Sílvia Carneiro Alves (311C-2F74-E3EE)

Curriculum Vitae

Sílvia Carneiro Alves

Sílvia Carneiro Alves. Concluiu o(a) Licenciatura em Engenharia Agrária - 2º ciclo do curso bi-etápico em 2007 pelo(a) Instituto Politécnico de Santarém Escola Superior Agrária, Bacharelato em Engenharia Agrária - 1º ciclo do curso bi-etápico em 2004 pelo(a) Instituto Politécnico de Santarém Escola Superior Agrária, Bacharelato em Biotecnologia em 2001 pelo(a) Grupo Lusófona, Doctor of Philosophy em Doutoramento em 2015 pelo(a) John Innes Centre e Doctor of Philosophy em Doutoramento em 2015 pelo(a) University of East Anglia. Frequenta o(a) Mestrado em Bioinformática e Biologia Computacional pelo(a) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências. É Pós-doutorado no(a) Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária - Pólo de Santarém . Publicou 6 artigos em revistas especializadas. Possui 1 capítulo(s) de livros. Recebeu 5 prémio(s) e/ou homenagens. Participa e/ou participou como Bolseiro de Doutoramento em 1 projeto(s), Bolseiro de Investigação em 4 projeto(s) e Bolseiro de Pós-Doutoramento em 1 projeto(s). Atua na(s) área(s) de Ciências Exatas com ênfase em Ciências da Computação e da Informação com ênfase em Bioinformática, Ciências Exatas com ênfase em Matemática com ênfase em Estatística e Probabilidades, Ciências Agrárias com ênfase em Biotecnologia Agrária e Alimentar com ênfase em Seleção com Base em Marcadores Moleculares, Ciências Naturais com ênfase em Ciências Biológicas com ênfase em Biologia do Desenvolvimento, Ciências Agrárias com ênfase em Biotecnologia Agrária e Alimentar com ênfase em Tecnologia da Manipulação Genética, Ciências Agrárias com ênfase em Biotecnologia Agrária e Alimentar com ênfase em Biotecnologia Agrária e Biotecnologia Alimentar e Ciências Naturais com ênfase em Ciências Biológicas com ênfase em Biologia. Nas suas atividades profissionais interagiu com 34 colaborador(es) em coautorias de trabalhos científicos. No seu currículo Ciência Vitae os termos mais frequentes na contextualização da produção científica, tecnológica e artístico-cultural são: Agronomy; Agricultural Biotecnhology; Cereal Crops; Pollen flow; GMO; Genetically Modified Organism; Maize; Zea mays; Mon810; Transgenic Crops; Food; Risk assessment; Transgenes; Agrobacterium tumefaciens; Cereal Genetic Transformation; Barley; Hordeum vulgare; Brachypodium; Brachypodium distachyon; Bd21; Golden Promise; Functional Genomics; Genomic Selection; Wheat; Triticum durum; Durum Wheat; Triticum aestivum; Bread Wheat; Pedigree Selection; GBS; Genotyping By Sequence; Plant Breeding; Genetic Marker; Genome; Genetics; Marker-assisted Selection; Biostatistics; Linear Models; Multivariate Models; Breeding Value; Genetic Gain; BLUP; Best Linear Unbiased Prediction; BLUE; Best Linear Unbiased Estimate; Fixed Effects; Random Effects; Trait; Marker Effect; Matrix Algebra; Algorithms; Inbreeding; Estimation; Prediction; Additive Effects; Heritability; Environmental Effects; Accuracy; EBV; Estimated Breeding Value; SNP; GBLUP; Mixed Linear Models; Quantitative Genetics; Breeding Program Simulation; Computer Simulation; Computational Modelling; AlphaSimR; Stochastic Model; Computation; Programming; R Language; Flowering Time; Flowering Transition; Shoot Apical Meristem; Photoperiod Induction Pathway; Temperate Cereals; APETALA1; LEAFY; FLOWERING LOCUS T; Circadian Clock; Environmental Sensing; Signal Transduction; Plant Biology; Plant Genetics; Plant Developmental Biology; Tissue Culture; Gateway-Cloning; Gene Silencing; Plant Biotechnology; Molecular Biology; artificial micro-RNA; Gene Expression; Genetic Engineering; PCR; Salinity; Plant Physiology; Beta maritima; Sea Beet; Somatic Embryogenesis; Callus Induction; Light Signal Transduction; Agrobacterium-mediated Cereal Transformation; Flower Development; Yield; Crop Improvement; .

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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo: Sílvia Carneiro Alves

Nomes de citação

Alves, Sílvia C.

Identificadores de autor

Ciência ID: 311C-2F74-E3EE
ORCID iD: 0000-0001-8587-3377

Endereços de correio eletrónico

silvia.alves@esa.ipsantarem.pt (Profissional)

Moradas

Dep. Tecnologia Alimentar, Biotecnologia e Nutrição, Escola Superior Agrária - Instituto Politécnico de Santarém, Quinta do Galinheiro, S. Pedro, 2001-904, Santarém, Santarém, Portugal (Profissional)

Websites

https://twitter.com/DrSilviaAlves (Rede social)

Domínios de atuação

Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação - Bioinformática
Ciências Exatas - Matemática - Estatística e Probabilidades
Ciências Agrárias - Biotecnologia Agrária e Alimentar - Seleção com Base em Marcadores Moleculares
Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia do Desenvolvimento
Ciências Agrárias - Biotecnologia Agrária e Alimentar - Tecnologia da Manipulação Genética
Ciências Agrárias - Biotecnologia Agrária e Alimentar - Biotecnologia Agrária e Biotecnologia Alimentar
Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia

Idiomas

Idioma	Conversação	Leitura	Escrita	Compreensão	Peer-review
Inglês	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)
Português	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)

Formação

	Grau	Classificação
2021 Em curso	Bioinformática e Biologia Computacional (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2019 Concluído	Quantitative methods in plant breeding (Outros) Especialização em Quantitative genetics National Institute of Agricultural Botany, Reino Unido
2018 Concluído	Advanced Course - Multivariate Statistics for Ecology and Evolution (Outros) Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal
2018 Concluído	Data Carpentry Workshop - Genomic Data (Outros) Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
2018 Concluído	Empreendedorismo e Spin-off em Biotecnologia e Recursos Genéticos Animais (Outros) Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária - Pólo de Santarém , Portugal
2017 Concluído	Summer School - Science Communication (Outros) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências Sociais e Humanas, Portugal
2017 Concluído	Summer School - R Programming (Outros) Especialização em R language Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências Sociais e Humanas, Portugal
2015 Concluído	Doutoramento (Doctor of Philosophy) University of East Anglia, Reino Unido John Innes Centre, Reino Unido "Floral induction in Brachypodium distachyon" (TESE/DISSERTAÇÃO)	n/a
2007 Concluído	Engenharia Agrária - 2º ciclo do curso bi-etápico (Licenciatura) Especialização em Produção Hortofrutícola Instituto Politécnico de Santarém Escola Superior Agrária, Portugal "Improved Agrobacterium tumefaciens-mediated barley (Hordeum vulgare L.) transformation" (TESE/DISSERTAÇÃO)	16 (média final licenciatura: 15)
2004 Concluído	Engenharia Agrária - 1º ciclo do curso bi-etápico (Bacharelato) Instituto Politécnico de Santarém Escola Superior Agrária, Portugal "Efeitos da utilizacao de milho geneticamente modificado nos ecossitemas agricolas: Despistagem de transgenes e estudo do fluxo e da vantagem selectiva do polen de variedades de milho Bt" (TESE/DISSERTAÇÃO)	14
2001 Concluído	Biotecnologia (Bacharelato) Grupo Lusófona, Portugal "Resposta a salinidade de Beta maritima L. e avaliacao da potencial reversao dos efeitos do cloreto de sodio por diferentes formas de nutricao azotada" (TESE/DISSERTAÇÃO)	14

Percurso profissional

Ciência

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2018 - 2020	Pós-doutorado (Investigação)	Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária - Pólo de Santarém , Portugal

2018 - 2018	Investigador visitante (Investigação)	The University of Edinburgh The Roslin Institute, Reino Unido

2008 - 2012	Investigador (Investigação)	John Innes Centre - Cell & Developmental Biology Department, Reino Unido

2007 - 2008	Investigador (Investigação)	John Innes Centre - Crop Genetics Department, Reino Unido

2006 - 2006	Estagiário de Investigação (Investigação)	John Innes Centre - Crop Genetics Department, Reino Unido

2004 - 2004	Estagiário de Investigação (Investigação)	Instituto Politécnico de Santarém Escola Superior Agrária, Portugal

2000 - 2000	Estagiário de Investigação (Investigação)	Instituto Nacional de Investigação Agrária - Estação Agronómica Nacional, Portugal

Docência no Ensino Superior

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2019 - Atual	Monitor (Docente Universitário)	Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

2019 - Atual	Assistente convidado (Docente Ensino Superior Politécnico)	Instituto Politécnico de Santarém Escola Superior Agrária, Portugal

Outros

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2015 - 2016	Events & Science Communication	Pavilhão do Conhecimento - Centro Ciência Viva, Portugal

2003 - 2006	Events & Science Communication	Pavilhão do Conhecimento - Centro Ciência Viva, Portugal

Projetos

Projeto

	Designação	Financiadores
2020 - 2020	REMIRUCULA - Caracterização da resistência ao míldio na cultura da Rúcula PTDC/ASP-PLA/28963/2017 Investigador Pós-doutorado Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal	European Union Governo de Portugal Concluído
2018 - 2020	FASTBREED - Implementation of a bread and durum wheat breeding program based on genomic selection ALT20-03-0145-FEDER-000018 Bolseiro de Pós-Doutoramento Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal	European Union Governo de Portugal Concluído
2008 - 2012	Signal integration during floral induction in a new monocot system SFRH/BD/40575/2007 Bolseiro de Doutoramento John Innes Centre, Reino Unido University of East Anglia, Reino Unido	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2007 - 2008	BrachyTAG - Genetic transformation of Brachypodium distachyon to study genes controlling shoot development Marie Curie Host Fellowships (EST) FP6-2004-MOBILITY-2-19727 Bolseiro de Investigação John Innes Centre, Reino Unido	European Commission Sixth Framework Programme EU Framework Programme for Research and Innovation Marie Sklodowska-Curie Actions Concluído
2004 - 2004	Efeitos da utilização de milho geneticamente modificado nos ecossistemas agrícolas: despistagem de transgenes e estudo do fluxo e da vantagem selectiva do polen de variedades de milho Bt Programa AGRO - Medida 8 - Acção 8.1 - Desenvolvimento Experimental e Demonstração Bolseiro de Investigação Instituto Politécnico de Santarém Escola Superior Agrária, Portugal	Governo de Portugal Concluído
2000 - 2000	Projecto PIDDAC 110/98 - Culturas hortícolas alternativas para aproveitamento de solos salgados. Optimização da produção e estudos de qualidade PIDDAC 110/98 Bolseiro de Investigação Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal	Governo de Portugal Concluído

Outro

	Designação	Financiadores
2006 - 2007	Agrobacterium-mediated barley transformation Biotechnology Resources for Arable Crop Transformation (BRACT) Bolseiro de Investigação John Innes Centre, Reino Unido	Biotechnology and Biological Sciences Research Council Concluído

Produções

Publicações

Artigo em revista	Alves, Sílvia C.; Serra, Octávio. "Previsão dos valores genéticos em programas de melhoramento de trigo (Dossier Técnico)". Vida Rural - Revista Profissional de Agronegócios (2019): 36-39. Acesso aberto • Publicado Alves, Sílvia C.. "Modelos computacionais para a simulação do programa nacional de melhoramento de trigo (Dossier Técnico)". Vida Rural - Revista Profissional do Agronegócio (2019): 40-41. Acesso aberto • Publicado Alves, Sílvia C.; Fernanda Simões; Octávio Serra. "Novas Estratégias no Melhoramento do Trigo". AGROTEC 30 (2019): 66-67. Acesso aberto • Publicado Alves, Sílvia C; Worland, Barbara; Thole, Vera; Snape, John W; Bevan, Michael W; Vain, Philippe. "A protocol for Agrobacterium-mediated transformation of Brachypodium distachyon community standard line Bd21". Nature Protocols 4 5 (2009): 638-649. http://dx.doi.org/10.1038/nprot.2009.30. Publicado • 10.1038/nprot.2009.30 Thole, Vera; Alves, Sílvia C; Worland, Barbara; Bevan, Michael W; Vain, Philippe. "A protocol for efficiently retrieving and characterizing flanking sequence tags (FSTs) in Brachypodium distachyon T-DNA insertional mutants". Nature Protocols 4 5 (2009): 650-661. http://dx.doi.org/10.1038/nprot.2009.32. Publicado • 10.1038/nprot.2009.32 Vain, Philippe; Worland, Barbara; Thole, Vera; McKenzie, Neil; Alves, Silvia C.; Opanowicz, Magdalena; Fish, Lesley J.; Bevan, Michael W.; Snape, John W.. "Agrobacterium-mediated transformation of the temperate grass Brachypodium distachyon (genotype Bd21) for T-DNA insertional mutagenesis". Plant Biotechnology Journal 6 3 (2008): 236-245. http://dx.doi.org/10.1111/j.1467-7652.2007.00308.x. Acesso aberto • Publicado • 10.1111/j.1467-7652.2007.00308.x Bartlett, Joanne G; Alves, Sílvia C; Smedley, Mark; Snape, John W; Harwood, Wendy A. "High-throughput Agrobacterium-mediated barley transformation". Plant Methods 4 1 (2008): 22. http://dx.doi.org/10.1186/1746-4811-4-22. Acesso aberto • Publicado • 10.1186/1746-4811-4-22
Capítulo de livro	Harwood, Wendy A.; Bartlett, Joanne G.; Alves, Sílvia C.; Perry, Matthew; Smedley, Mark A.; Leyl, Nicola; Snape, John W.. "Barley Transformation Using Agrobacterium-Mediated Techniques". In Transgenic Wheat, Barley and Oats*, 137-147. Humana Press, 2008. Publicado • 10.1007/978-1-59745-379-0_9
Poster em conferência	Alves, Sílvia C.; Seiya Goto; Tomoaki Fujioka; Takahiro Akimoto; Hiromi Masuko-Suzuki; Masao Watanabe; Go Suzuki; Keita Suwabe. "Improving the Agrobacterium-mediated transformation protocol for Brachypodium distachyon". Trabalho apresentado em International Plant & Animal Genome - XX Conference, 2012. Alves, Sílvia C.. "High throughput Agrobacterium-mediated transformation of Brachypodium distachyon (Line Bd21) for insertional mutagenesis". Trabalho apresentado em International Plant & Animal Genome - XVI Conference, 2008. Alves, Sílvia C.. "The Effect of Introns on Transgene Expression in Barley". Trabalho apresentado em International Plant & Animal Genome - XVI Conference, 2008. Alves, Sílvia C.. "High throughput transformation of the temperate grass Brachypodium distachyon (line Bd21) for functional genomics". Trabalho apresentado em Garnet2007 meeting, 2007. Alves, Sílvia C.. "High-throughput Agrobacterium-mediated barley transformation". Trabalho apresentado em Plant Transformation Technologies Conference, 2007. Alves, Sílvia C.. "High-throughput Agrobacterium-mediated transformation". Trabalho apresentado em NIAB's Small Grain Cereals meeting, 2007. Alves, Sílvia C.. "Transformação genética de cevada (Hordeum vulgare L.) mediada por Agrobacterium tumefaciens". Trabalho apresentado em 2ª Jornadas de Engenharia Agrária, 2006. Alves, Sílvia C.; José Leal; Fátima Quedas; António Moutinho; José Mediana de Sousa; Eugénia de Andrade Silva; Fátima Lopes. "Coexistência de milhor GM e convencional - fluxos de pólen". Trabalho apresentado em Jornadas do dia das Ciências, 2005.
Recurso online	Alves, Sílvia C.. JIC-TDNA-BdAA3 Brachypodium distachyon T-DNA Flanking Sequence Tag Brachypodium distachyon genomic clone JIC-TDNA-BdAA3, DNA sequence. Accession No. EF165098. 2007. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucgss/EF165098. Alves, Sílvia C.. JIC-BdAA1-FST1 FST of Brachypodium Bd21 T-DNA insertion lines Brachypodium distachyon genomic clone BdAA1-FST1, DNA sequence. Accession No. ER987315. 2007. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucgss/ER987315. Alves, Sílvia C.. JIC-BdAA13-FST1 FST of Brachypodium Bd21 T-DNA insertion lines Brachypodium distachyon genomic clone BdAA13-FST1, DNA sequence. Accession No. ER987316. 2007. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucgss/ER987316. Alves, Sílvia C.. JIC-BdAA13-FST2 FST of Brachypodium Bd21 T-DNA insertion lines Brachypodium distachyon genomic clone BdAA13-FST2, DNA sequence. Accession No. ER987317. 2007. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucgss/ER987317. Alves, Sílvia C.. JIC-BdAA17-FST2 FST of Brachypodium Bd21 T-DNA insertion lines Brachypodium distachyon genomic clone BdAA17-FST2, DNA sequence. Accession No. ER987318. 2007. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucgss/ER987318.
Tese / Dissertação	Alves, Sílvia C.. "Floral induction in Brachypodium distachyon". Doutoramento, University of East Anglia, 2012. Alves, Sílvia C.. "Improvement of Agrobacterium-mediated barley transformation". Licenciatura, Instituto Politécnico de Santarém Escola Superior Agrária, 2007. Alves, Sílvia C.. "Efeitos da utilização de milho geneticamente modificado nos ecossistemas agrícolas: despistagem de transgenes e estudo do fluxo e da vantagem selectiva do pólen de variedades de milho Bt.". Licenciatura, Instituto Politécnico de Santarém Escola Superior Agrária, 2004.

Atividades

Apresentação oral de trabalho

	Título da apresentação	Nome do evento Anfitrião (Local do evento)
2019	Implementation of Genomic Selection in the Portuguese wheat breeding program	VIII Bioinformatics Open Days 2019 Universidade do Minho (Braga, Portugal)
2019	Selecção Genómica em Trigo	A Europa na minha região Dia Aberto do Projecto FASTBREED (Elvas, Portugal)
2011	Signal integration during floral induction in a new monocot system	CDB Seminar John Innes Centre (Norwich, Reino Unido)
2007	Transformação genética de cevada (Hordeum vulgare L.) mediada por Agrobacterium tumefaciens	n/a Instituto Politécnico de Santarém - Escola Superior Agrária (Santarém, Portugal)
2006	Improvement of Agrobacterium-mediated barley transformation	CG Seminar John Innes Centre (Norwich, Reino Unido)
2001	Resposta a salinidade de Beta maritima L. e avaliação da potencial reversão dos efeitos do cloreto de sódio por diferentes formas de nutrição azotada	n/a Instituto Superio de Humanidades e Tecnologias (Lisboa, Portugal)

Curso / Disciplina lecionado

	Disciplina	Curso (Tipo)	Instituição / Organização
2021 - Atual	Recursos Genéticos & Biotecnologia Agrária	Engenharia Agronómica (Mestrado integrado)	Instituto Politécnico de Santarém Escola Superior Agrária, Portugal
2019 - Atual	Genética de Procariotas	Biologia (Licenciatura)	Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2019 - Atual	Biologia	Tecnologias de Produção Integrada em Hortofrutícolas (Curso Técnico Superior Profissional)	Instituto Politécnico de Santarém Escola Superior Agrária, Portugal
2020 - 2020	Recursos Genéticos & Biotecnologia Agrária	Engenharia Agronómica (Pós-Graduação)	Instituto Politécnico de Santarém Escola Superior Agrária, Portugal
2020 - 2020	Microbiologia	Viticultura e Enologia (Curso Técnico Superior Profissional)	Instituto Politécnico de Santarém Escola Superior Agrária, Portugal

Distinções

Outra distinção

2019	Post-doc Researcher European Union, Bélgica Governo de Portugal, Portugal
2018	Post-doc Research Fellowship Governo de Portugal, Portugal European Union, Bélgica
2008	Scherago International Student Travel Grant
2008	Ph.D. Research Fellowship Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
2007	Marie Curie EST Fellowship European Commission Sixth Framework Programme, Bélgica
2000	Bolsa do Programa de Desenvolvimento Educativo para Portugal European Union, Bélgica Governo de Portugal, Portugal