Bárbara Beatriz Sousa (3819-2E52-DFE0)

Curriculum Vitae

Bárbara Beatriz Sousa

Bárbara Beatriz Costa Botelho Sousa holds a PhD in Medicinal Chemistry from the University of Lisbon and the University of Cambridge, where her research focused on designing covalent molecules and protein degraders targeting blood cancer-related proteins, specifically TEC kinases and serine hydrolases. She completed an MSc in Biochemistry at Nova University of Lisbon, where she studied the crystal structure of BMX linked to covalent ligands, and earned a Bachelor's degree in Biology from the University of Azores, characterising the enzymatic activity of thermophilic bacteria for industrial applications. Currently a postdoctoral researcher at the University of Melbourne, Bárbara specializes in drug discovery, leveraging her expertise to advance therapeutic strategies for both cancer and infectious diseases. She has contributed to 10 peer-reviewed publications, four of which as first-author, and has presented her work at multiple international conferences. Bárbara has also supervised students, secured competitive grants, and participated in interdisciplinary research collaborations, particularly in cancer and drug discovery.

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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo: Bárbara Beatriz Sousa

Nomes de citação

Bárbara B. Sousa

Identificadores de autor

Ciência ID: 3819-2E52-DFE0
ORCID iD: 0000-0002-2567-1826

Endereços de correio eletrónico

bbs580@outlook.com (Profissional)

Moradas

1G Royal Parade, 3052, Parkville, VIC, Austrália (Profissional)

Domínios de atuação

Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Bioquímica
Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Microbiologia
Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia Molecular
Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biofísica
Ciências da Engenharia e Tecnologias - Biotecnologia Industrial
Ciências Médicas e da Saúde - Medicina Básica - Química Médica

Idiomas

Idioma	Conversação	Leitura	Escrita	Compreensão	Peer-review
Inglês	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)
Francês	Utilizador independente (B1)	Utilizador independente (B1)	Utilizador independente (B1)	Utilizador independente (B1)	Utilizador independente (B1)

Formação

	Grau	Classificação
2019/09/01 - 2023/12/07 Concluído	CAML - PhD (Doutoramento) Especialização em Medicinal Biochemistry Instituto de Medicina Molecular, Portugal
2020/02 - 2020/02 Concluído	CONGENTO Rodent Necropsy Workshop (Diploma de especialização) Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
2019/11 - 2020/01 Concluído	CONGENTO Course on Laboratory Animal Science (Function A) (Diploma de especialização) Instituto de Medicina Molecular, Portugal	18
2019/11 - 2019/12 Concluído	SPCAL 20h Theoretical Course on Laboratory Animal Sciences (Category B) (Diploma de especialização) Instituto de Medicina Molecular, Portugal	18
2016 - 2018 Concluído	Biochemistry for Health (Mestrado) Especialização em Biochemistry Universidade Nova de Lisboa, Portugal "Crystal structure of Bone Marrow Tyrosine Kinase from Chromosome X with covalent ligands" (TESE/DISSERTAÇÃO)	17
2013 - 2016 Concluído	Biologia (Licenciatura) Especialização em Biotecnologia Universidade dos Açores Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal "Characterization of the enzymatic activity of thermophilic bacteria" (TESE/DISSERTAÇÃO)	16

Percurso profissional

Ciência

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2024/01/15 - 2025/01/15	Pós-doutorado (Investigação)	The University of Melbourne Faculty of Medicine Dentistry and Health Sciences, Austrália
	Walter and Eliza Hall Institute of Medical Research, Austrália
2019/01/01 - 2019/08/31	Investigador (Investigação)	Instituto de Medicina Molecular, Portugal
	Universidade de Lisboa Faculdade de Medicina, Portugal

Outros

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2019/09/01 - 2023/12/07	PhD student at GBernardes Lab	Universidade de Lisboa Faculdade de Medicina, Portugal
	Universidade de Lisboa Faculdade de Medicina, Portugal
2022/01 - 2023/03	Visiting student	University of Cambridge Department of Chemistry, Reino Unido
	University of Cambridge Department of Chemistry, Reino Unido

Projetos

Bolsa

	Designação	Financiadores
2017 - Atual	BMX-targeted ligand-drug conjugates for prostate cancer therapy 702428 Bolseiro de Mestrado Instituto de Medicina Molecular, Portugal	European Commission Concluído
2022/05 - 2025/04	Mapeamento de glicoARN utilizando estratégias de “click chemistry” e sequenciação Provided by PTCRIS: PTDC/MED-QUI/4160/2021	Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2021/10 - 2024/09	PROTACS de ligação covalente reversível para a degradação de proteínas para terapia de cancro Provided by PTCRIS: PTDC/MED-QUI/1947/2020	Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2019/09 - 2023/02	Combinatorial Antibody Synthesis for the discovery of Targeted Immunomodulators Provided by PTCRIS: SFRH/BD/143583/2019	Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2019/01/01 - 2023/01/01	Site-selective protein-modification chemistries for antibody-drug conjugates (ADCs) 852985 Investigador	European Commission Concluído

Produções

Publicações

Artigo em revista

Bárbara B. Sousa; Matthew W. A. Dixon. "Cellular insights into the transmission pathways of Plasmodium falciparum". (2025):
Bárbara B. Sousa; Rebelo, Maria. "Advanced solutions to address the therapeutic gap in Malaria". (2025):
Hannah Kiely-Collins; Tang, Cong; Bárbara B. Sousa; Gonçalo J L Bernardes. Autor correspondente: Gonçalo J L Bernardes. "Chemoproteomics-enabled Discovery of a Selective TRPV2 Antagonist based on the Natural Product Piperlongumine". (2025):
Luís A. R. Carvalho; Bárbara B. Sousa; Daniel Zaidman; Hannah Kiely-Collins; Gonçalo J. L. Bernardes. "Design and Evaluation of PROTACs Targeting Acyl Protein Thioesterase 1". ChemBioChem (2024): https://doi.org/10.1002/cbic.202300736.
10.1002/cbic.202300736
Méndez, Yanira; Vasco, Aldrin V.; Ivey, Galway; Dias, Ana Laura; Gierth, Peter; Sousa, Bárbara B.; Navo, Claudio D.; et al. "Merging the Isonitrile-Tetrazine (4+1) Cycloaddition and the Ugi Four-Component Reaction into a Single Multicomponent Process". Angewandte Chemie International Edition 62 44 (2023): http://dx.doi.org/10.1002/anie.202311186.
10.1002/anie.202311186
Gomes, Rafael F. A.; Gonçalves, Bruno M. F.; Andrade, Késsia H. S.; Sousa, Bárbara B.; Maulide, Nuno; Bernardes, Gonçalo J. L.; Afonso, Carlos A. M.. "Unlocking the Potential of Bio-Based Nitrogen-Rich Furanic Platforms as Biomass Synthons". Angewandte Chemie International Edition (2023): http://dx.doi.org/10.1002/anie.202304449.
Publicado • 10.1002/anie.202304449
Sousa, Bárbara B.; de Almeida, Cátia Rebelo; Barahona, Ana F.; Lopes, Raquel; Martins-Logrado, Ana; Cavaco, Marco; Neves, Vera; et al. "Selective Inhibition of Bruton’s Tyrosine Kinase by a Designed Covalent Ligand Leads to Potent Therapeutic Efficacy in Blood Cancers Relative to Clinically Used Inhibitors". ACS Pharmacology & Translational Science 5 11 (2022): 1156-1168. http://dx.doi.org/10.1021/acsptsci.2c00163.
10.1021/acsptsci.2c00163
Istrate, Alena; Geeson, Michael B.; Navo, Claudio D.; Sousa, Barbara B.; Marques, Marta C.; Taylor, Ross J.; Journeaux, Toby; et al. "Platform for Orthogonal N-Cysteine-Specific Protein Modification Enabled by Cyclopropenone Reagents". Journal of the American Chemical Society 144 23 (2022): 10396-10406. http://dx.doi.org/10.1021/jacs.2c02185.
10.1021/jacs.2c02185
Pumroy, Ruth A.; Protopopova, Anna D.; Fricke, Tabea C.; Lange, Iris U.; Haug, Ferdinand M.; Nguyen, Phuong T.; Gallo, Pamela N.; et al. "Structural insights into TRPV2 activation by small molecules". Nature Communications 13 1 (2022): http://dx.doi.org/10.1038/s41467-022-30083-3.
10.1038/s41467-022-30083-3
Kohs, Tia C. L.; Olson, Sven R.; Pang, Jiaqing; Jordan, Kelley R.; Zheng, Tony J.; Xie, Aris; Hodovan, James; et al. "Ibrutinib Inhibits BMX-Dependent Endothelial VCAM-1 Expression In Vitro and Pro-Atherosclerotic Endothelial Activation and Platelet Adhesion In Vivo". Cellular and Molecular Bioengineering 15 3 (2022): 231-243. http://dx.doi.org/10.1007/s12195-022-00723-1.
10.1007/s12195-022-00723-1
Conde, João; Pumroy, Ruth A.; Baker, Charlotte; Rodrigues, Tiago; Guerreiro, Ana; Sousa, Bárbara B.; Marques, Marta C.; et al. "Allosteric Antagonist Modulation of TRPV2 by Piperlongumine Impairs Glioblastoma Progression". ACS Central Science 7 5 (2021): 868-881. http://dx.doi.org/10.1021/acscentsci.1c00070.
10.1021/acscentsci.1c00070
Sousa, Bárbara B.; Sousa, Marcos F. Q.; Marques, Marta C.; Seixas, João D.; Brito, José A.; Matias, Pedro M.; Bernardes, Gonçalo J. L.; Roldão, António. "A scalable insect cell-based production process of the human recombinant BMX for in-vitro covalent ligand high-throughput screening". Bioprocess and Biosystems Engineering 44 1 (2020): 209-215. http://dx.doi.org/10.1007/s00449-020-02421-6.
Acesso aberto • 10.1007/s00449-020-02421-6
Seixas, João D.; Sousa, Bárbara B.; Marques, Marta C.; Guerreiro, Ana; Traquete, Rui; Rodrigues, Tiago; Albuquerque, Inês S.; et al. "Structural and biophysical insights into the mode of covalent binding of rationally designed potent BMX inhibitors". RSC Chemical Biology 1 4 (2020): 251-262. http://dx.doi.org/10.1039/d0cb00033g.
Acesso aberto • 10.1039/d0cb00033g

Tese / Dissertação

"Targeting blood cancer-related proteins: Rational design of covalent molecules and degraders for TEC kinases and serine hydrolases". Doutoramento, Universidade de Lisboa Faculdade de Medicina, 2024.
"Crystal structure of bone marrow tyrosine kinase from chromosome X with covalent ligands". Mestrado, Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, 2018.

Atividades

Apresentação oral de trabalho

	Título da apresentação	Nome do evento Anfitrião (Local do evento)
2019/09	Biochemical and Biophysical Characterization of the Human Recombinant BMX with Covalent Inhibitors	Nova Biophysica Universidade Nova de Lisboa (Lisbon, Portugal)
2018/06/06	Biochemical and Biophysical characterization of human BMX, a therapeutic target for prostate cancer	Biophysics Party Instituto de Tecnologia Química e Biológica (Lisbon, Portugal)

Participação em evento

	Descrição da atividade Tipo de evento	Nome do evento Instituição / Organização
2024/02/18 - 2024/02/22	Molecular Approaches to Malaria (MAM) 2024 Conference, Victoria Australia. Conferência	Molecular Approaches to Malaria (MAM) 2024 Conference The University of Melbourne Faculty of Medicine Dentistry and Health Sciences, Austrália
2023/01/12 - 2023/01/13	3rd PSL Chemical Biology Symposium, Paris, France Conferência	3rd PSL Chemical Biology Symposium, Paris, France Institut Curie, França
2022/04 - 2022/04	(Poster) Targeting disease-related proteins: The design of serine hydrolases degraders. Conferência	Ubiquitin and Friends, Vienna, Austria Research Center for Molecular Medicine of the Austrian Academy of Sciences, Áustria
2021 - 2021	(Poster) The importance of selectively target a cysteine in B-cell cancers. Conferência	Bringing Chemical Biology to Cancer Research Royal Society of Chemistry, Reino Unido
2021 - 2021	(Poster) From prostate to B-cell cancers: the importance of cysteine modification	Interfacing Chemical Biology and Drug Discovery, RICT Société de Chimie Thérapeutique, França
2020/09/03 - 2020/09/05	(Poster) Rationally designed potent BMX inhibitors reveals mode of covalent binding at the atomic level. Conferência	EMBO Workshop: Chemical Biology 2020 Gesellschaft zur Förderung der Lebenswissenschaften Heidelberg GmbH, Alemanha

Revisão ad hoc de artigos em revista

	Nome da revista (ISSN)	Editora
2023 - Atual	Journal Drug Discovery Today (1878-5832)

Distinções

Prémio

2022	Poster prize at Ubiquitin and Friends conference, Austria
2020	EMBO Travel Grant Gesellschaft zur Förderung der Lebenswissenschaften Heidelberg GmbH, Alemanha
2020	ACORN Travel Grant for international conferences European Commission, Bélgica
2019	EMBO Travel Grant Gesellschaft zur Förderung der Lebenswissenschaften Heidelberg GmbH, Alemanha
2017	Medal of honour in Biology Universidade dos Açores, Portugal

Título

2019	FCT PhD Scholarship (SFRH/BD/143583/2019) Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal