Mário Miguel Cardoso Mendes, preparou a sua dissertação de Doutoramento em Geociências (Paleobotânica e Palinologia) na Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade Nova de Lisboa e no Swedish Museum of Natural History (Estocolmo - Suécia). Em 2011, prestou provas de Doutoramento na Universidade de Évora, tendo sido aprovado por unanimidade com a menção de Distinção e Louvor (Summa Cum Laude). Em 1998 concluiu o Mestrado em Fisiologia e Bioquímica de Plantas na Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, tendo sido aprovado por unanimidade com a menção de Muito Bom (Summa Cum Laude). Em 1995 concluiu a Licenciatura em Biologia e Geologia na Universidade de Évora, com a classificação de 16 valores.