activities interacted with 109 collaborator(s) co-authorship of scientific papers. In his curriculum Ciência Vitae the most frequent terms in the context of scientific, technological and artistic-cultural output are: Modeling; DNA; Chargaff´s second parity rule; Motifs; signal processing; data compression; .
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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
João Manuel de Oliveira e Silva Rodrigues

Nomes de citação

  • Rodrigues, João
  • João Manuel Rodrigues
  • João M. O. S. Rodrigues

Identificadores de autor

Ciência ID
6B1E-7520-BD18
ORCID iD
0000-0001-9187-8094
Google Scholar ID
PIPNkZIAAAAJ
Researcher Id
G-4821-2011
Scopus Author Id
57220791360

Websites

  • http://wiki.ieeta.pt/wiki/index.php/Jo%C3%A3o_M._O._S._Rodrigues (Académico)

Domínios de atuação

  • Ciências da Engenharia e Tecnologias - Engenharia Eletrotécnica, Eletrónica e Informática

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Inglês Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Francês Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1)
Formação
Grau Classificação
2004
Concluído
 Doutoramento em Engenharia Electrotécnica (Doutoramento)
Universidade de Aveiro, Portugal
"Codificação digital de áudio baseada em retroadaptação perceptual" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 Aprovado
1995
Concluído
 Mestrado em Engenharia Electrónica e Telecomunicações (pré-Bolonha) (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
"Compressão Digital de Sinais Áudio Aplicando Critérios Perceptuais e Adaptação para Trás" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 Muito Bom
1992
Concluído
 Licenciatura em Engenharia Electrónica e Telecomunicações (pré-Bolonha) (Licenciatura)
Universidade de Aveiro, Portugal
"Projecto: Sistema Distribuído de Consulta e Edição de Documentos Multimédia" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 16 valores
Percurso profissional

Docência no Ensino Superior

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2004/12/07 - Atual Professor Auxiliar (Docente Universitário) Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
1997/01/02 - 2004/12/06 Assistente (Docente Universitário) Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
1996/02/01 - 1996/07/01 Monitor (Docente Universitário) Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
1994/10/01 - 1995/02/01 Monitor (Docente Universitário) Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
Projetos

Projeto

Designação Financiadores
2020 - 2023/12/31 Instituto de Engenharia Electrónica e Telemática de Aveiro
UIDP/00127/2020
Investigador
Universidade de Aveiro Instituto de Engenharia Eletrónica e Informática de Aveiro, Portugal
2020 - 2021/09/30 TO2 – Postos de medição sem contacto de saturação de oxigénio e temperatura
CENTRO-01-02B7-FEDER-067313
Universidade de Aveiro, Portugal
2014 - 2016/08/31 CLA: Training Health Professionals to use Computerised Lung Auscultation
FCG/136395
Investigador
Fundação Calouste Gulbenkian
2014 - 2015/02/28 RSAT: Respiratory Sound Assessment Toolkit - A Auscultação do Futuro
18/ID/2014
Investigador
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2014 - 2015/02/28 DNA symmetry: modeling, influential words and outliers
EXPL/MAT-STA/1674/2013
grant.Provided by PTCRIS: 134699
Investigador
Universidade de Aveiro, Portugal

Universidade de Aveiro Centro de Investigação e Desenvolvimento em Matemática e Aplicações, Portugal

Universidade de Aveiro Instituto de Engenharia Eletrónica e Informática de Aveiro, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído

Outro

Designação Financiadores
2010 - 2013/11/30 Sounds4Health - Rehabilitating and home-monitoring people with Chronic Obstructive Pulmonary Disease and their families during long term therapy
13638
Investigador
Universidade de Aveiro Instituto de Engenharia Eletrónica e Informática de Aveiro, Portugal

Universidade de Aveiro Escola Superior de Saúde de Aveiro, Portugal
AdI - Agência de Inovação S.A.
Concluído
2009 - 2012/10/31 PERVASIVE TOURISM
11507
Universidade de Aveiro Instituto de Engenharia Eletrónica e Informática de Aveiro, Portugal
 AdI - Agência de Inovação S.A.
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em conferência
  1. Marques, Alda; Machado, Ana; Oliveira, Ana; Jácome, Cristina; Pereira, Marco; Moreira, José; Rodrigues, João; Aparício, José; Jesus, Luís M. T.. "Teaching and learning pulmonary auscultation: the Computerized Lung Auscultation–Sound Software (CLASS)". 2017.
  2. Semedo, J.; Oliveira, A.; Machado, A.; Moreira, J.; Rodrigues, J.; Aparício, J.; Pasterkamp, H.; Jesus, L.M.T.; Marques, A.. "Computerised Lung Auscultation - Sound Software (CLASS)". 2015.
    10.1016/j.procs.2015.08.589
  3. Pinho, C.; Oliveira, A.; Jácome, C.; Rodrigues, J.; Marques, A.. "Automatic Crackle Detection Algorithm Based on Fractal Dimension and Box Filtering". 2015.
    10.1016/j.procs.2015.08.592
  4. Tavares, A.H.; Afreixo, V.; Rodrigues, J.M.O.S.; Bastos, C.A.C.. "The symmetry of oligonucleotide distance distributions in the Human Genome". 2015.
  5. Rosa, Marlene; Marques, Alda; Demian, Sara; Rodrigues, João. "Muscle co-contraction assessment during walking in clinical practice-a preliminary accuracy and reproducibility study". 2014.
    10.1186/s12913-016-1423-5
  6. Rosa, Marlene; Marques, Alda; Demain, Sara; Rodrigues, João. "Quantification of co-contraction index during walking using a low-tech ambulatory system - a preliminary reliability study". 2014.
  7. Dinis, J.; Oliveira, A.; Pinho, C.; Campos, G.; Rodrigues, J.; Marques, A.. "Automatic wheeze and respiratory phase detectors to evaluate respiratory physiotherapy in LRTI: A preliminary study". 2013.
  8. Dinis, J.; Campos, G.; Rodrigues, J.; Marques, A.. "Respiratory sound annotation software". 2012.
  9. Vieira, J.; Tomé, A.; Rodrigues, J.. "Providing an environment to teach DSP algorithms". 2002.
    10.1109/dspws.2002.1231120
  10. João Manuel Rodrigues; Tome, Ana; Tomás António Mendes de Oliveira e Silva. "Auditory models in audio coding". Trabalho apresentado em 111th Convention of the Audio Engineering Society, New York, NY, 2001.
  11. João Manuel Rodrigues; Tome, Ana. "A backward-adaptive perceptual audio coder". Trabalho apresentado em European Signal Processing Conference (EUSIPCO), Trieste, 1996.
    Publicado
  12. João Manuel Rodrigues; Tome, Ana. "High quality audio coding using backward estimation of perceptual phenomena". Trabalho apresentado em 8th Portuguese Conference on Pattern Recognition (RECPAD), Guimarães, 1996.
    Publicado
Artigo em revista
  1. Mário Lopes; João Manuel Rodrigues; Pedro Monteiro; Mário Rodrigues; Rui Costa; José Oliveira; Fernando Ribeiro. "Effects of the FIFA 11+ on ankle evertors latency time and knee muscle strength in amateur futsal players". European Journal of Sport Science (2019): https://doi.org/10.1080/17461391.2019.1609588.
    10.1080/17461391.2019.1609588
  2. Lopes, Mário; Simões, Daniela; Rodrigues, João M.; Costa, Rui; Oliveira, José; Ribeiro, Fernando; Lopes, M.; et al. "The FIFA 11+ does not alter physical performance of amateur futsal players". The Journal of Sports Medicine and Physical Fitness 59 5 (2019): 743-751. http://dx.doi.org/10.23736/s0022-4707.18.08532-8.
    10.23736/s0022-4707.18.08532-8
  3. Bastos, C.A.C.; Afreixo, V.; Rodrigues, J.M.O.S.; Pinho, A.J.; Silva, R.M.. "Distribution of Distances Between Symmetric Words in the Human Genome: Analysis of Regular Peaks". Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences 11 3 (2019): 367-372. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85068597987&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/s12539-019-00326-x
  4. Ana Oliveira; João Rodrigues; Alda Marques. "Enhancing our understanding of computerised adventitious respiratory sounds in different COPD phases and healthy people". Respiratory Medicine 138 (2018): 57-63. https://doi.org/10.1016/j.rmed.2018.03.023.
    10.1016/j.rmed.2018.03.023
  5. Machado, A.; Oliveira, A.; Jácome, C.; Pereira, M.; Moreira, J.; Rodrigues, J.; Aparício, J.; et al. "Usability of Computerized Lung Auscultation–Sound Software (CLASS) for learning pulmonary auscultation". Medical and Biological Engineering and Computing 56 4 (2018): 623-633. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85028348100&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/s11517-017-1697-8
  6. Afreixo, V.; Rodrigues, J.M.O.S.; Bastos, C.A.C.; Tavares, A.H.M.P.; Silva, R.M.. "Exceptional Symmetry by Genomic Word: A Statistical Analysis". Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences 9 1 (2017): 14-23. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85016097960&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/s12539-016-0200-9
  7. Oliveira, A.; Lage, S.; Rodrigues, J.; Marques, A.; Oliveira, Ana; Lage, Susan; Rodrigues, João; Marques, Alda. "Reliability, validity and minimal detectable change of computerized respiratory sounds in patients with chronic obstructive pulmonary disease". Clinical Respiratory Journal (2017): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85038114165&partnerID=MN8TOARS.
    10.1111/crj.12745
  8. Tavares, A.H.M.P.; Pinho, A.J.; Silva, R.M.; Rodrigues, J.M.O.S.; Bastos, C.A.C.; Ferreira, P.J.S.G.; Afreixo, V.. "DNA word analysis based on the distribution of the distances between symmetric words". Scientific Reports 7 1 (2017): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85018995715&partnerID=MN8TOARS.
    10.1038/s41598-017-00646-2
  9. Pinho, Cátia; Oliveira, Ana; Jácome, Cristina; Rodrigues, João Manuel; Marques, Alda. "Integrated Approach for Automatic Crackle Detection Based on Fractal Dimension and Box Filtering". International Journal of Reliable and Quality E-Healthcare 5 4 (2016): 34-50. http://dx.doi.org/10.4018/ijrqeh.2016100103.
    10.4018/IJRQEH.2016100103
  10. Afreixo, V.; Rodrigues, J.M.O.S.; Bastos, C.A.C.; Silva, R.M.. "The exceptional genomic word symmetry along DNA sequences". BMC Bioinformatics 17 1 (2016): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84957009081&partnerID=MN8TOARS.
    10.1186/s12859-016-0905-0
  11. Afreixo, V.; Rodrigues, J.M.O.S.; Bastos, C.A.C.. "Analysis of single-strand exceptional word symmetry in the human genome: New measures". Biostatistics 16 2 (2015): 209-221. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84926649522&partnerID=MN8TOARS.
    10.1093/biostatistics/kxu041
  12. Afreixo V; Rodrigues JM; Bastos CA. "Exceptional single strand DNA word symmetry: analysis of evolutionary potentialities.". (2014): http://europepmc.org/abstract/med/25339084.
    10.2390/biecoll-jib-2014-250
  13. Pratas, D.; Pinho, A.J.; Rodrigues, J.M.O.S.. "XS: A FASTQ read simulator". BMC Research Notes 7 1 (2014): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84892407950&partnerID=MN8TOARS.
    10.1186/1756-0500-7-40
  14. Rosa, Marlene; Marques, Alda; Demain, Sara; Cheryl, Metcalf; Rodrigues, João; Rosa, M.C.N.; Marques, A.; et al. "Methodologies to assess muscle co-contraction during gait in people with neurological impairment: a systematic literature review". Journal of Electromyography and Kinesiology 24 2 (2014): 179-191. http://hdl.handle.net/10773/22437.
    10.1016/j.jelekin.2013.11.003
  15. Afreixo, V.; Bastos, C.A.C.; Garcia, S.P.; Rodrigues, J.M.O.S.; Pinho, A.J.; Ferreira, P.J.S.G.. "The breakdown of the word symmetry in the human genome". Journal of Theoretical Biology 335 (2013): 153-159. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84880640252&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.jtbi.2013.06.032
  16. Garcia, S.P.; Rodrigues, J.M.O.S.; Santos, S.; Pratas, D.; Afreixo, V.; Bastos, C.A.C.; Ferreira, P.J.S.G.; Pinho, A.J.. "A genomic distance for assembly comparison based on compressed maximal exact matches". IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 10 3 (2013): 793-798. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84887940267&partnerID=MN8TOARS.
    10.1109/TCBB.2013.77
  17. Afreixo, V.; Garcia, S.P.; Rodrigues, J.M.O.S.. "The breakdown of Symmetry in Word Pairs in 1,092 Human Genomes". Jurnal Teknologi (Sciences and Engineering) 63 3 (2013): 1-8. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84881055487&partnerID=MN8TOARS.
  18. Silva, J.; Lau, N.; Neves, A.J.R.; Rodrigues, J.; Azevedo, J.L.. "World modeling on an MSL robotic soccer team". Mechatronics 21 2 (2011): 411-422. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-79952617090&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.mechatronics.2010.05.011
  19. Garcia, S.P.; Pinho, A.J.; Rodrigues, J.M.O.S.; Bastos, C.A.C.; Ferreira, P.J.S.G.. "Minimal absent words in prokaryotic and eukaryotic genomes". PLoS ONE 6 1 (2011): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-79551646687&partnerID=MN8TOARS.
    10.1371/journal.pone.0016065
  20. Bastos, C.A.; Afreixo, V.; Pinho, A.J.; Garcia, S.P.; Rodrigues, J.M.; Ferreira, P.J.. "Inter-dinucleotide distances in the human genome: an analysis of the whole-genome and protein-coding distributions.". Journal of integrative bioinformatics 8 3 (2011): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84855542023&partnerID=MN8TOARS.
  21. Pinho, Armando J; Ferreira, Paulo JSG; Garcia, Sara P; Rodrigues, João MOS. "On finding minimal absent words". BMC Bioinformatics 10 1 (2009): http://dx.doi.org/10.1186/1471-2105-10-137.
    10.1186/1471-2105-10-137
  22. Rodrigues, J.M.. "On the use of backward adaptation in a perceptual audio coder". IEEE Transactions on Speech and Audio Processing 8 4 (2000): 488-490. http://dx.doi.org/10.1109/89.848231.
    10.1109/89.848231
Capítulo de livro
  1. Pinho, Cátia; Oliveira, Ana; Jácome, Cristina; Rodrigues, João Manuel; Marques, Alda. "Integrated Approach for Automatic Crackle Detection Based on Fractal Dimension and Box Filtering". In Data Analytics in Medicine, 815-832. IGI Global, 2020.
    10.4018/978-1-7998-1204-3.ch043
  2. Duarte, Diogo; Silva, Sérgio; Rodrigues, João M.; Soares, Salviano Pinto; Valente, António. "Comparison of Embedded Linux Development Tools for the WiiPiiDo Distribution Development". In Advances in Intelligent Systems and Computing, 42-53. Springer International Publishing, 2020.
    10.1007/978-3-030-52249-0_4
  3. Bastos, Carlos A. C.; Afreixo, Vera; Rodrigues, João M. O. S.; Pinho, Armando J.. "Detection and Characterization of Local Inverted Repeats Regularities". In Practical Applications of Computational Biology and Bioinformatics, 13th International Conference, 113-120. Springer International Publishing, 2019.
    10.1007/978-3-030-23873-5_14
  4. Bastos, Carlos A. C.; Afreixo, Vera; Rodrigues, João M. O. S.; Pinho, Armando J.. "An Analysis of Symmetric Words in Human DNA: Adjacent vs Non-adjacent Word Distances". In Practical Applications of Computational Biology and Bioinformatics, 12th International Conference, 80-87. Springer International Publishing, 2018.
    10.1007/978-3-319-98702-6_10
  5. Afreixo, Vera; Rodrigues, João M. O. S.; Bastos, Carlos A. C.; Silva, Raquel M.. "Exceptional Symmetry Profile: A Genomic Word Analysis". In 10th International Conference on Practical Applications of Computational Biology & Bioinformatics, 151-159. Springer International Publishing, 2016.
    10.1007/978-3-319-40126-3_16
  6. Afreixo, Vera; Bastos, Carlos A. C.; Rodrigues, João M. O. S.; Silva, Raquel M.. "Identification of DNA CpG Islands Using Inter-dinucleotide Distances". In Communications in Computer and Information Science, 162-172. Springer International Publishing, 2015.
    Publicado • 10.1007/978-3-319-20352-2_11
  7. Afreixo, Vera; Rodrigues, João M. O. S.; Bastos, Carlos A. C.. "Exceptional Single Strand DNA Word Symmetry: Universal Law?". In 8th International Conference on Practical Applications of Computational Biology & Bioinformatics (PACBB 2014), 137-143. Springer International Publishing, 2014.
    10.1007/978-3-319-07581-5_17
  8. Afreixo, Vera; Rodrigues, João M. O. S.; Garcia, Sara P.. "Analysis of Word Symmetries in Human Genomes Using Next-Generation Sequencing Data". In 7th International Conference on Practical Applications of Computational Biology & Bioinformatics, 7-13. Springer International Publishing, 2013.
    10.1007/978-3-319-00578-2_2
  9. Cunha, João; Lau, Nuno; Rodrigues, João. "Ball Interception Behaviour in Robotic Soccer". In RoboCup 2011: Robot Soccer World Cup XV, 114-125. Springer Berlin Heidelberg, 2012.
    10.1007/978-3-642-32060-6_10
  10. Bastos, Carlos A. C.; Afreixo, Vera; Pinho, Armando J.; Garcia, Sara P.; Rodrigues, João M. O. S.; Ferreira, Paulo J. S. G.. "Distances between Dinucleotides in the Human Genome". In 5th International Conference on Practical Applications of Computational Biology & Bioinformatics (PACBB 2011), 205-211. Springer Berlin Heidelberg, 2011.
    10.1007/978-3-642-19914-1_28
  11. R. Neves, Antonio J.; Luis, Jose; Cunha, Bernardo; Lau, Nuno; Silva, Joao; Santos, Frederico; Corrente, Gustavo; et al. "CAMBADA Soccer Team: from Robot Architecture to Multiagent Coordination". In Robot Soccer. InTech, 2010.
    10.5772/7353
  12. Silva, João; Lau, Nuno; Rodrigues, João; Azevedo, José Luís; Neves, António J. R.. "Sensor and Information Fusion Applied to a Robotic Soccer Team". In RoboCup 2009: Robot Soccer World Cup XIII, 366-377. Springer Berlin Heidelberg, 2010.
    10.1007/978-3-642-11876-0_32
  13. Pinho, Armando J.; Garcia, Sara P.; Ferreira, Paulo J. S. G.; Afreixo, Vera; Bastos, Carlos A. C.; Neves, António J. R.; Rodrigues, João M. O. S.. "Exploring Homology Using the Concept of Three-State Entropy Vector". In Pattern Recognition in Bioinformatics, 161-170. Springer Berlin Heidelberg, 2010.
    10.1007/978-3-642-16001-1_14
  14. Cunha, João; Lau, Nuno; Rodrigues, João; Cunha, Bernardo; Azevedo, José Luis. "Predictive Control for Behavior Generation of Omni-directional Robots". In Progress in Artificial Intelligence, 275-286. Springer Berlin Heidelberg, 2009.
    10.1007/978-3-642-04686-5_23
  15. Silva, João; Lau, Nuno; Neves, António J. R.; Rodrigues, João; Azevedo, José Luís. "Obstacle Detection, Identification and Sharing on a Robotic Soccer Team". In Progress in Artificial Intelligence, 350-360. Springer Berlin Heidelberg, 2009.
    10.1007/978-3-642-04686-5_29
Tese / Dissertação
  1. Rodrigues, João Manuel de Oliveira e Silva. "Codificação digital de áudio baseada em retroadaptação perceptual". Doutoramento, 2004. http://hdl.handle.net/10773/2221.
  2. Rodrigues, João Manuel de Oliveira e Silva. "Compressão digital de sinais áudio aplicando critérios perceptuais e adaptação para trás". Mestrado, 1995. http://hdl.handle.net/10773/27338.

Outros

Outra produção
  1. FALCON-meta: a method to infer metagenomic composition of ancient DNA. 2018. Diogo Pratas; Armando J. Pinho; Raquel M. Silva; João M. O. S. Rodrigues; Morteza Hosseini; Tânia Caetano; Paulo J. S. G. Ferreira. https://doi.org/10.1101/267179.
    10.1101/267179