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As a Master's graduate in Biochemistry (Faculty of Science and Technologies – University NOVA of Lisbon), I am deeply interested in pursuing a research career in the Organic Chemistry and Biochemistry fields. As presented in my Master’s Thesis and later works, I worked with synthetic peptides and structural changes of small peptides under various environments. I have large experience with controlled chemical synthesis and spent many hours executing solid phase peptide synthesis procedures in the laboratories of Centre for Nuclear Sciences and Technologies (C2TN) – Instituto Superior Técnico. In previous experiments I had the opportunity to work with various analytical methods, such as Circular Dichroism, Dynamic Light Scattering, Mass Spectrometry (ESI-MS), Fluorescence Microscopy, HPLC and Fluorescence Microscopy. I also had the opportunity to be introduced to cell culture proceedings and maintenance in aseptic environment and radiolabeling of small molecules and peptides with various isotopes of Gallium, Technetium and Indium. Currently, I am developing radio-labeled organic bio-conjugates for cancer imaging and theranostics on a Master’s scholarship. I now earn to raise a step forward in my work and study the interaction of proteins and organic molecules with small peptides and singular aminoacids. I have acquired great laboratorial autonomy, organization and care in my previous experience. Due to my multidisciplinary background, I have the confidence to execute experimental assays in any subject mentioned earlier. I have been praised by my superiors due to my critic spirit when analyzing experimental results, and keep daily organized reports of my experiences. In addition, I possess great computer skills, and have been recently introduced to computational chemistry tools, namely Molecular Docking and Molecular Dynamics calculations, which are both fields of great interest to myself. I have great confidence in my laboratorial skills and knowledge in Chemistry and Biochemistry subjects. While enjoying working independently as well as part of a team, I always volunteered to tutor undergraduate students or to act as a team leader if the opportunity presents itself. I strongly desire for an opportunity to carry out a Doctoral Program. I am currently in pursuit of such programs and would welcome the opportunity to further discuss my qualifications and experience during a personal interview for any interested party.
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Rúben Silva
Género
Masculino

Nomes de citação

  • Silva, R
  • Silva, R.D.M
  • Silva, RD

Identificadores de autor

Ciência ID
561A-878D-536F
ORCID iD
0000-0003-3665-9571

Endereços de correio eletrónico

  • ruben.silva@ctn.tecnico.ulisboa.pt (Profissional)
  • silva.ruben.dm@gmail.com (Pessoal)

Domínios de atuação

  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Bioquímica
  • Ciências Exatas - Química - Química Orgânica
  • Ciências Exatas - Química - Química Nuclear

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Inglês Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Português (Idioma materno)
Formação
Grau Classificação
2020/10/01 - 2024/09/30
Em curso
Chemistry (Doutoramento)
Especialização em Medicinal Chemistry
Universidade de Lisboa Instituto Superior Tecnico Campus Tecnológico e Nuclear, Portugal
2020/10/26 - 2020/10/30
Concluído
Curso de Formação em Proteção e Segurança Radiológica (Título de especialista)
Especialização em Técnico Operador - Nível III
Universidade de Lisboa Instituto Superior Tecnico Campus Tecnológico e Nuclear, Portugal
18 valores
2017/12/14
Concluído
Mestrado em Bioquímica (Mestrado)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
"Estudo da Influência do pH e Temperatura na Estrutura Secundária de Agregados de Poliglutaminas" (TESE/DISSERTAÇÃO)
16
2015/01/16
Concluído
Licenciatura em Bioquímica (Licenciatura)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
"Phytoremediation of soils contaminated with heavy metals by energy crops" (TESE/DISSERTAÇÃO)
14
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2024/11/01 - 2025/10/31 Estagiário de Investigação (Investigação) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
Associate Laboratory Institute for Health and Bioeconomy, Portugal
(...)
2019/10/01 - 2020/09/30 Assistente de Investigação (carreira) (Investigação) Universidade de Lisboa Instituto Superior Tecnico Campus Tecnológico e Nuclear, Portugal
Centro de Ciências e Tecnologias Nucleares, Portugal
2018/10/01 - 2019/06/30 Estagiário de Investigação (Investigação) Centro de Ciências e Tecnologias Nucleares, Portugal
Centro de Ciências e Tecnologias Nucleares, Portugal
2015/09/01 - 2015/11/18 Gestão de Ciência e Tecnologia REQUIMTE, Portugal
Rede de Química e Tecnologia Laboratório Associado para a Química Verde, Portugal

Outros

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2020/10/01 - 2025/09/30 PhD fellowship Universidade de Lisboa Instituto Superior Tecnico Campus Tecnológico e Nuclear, Portugal
Universidade de Lisboa Instituto Superior Tecnico Campus Tecnológico e Nuclear, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2022/01 - 2024/12 Uma abordagem molecular e nano direcionada à interface RANK-TRAF6 para tratamento de metástases ósseas
173460PRJ
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2020/10/01 - 2024/09/30 Targeting of cationic amino acid transporters with radiometallated amino acids for cancer theranostics
2020.04978.BD
Universidade de Lisboa Centro de Ciências e Tecnologias Nucleares, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso

Projeto

Designação Financiadores
2022/01/01 - 2024/12/31 A molecular and nano approach to target the RANK-TRAF6 interface for bone metastases treatment
PTDC/QUI-OUT/3854/2021
Universidade de Lisboa Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Portugal

Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento, Portugal

Universidade de Lisboa Centro de Ciências e Tecnologias Nucleares, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
Produções

Publicações

Artigo em conferência
  1. Fernando, Ana Luísa Almaça da Cruz; Mendes, Benilde Simões; Silva, Rúben; Duarte, Maria Paula Amaro de Castilho. "Phytoremediation response of Arundo donax in soils contaminated with zinc and chromium, 2nd year results". Trabalho apresentado em 19th international Conference for Renewable Resources and Plant Biotechnology, Poznan, 2014.
    Publicado
Artigo em revista
  1. Marco Cavaco; Clara Pérez-Peinado; Javier Valle; Ruben D.M. Silva; Lurdes Gano; João D.G. Correia; David Andreu; Miguel A.R.B. Castanho; Vera Neves. "The use of a selective, nontoxic dual-acting peptide for breast cancer patients with brain metastasis". Biomedicine & Pharmacotherapy (2024): http://dx.doi.org/10.1016/j.biopha.2024.116573.
    10.1016/j.biopha.2024.116573
  2. Ana Salomé Veiga; Iris Cadima-Couto; Alexandra Tauzin; João M. Freire; Ruben Silva; Clara Perez-Peinado; Catarina Cunha-Santos; et al. "Anti-HIV-1 activity and mode of action of a viral-derived and proteolysis-resistant peptide targeting the chemokine receptor CXCR4". Biophysical Journal (2024): http://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2023.11.1107.
    10.1016/j.bpj.2023.11.1107
  3. Sofia A. Martins; Joana Santos; Rúben D. M. Silva; Cátia Rosa; Sandra Cabo Verde; João D. G. Correia; Rita Melo. "How promising are HIV-1-based virus-like particles for medical applications". Frontiers in Cellular and Infection Microbiology 12 (2022): http://dx.doi.org/10.3389/fcimb.2022.997875.
    10.3389/fcimb.2022.997875
  4. Rúben D. M. Silva; João Franco Machado; Kyle Gonçalves; Francisco M. Lucas; Salete Batista; Rita Melo; Tânia S. Morais; João D. G. Correia. "Ultrasonication Improves Solid Phase Synthesis of Peptides Specific for Fibroblast Growth Factor Receptor and for the Protein-Protein Interface RANK-TRAF6". Molecules (2021): https://doi.org/10.3390/molecules26237349.
    10.3390/molecules26237349
  5. Silva, R.D.M. "Bioconjugate Supramolecular Pd2+ Metallacages Penetrate the Blood Brain Barrier In Vitro and In Vivo.". Bioconjugate chemistry (2021): https://doi.org/10.1021/acs.bioconjchem.0c00659.
    10.1021/acs.bioconjchem.0c00659
  6. Silva, R. "Anti-HIV-1 Activity of pepRF1, a Proteolysis-Resistant CXCR4 Antagonist Derived from Dengue Virus Capsid Protein". ACS Infectious Diseases (2020): http://dx.doi.org/10.1021/acsinfecdis.9b00507.
    10.1021/acsinfecdis.9b00507
  7. Silva, R. "To What Extent Do Fluorophores Bias the Biological Activity of Peptides? A Practical Approach Using Membrane-Active Peptides as Models". Frontiers in Bioengineering and Biotechnology 8 (2020): http://dx.doi.org/10.3389/fbioe.2020.552035.
    10.3389/fbioe.2020.552035
  8. Cavaco, Marco Calvinho; Garcia, Javier Valle; Silva, R; Correia, João Domingos Galamba; Castanho, Miguel Augusto Rico Botas; Martinez, David Andreu; Neves, Vera Luísa Santos. "DPepH3, an Improved Peptide Shuttle for Receptor-independent Transport across the Blood-Brain Barrier". Current Pharmaceutical Design (2020): http://dx.doi.org/10.2174/1381612826666200213094556.
    Publicado • 10.2174/1381612826666200213094556
  9. Franco Machado, João; Silva, Rúben; Melo, Rita; G. Correia, João. "Less Exploited GPCRs in Precision Medicine: Targets for Molecular Imaging and Theranostics". Molecules 24 1 (2018): 49. http://dx.doi.org/10.3390/molecules24010049.
    Publicado • 10.3390/molecules24010049
  10. Melo, Rita; Lemos, Agostinho; Preto, António J.; Bueschell, Beatriz; Matos-Filipe, Pedro; Barreto, Carlos; Almeida, José G.; et al. "An overview of antiretroviral agents for treating HIV infection in paediatric population". Current Medicinal Chemistry 25 (2018): http://dx.doi.org/10.2174/0929867325666180904123549.
    Publicado • 10.2174/0929867325666180904123549
Poster em conferência
  1. Silva, R.D.M. "Cationic amino acid-based technetium(I)-99m complexes for cancer imaging". Trabalho apresentado em 21st European Symposium on Radiopharmacy & Radiopharmaceuticals, 2024.
  2. Silva, R. "Preliminary results on thermally-induced denaturation of ß-sheet structure of polyglutamine aggregates". Trabalho apresentado em Integrative Approaches to Protein Folding & Aggregation, 2019.
Tese / Dissertação
  1. Silva, Rúben. "Silva, R. D. M. D. (2017). Estudo da Influência do pH e Temperatura na Estrutura Secundária de Agregados de Poliglutaminas". Mestrado, Universidade Nova de Lisboa Departamento de Química, 2017. https://run.unl.pt/handle/10362/27975.

Propriedade Intelectual

Patente
  1. Silva, R.D.M. 2023. "Methods for Identifying Blood Brain Barrier Peptide Shuttles". Portugal.
    Pendente
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2024/12/11 Pyrazolyl Tracers: Novel Amino Acid-Containing Radiotracers for Cancer Theranostic C2TN Workshop
Centro de Ciências e Tecnologias Nucleares (Loures, Portugal)
2023/11/29 Evaluating the activity of CXCR4 and D2R-targeting peptides using the TRUPATH platform XVIII Iberian Peptide Meeting
Centro de Ciências e Tecnologias Nucleares (Sesimbra, Portugal)
2022/09/06 Radiation for Health... what? CARISMA III – 3rd Summer School of C2TN
Center for Nuclear Sciences and Technologies (Loures, Portugal)
2021/07/08 Exploiting tumor metabolic needs for the design of nuclear imaging tools using amino acid vectors. Thematic StrandRadiopharmaceutical Sciences and Health Physics Workshop 2021
Centro de Ciências e Tecnologias Nucleares (Loures, Portugal)
2020/02/06 Thermally-induced denaturation of ß-sheet structure of Polyglutamine 17th Iberian Peptide Meeting
Instituto de Química Física Rocasolano (Espanha)
2019/06/12 Preliminary results on thermally-induced denaturation of ß-sheet structure of polyglutamine aggregates (poster presentation) Integrative Approaches to Protein Folding & Aggregation
Faculty of Sciences of the University of Lisbon (Lisboa, Portugal)
2018/10/18 Studies of the secondary structure of polyglutamine peptides Modern Methods of Structure Elucidation – 2018 (MMSE-2018)
Centro de Química Estrutural, Instituto Tecnológico e Nuclear (Lisbon, Portugal)
2018/06 Peptide Synthesis and Purification Process MEDICIS-Promed Summer School
MEDICIS-Promed (Lisbon, Portugal)
2010/05 Projecto Physalis 18º Concurso Jovens Cientistas e Investigadores
Electricity Museum (Lisbon, Portugal)

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação)
Instituição / Organização
2023/11/27 - 2023/11/29 The Iberian Peptide Meeting is a biannual event with a history spanning decades, organized to foster exchange and collaboration between the Portuguese and Spanish research communities working on peptide science. The meeting covers varied fields, ranging from peptide synthesis to structural characterization and to biological interactions and activity. (2023/11/27 - 2023/11/29)
Conferência (Membro da Comissão Organizadora)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento
Nome do evento
Instituição / Organização
2021/08/02 - 2021/08/20 The E-Learning Course was organized by the Nuclear Training and Education Center, the Korea Atomic Energy Research Institute (KAERI), and the World Council on Isotopes(WCI) in cooperation with the International Atomic Energy Agency (IAEA).
Oficina (workshop)
KAERI-WCI-IAEA E-Learning Course on Diagnostic and Therapeutic Radioisotopes and Radiopharmaceuticals Application
International Atomic Energy Agency, Áustria
2020/02/05 - 2020/02/07 17th Iberian Peptide Meeting, IQFR-IQM-CSIC, Madrid, on February 5th to 7th 2020
Conferência
17th Iberian Peptide Meeting
Instituto de Química Física Rocasolano, Espanha
2019/06/11 - 2019/06/12 Workshop on Interactive Approaches to Protein Folding & Aggregation, with poster presentation, by Facult of Sciences of the University of Lisbon
Oficina (workshop)
Interactive Approaches to Protein Folding & Aggregation
Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal
2018/10/15 - 2018/10/19 Modern Methods of Structure Elucidation (MMSE) is the annual national training site on modern spectroscopic analytical techniques intended for Bachelor, Master and Ph.D. Students, Post-docs and Young Researchers from the Universities, as well as Researchers/Spectroscopists from the Industrial Laboratories across the country. This event is organized by the Centro de Química Estrutural – Instituto Superior Técnico – Universidade de Lisboa (CQE–IST), in collaboration with the IST/ITN – Campus Tecnológico e Nuclear.
Oficina (workshop)
Modern Methods of Structure Elucidation (MMSE) 2018
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto Superior Tecnico Campus Tecnológico e Nuclear, Portugal

Tutoria

Tópico Nome do aluno
2022/10/01 - 2023/09/01 Novel peptides aimed at interacting with the intracellular domain of dopamine receptor type 2. Inês Teodósio Vicente
2023/02/01 - 2023/05/01 Aminoacidos radio-marcados para a teranostica de cancro Rodrigo Costa
2021/09/01 - 2023/02/17 Synthesis, characterization, and biological evaluation of peptides capable of interfering with RANK-TRAF6 pathway using nuclear imaging. Kyle Manuel Ferreira Gonçalves
2021/09/01 - 2022/12/01 Development of new molecular probes for imaging of cancer Afonso André Morais Belchior
2021/10/01 - 2022/10/01 Inhibition of protein-protein interactions in dopamine receptors with peptides towards pharmacological activity Francisco Marques Lucas
2021/04/01 - 2021/10/01 Design of novel peptides that interact with G-protein coupled receptors Cátia Filipa Gouveia Rosa
2020/02/03 - 2020/04/30 Expressão de Transportadores catiónicos CAT-1 e ATB0,+ em linhas celulares tumorais. Sara Ferreira
2019/01/21 - 2019/02/28 Síntese e avaliação biológica de péptido para interferência na via RANK-TRAF6 Joana Galhano
2019/01/21 - 2019/02/28 Síntese e avaliação biológica de um péptido contendo uma “cell-penetrating sequence” e uma sequência capaz de interferir na via RANK-TRAF6 Susana Parreiras