Identificação
Identificação pessoal
- Nome completo
- Maryam Abbasi
Identificadores de autor
- Ciência ID
- 4317-9113-7F7C
- ORCID iD
- 0000-0002-9011-0734
Domínios de atuação
- Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação - Ciências da Computação
Idiomas
| Idioma | Conversação | Leitura | Escrita | Compreensão | Peer-review |
|---|---|---|---|---|---|
| Português | Utilizador independente (B2) | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador independente (B2) | Utilizador independente (B2) | |
| Inglês | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador proficiente (C1) | |
| Iraniano (Outras) | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador proficiente (C1) |
Formação
| Grau | Classificação | |
|---|---|---|
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2019/03/18
Concluído
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Ciências e Tecnologias da Informação (Doutoramento)
Especialização em Sem especialidade
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
"Formulação, Algoritmos e Aplicação de Alinhamento de Sequências Multiobjetivo" (TESE/DISSERTAÇÃO)
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2008/02/17
Concluído
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Computer Science (Mestrado)
University of Tehran, Irão
"The Relationship between Genome Sequence and Its Resistance to Ionizing Radiation" (TESE/DISSERTAÇÃO)
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2005/02/03
Concluído
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Computer Science (Licenciatura)
University of Tehran, Irão
"Computational NeuroScience" (TESE/DISSERTAÇÃO)
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Percurso profissional
Docência no Ensino Superior
| Categoria Profissional Instituição de acolhimento |
Empregador | |
|---|---|---|
| 2025/10/01 - Atual | Assistente (Docente Ensino Superior Politécnico) | Instituto Politécnico de Santarém Escola Superior de Gestão e Tecnologia de Santarém, Portugal |
| Instituto Politécnico de Santarém, Portugal |
Outros
| Categoria Profissional Instituição de acolhimento |
Empregador | |
|---|---|---|
| 2026/02/01 - Atual | Auxiliary Researcher (Career Researcher) - permanent position | Instituto Politécnico de Santarém, Portugal |
| Instituto Politécnico de Santarém Escola Superior de Gestão e Tecnologia de Santarém, Portugal |
Projetos
Bolsa
| Designação | Financiadores | |
|---|---|---|
| 2013/09 - 2017/09 | SFRH/BD/91451/2012
SFRH/BD/91451/2012
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Fundação para a Ciência e a Tecnologia |
| 2012/01 - 2013/12 | RepSys - Representation systems with quality guarantees for multi-objective optimization problems | DAAD/CRUP Bilateral Cooperation Research Project |
| 2010/04 - 2013/09 | MOSAL - Multi-objective Sequence Alignment | Stichting Weten |
Projeto
| Designação | Financiadores | |
|---|---|---|
| 2019/06/18 - 2022/06/18 | D4 - Deep Drug Discovery and Deployment
C492608778-00087672
Investigador
Universidade de Coimbra Centro de Informatica e Sistemas, Portugal
|
Concluído
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| 2005/06 - 2011/01 | E-learning Management System for University of Tehran
000000
0and1 Information Technology - R&D department (researcher and consultant in AI solutions)
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Produções
Publicações
| Artigo em conferência |
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| Artigo em revista |
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| Capítulo de livro |
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| Resumo em conferência |
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| Tese / Dissertação |
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Atividades
Apresentação oral de trabalho
| Título da apresentação | Nome do evento Anfitrião (Local do evento) |
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|---|---|---|
| 2022/04/23 | Invited Speaker with the presentation entitled “The challenges of using Generative Deep Learning for de novo drug discovery” at the 4th Retreat Neuroscience and Disease of Centre for Innovative Biomedicine and Biotechnology (CIBB), Coimbra, 23 May 2022 | 4th Retreat Neuroscience and Disease of Centre for Innovative Biomedicine and Biotechnology (CIBB), Coimbra,
(coimbra, Portugal)
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| 2021/06/09 | Reinforcement Learning with Multi-Objective Optimization in Targeted Drug Design | 55th Annual Scientific Meeting - ESCI Virtual 2021
(Bélgica)
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Orientação
| Título / Tema Papel desempenhado |
Curso (Tipo) Instituição / Organização |
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|---|---|---|
| 2021/01/01 - 2025/01/01 | Deep Learning in Drug Design: Application and Algorithms
Coorientador
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Universidade de Coimbra Centro de Informatica e Sistemas, Portugal
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| 2022/09 - 2022/09 | Deep Modelling for Anticancer Drug Response Prediction with Therapeutic Data
Orientador
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Engenharia Biomédica (Mestrado)
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
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| 2021/09/01 - 2022/08/31 | VARIANT - Predict the effect of genetic variants on a given drug
Coorientador
|
Universidade de Coimbra Departamento de Engenharia Informática, Portugal
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| 2021/09/01 - 2022/08/31 | Docking based strategy for the evaluation of deep learning generative models
Orientador
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Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal
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| 2021/09/01 - 2022/08/31 | LSTM based SMILES Generator for Cancer Drugs
Orientador
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Projecto (Outra)
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
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| 2021/09 - 2022/07/31 | Docking based strategies for the validation of deep learning generative models - And the search for novel ligands for A2aR,
JAK2, KOR AND USP7.
Orientador
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Bioquímica (Mestrado)
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
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| 2021/09/01 - 2022/07/28 | Deep Modelling for Anticancer Drug Response Prediction with Therapeutic Data
Orientador
|
Mesterado (Mestrado)
Universidade de Coimbra Departamento de Engenharia Informática, Portugal
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| 2020/02 - 2022/07 | Docking based strategies for the validation of deep learning generative models - And the search for novel ligands for A2aR,
JAK2, KOR AND USP7.
Orientador
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Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal
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| 2022 - 2022 | End-to-End Transformer-based Approach for Optimized De Novo Drug Design
Coorientador
|
Engenharia Biomédica (Mestrado)
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
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| 2020/09/30 - 2021/09/09 | Drug Discovery with Generative Adversarial Networks
Coorientador
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Universidade de Coimbra Departamento de Engenharia Informática, Portugal
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| 2020/09 - 2021/07 | Multi-Objective Deep Reinforcement Learning in Drug Discovery
Orientador
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Engenharia Biomédica (Mestrado)
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
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| 2019/09 - 2020/07 | Recurrent Models for Drug Generation
Coorientador
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Engenharia Informática (Mestrado)
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
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| 2020 - 2020 | Neural networks for 2D representations of cell expression
Coorientador
|
Engenharia Biomédica (Mestrado)
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
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| 2019/01/01 - 2019/07/30 | Generative Models for Drug Discovery
Coorientador
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Universidade de Coimbra Centro de Informatica e Sistemas, Portugal
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Organização de evento
| Nome do evento Tipo de evento (Tipo de participação) |
Instituição / Organização | |
|---|---|---|
| 2020/10/01 - 2020/10/15 | Member of organizer of Summer School in Computational Biology 2020 (2020/10/01 - 2020/10/15)
Oficina (workshop) (Membro da Comissão Organizadora)
|
Universidade de Coimbra, Portugal |
Participação em evento
| Descrição da atividade Tipo de evento |
Nome do evento Instituição / Organização |
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|---|---|---|
| 2015/07 - Atual | Participation awarded with grant in 1st KEYSTONE Training School Keyword Search over Big Data, 20-24 July 2015, Faculty of ICT, University of Malta, Malta | 1st KEYSTONE Training School
Université de Sherbrooke Bibliothèque Roger-Maltais, Canadá
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| 2016/05/05 - 2016/05/15 | Participation in Computational Biology Summer School, September 5-15, 2016, Coim- bra, Portugal. |
Universidade de Coimbra Departamento de Física, Portugal
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| 2013/06/10 - 2013/06/16 | Participation in the Artificial Evolution Summer School (AESS2013) on Evolutionary algorithms, metaheuristics, Continuous and combinatorial optimization, 10–14 June 2013, Quiberon, France | Artificial Evolution Summer School (AESS2013) |
| 2006/07 - 2006/08 | Participation in the USU-CMU Summer School on Dependable Computer Systems | Università della SvizzeraUniversità |
Curso / Disciplina lecionado
| Disciplina | Curso (Tipo) | Instituição / Organização | |
|---|---|---|---|
| 2022/09 - Atual | Inteligência Artificial | (Licenciatura) | Instituto Superior Miguel Torga, Portugal |
| 2022/09 - Atual | Sistemas Operativos | (Licenciatura) | Instituto Superior Miguel Torga, Portugal |
| 2022/09 - Atual | Sistemas de Apoio à Decisão | Instituto Superior Miguel Torga, Portugal | |
| 2022/09 - Atual | Qualidade em Sistemas de Informação | (Licenciatura) | Instituto Superior Miguel Torga, Portugal |
| 2022/09 - Atual | Introdução à Programação | (Licenciatura) | Instituto Politécnico de Coimbra Instituto Superior de Engenharia de Coimbra, Portugal |
| 2022/03/01 - 2022/07/30 | segurança Informática | Seguranca Informatica (Bacharelato) | Instituto Superior de Contabilidade e Administração de Coimbra , Portugal |
| 2021/09/01 - 2022/02/15 | Teoria da Informaçao | Teoria da Informaçao (Bacharelato) | Universidade de Coimbra Departamento de Engenharia Informática, Portugal |
| 2020/09/15 - 2021/02/28 | Compiladores | (Bacharelato) | Universidade de Coimbra Centro de Informatica e Sistemas, Portugal |
| 2007/09 - 2010/09 | tic | Data Base, Data simulation, Data Storage & Retrieval, Computer Graphics and Neural Networks (Licence) |
Expedição científica
| Descrição da atividade | Instituição / Organização | |
|---|---|---|
| 2004/09 - 2005/09 | Member of the UTGA Team (University of Tehran Genetic Algorithms team) Working on Bio-Inspired Computing techniques. Implementation of "Genetic Algorithms" under supervision of Professor ¿Ali Masoudi-Nejad |
Distinções
Prémio
| 2004 | computer science graduate school |
| 1998 | National Olympiad in Physics |
| 1998 | National Olympiad in Informatics |
Outra distinção
| 2022 | Recommendation from 0and1 (https://bit.ly/3YVKmqP)
0and1 Information Technology (on the department of AI solutions), Irão
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