Identificação
Identificação pessoal
- Nome completo
- Ana Alexandra de Portugal dos Santos Pereira
Nomes de citação
- Santos-Pereira, Ana
Identificadores de autor
- Ciência ID
- 2116-C946-F047
- ORCID iD
- 0000-0001-6410-7972
Endereços de correio eletrónico
- anasantospereira@med.uminho.pt (Profissional)
Domínios de atuação
- Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação - Bioinformática
Idiomas
| Idioma | Conversação | Leitura | Escrita | Compreensão | Peer-review |
|---|---|---|---|---|---|
| Inglês | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador proficiente (C1) |
| Português (Idioma materno) |
Formação
| Grau | Classificação | |
|---|---|---|
|
2016/09/15 - 2022/01/25
Concluído
|
Programa Interuniversitário de Doutoramento Em Envelhecimento e Doenças Crónicas (Doutoramento)
Universidade do Minho, Portugal
"Impact of HIV-1 genetic diversity on the interaction with host cells" (TESE/DISSERTAÇÃO)
|
Muito Bom |
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2015/10 - 2016/08/08
Concluído
|
Curso de Formação Especializada em Programação de Computadores para Reconversão de
Licenciados (Outros)
Universidade do Minho, Portugal
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17 |
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2012/10 - 2015/07/15
Concluído
|
Mestrado em Genética Molecular (Mestrado)
Universidade do Minho, Portugal
"Regulation and intracellular trafficking of monocarboxylate transporters in yeast" (TESE/DISSERTAÇÃO)
|
18 |
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2009/10 - 2014/09/01
Concluído
|
Biologia Aplicada (Licenciatura)
Universidade do Minho, Portugal
|
14 |
Percurso profissional
Ciência
| Categoria Profissional Instituição de acolhimento |
Empregador | |
|---|---|---|
| 2025/07/28 - Atual | Investigador (Investigação) | Universidade do Minho, Portugal |
| Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal | ||
| 2022/09/01 - 2023/12/30 | Pós-doutorado (Investigação) | FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal |
| Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Portugal |
Outros
| Categoria Profissional Instituição de acolhimento |
Empregador | |
|---|---|---|
| 2021/07 - 2022/08 | Data Analyst | Social Data Lab, Portugal |
Projetos
Bolsa
| Designação | Financiadores | |
|---|---|---|
| 2026/06/01 - Atual | HIV-TRACER – Knowledge-Graph Guided Prediction of HIV Therapy Outcomes and Comorbidity
Risk
2CA-Braga-2026-HIV-TRACER
Investigador responsável
|
Em curso
|
| 2024/05/01 - 2025/06/01 | Simplification of HIV Tropism Tests: An AI-based Method for Predicting Virus Tropism
from Routine Sequencing Data (AIV-Tropism)
2CA-Braga-2024-HIV-Tropism
Investigador
Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
|
2CA-Braga
Em curso
|
| 2016 - 2021 | Impact of HIV-1 genetic diversity on the interaction with host cells
PD/BD/127827/2016
Bolseiro de Doutoramento
Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
|
Projeto
| Designação | Financiadores | |
|---|---|---|
| 2025/04/01 - 2026/03/31 | Malaria Therapeutic Failure Prediction using Machine Learning
2024.07292.IACDC
Universidade do Minho, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
|
| 2021/01/01 - 2025/12/31 | ICVS/3B¿s - Laboratório Associado, Instituto de Ciências da Vida e da Saúde / Grupo
de Investigação em Biomateriais, Biodegradaveis e Biomiméticos
LA/P/0050/2020
UID/Multi/50026/2019
Universidade do Minho, Portugal
Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal |
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
|
| 2024/03/11 - 2024/12/31 | ICVS/3B's - Associate Laboratory
UIDB/50026/2020
Universidade do Minho, Portugal
Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal |
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
|
| 2020/01/01 - 2024/12/31 | Biosystems and Integrative Sciences Institute
UIDB/04046/2020
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Portugal
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal Universidade do Minho, Portugal Universidade de Lisboa Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas, Portugal FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal |
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
|
| 2022/09/01 - 2023/12/30 | Aproximações baseadas em apredizagem profunda em grafos para medicina personalizada
EXPL/CCI-BIO/0126/2021
Bolseiro de Pós-Doutoramento
FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal
Universidade de Lisboa Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas, Portugal Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Portugal LASIGE Laboratório de Sistemas Informáticos de Grande Escala, Portugal |
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
|
| 2018 - 2020 | Impacto da diversidade genética do VIH-1 na imunodeficiência
PGG/009/2017
Investigador
Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
|
Gilead Sciences GesmbH
Concluído
|
Produções
Publicações
| Artigo em revista |
|
| Recurso online |
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Atividades
Apresentação oral de trabalho
| Título da apresentação | Nome do evento Anfitrião (Local do evento) |
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|---|---|---|
| 2024/07/04 | “Simplification of HIV Tropism Tests: An AI-based Method for Predicting Virus Tropism from Routine Sequencing Data” |
Life and Health Sciences Research Institute (ICVS)
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| 2023/03/17 | ngest: A Scalable Snakemake Pipeline for Customized Knowledge Graph construction | Bioinformatics Open Days
Universidade do Minho (Braga, Portugal)
|
| 2022/03/03 | Impact of HIV-1 genetic diversity on the interaction with host cells. | Bioinformatics Open Days
Universidade do Minho (Braga, Portugal)
|
| 2021/08/27 | Mutações de resistência antirretroviral ao HIV no Brasil (invited speaker) | XXV Congreso Latinoamericano de Microbiología
(Paraguai)
|
| 2019/03/19 | SPINET (Syndemic Protein Interaction NETwork): aweb server for HIV, M. tuberculosis and host protein-protein interaction networks | EBM Open Meeting
(Porto)
|
| 2018/03/16 | SPINET (Syndemic Protein InteractionNETwork): a web server for HIV, M. tuberculosis and host protein-protein interaction networks - Oral communication and poster presentation | Bioinformatics Open Days
Universidade do Minho
|
Organização de evento
| Nome do evento Tipo de evento (Tipo de participação) |
Instituição / Organização | |
|---|---|---|
| 2026/01/30 - Atual | Member of the organizing committee Neglected Tropical Diseases and Malaria - International Virtual Seminar (2026/01/30) | |
| 2025/12/10 - 2025/12/12 | Transnational Project Meeting (TPM) and Learning, Teaching, and Training (LTTA) activity, Erasmus+ "MicroLabSecure" (2025/12/10 - 2025/12/12) | |
| 2022 - 2022 | Member of the organizing commitee of the event X PhDOC Annual Meeting at the School
of Medicine (University of Minho) (2022/03/25 - 2022/03/25)
Encontro (Membro da Comissão Organizadora)
|
|
| 2019 - 2019 | Member of the organizing commitee of the event "EBM Open Meeting", on March 19th,
Hotel Eurostars, Porto, Portugal (2019/03/19)
Encontro (Coorganizador)
|
|
| 2018 - 2018 | Member of the organizing commitee of the VII PhDOC Retreat at the School of Medicine
(University of Minho) (2018/10/18 - 2018/10/19)
Encontro (Membro da Comissão Organizadora)
|
Participação em evento
| Descrição da atividade Tipo de evento |
Nome do evento Instituição / Organização |
|
|---|---|---|
| 2026/01/30 - Atual | Invited speaker of on the Neglected Tropical Diseases and Malaria (International Virtual
Seminar) with the presentation "Malaria Therapeutic Failure Prediction using Machine
Learning"
Seminário
|
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| 2025/12/04 - 2025/12/06 | First author of the poster "PyHIV: A Python package for local HIV-1 sequence alignment, subtyping and gene splitting" | Microbiotec 2025 |
| 2025/12/04 - 2025/12/06 | Co-author of the poster “Predictive Model for Artemether-Lumefantrine Treatment Failure For Uncomplicated Plasmodium falciparum Malaria.” Microbiotec 2025, 4–6 Dec 2025 | |
| 2025/12/04 - 2025/12/06 | Co-author of the poster “Unlocking Malaria Treatment Failure Prediction:An AI-Powered Analysis of Parasite morphodynamics in Thick Blood Smear” Microbiotec 2025, 4–6 Dec 2025 | |
| 2025/12/04 - 2025/12/06 | Co-author of the poster “Reduced Efficacy of Artemether-Lumefantrine for Uncomplicated Plasmodium falciparum Malaria in Luanda, Angola” Microbiotec 2025, 4–6 Dec 2025. | |
| 2025/12/04 - 2025/12/06 | Co-author of the poster “PyHIV-Resist: a reproducible Python tool for clinical resistance scoring of antiretroviral therapy from HIV sequences” Microbiotec 2025, 4–6 Dec 2025. | |
| 2025/12/04 - 2025/12/06 | Co-author of the poster “AI-Based Prediction of HIV-1 Drug Resistance from Partial pol Sequences: Genome-wide DRM Inference and Prediction” Microbiotec 2025, 4–6 Dec 2025. | |
| 2024/11/24 - 2024/11/27 | First author of the oral presentation “A Evolução da Resistência Antirretroviral no
Brasil e o Destaque do Tenofovir" presented at Congresso Brasileiro de Epidemiologia
(presented by Bernardino Souto)
Congresso
|
Congresso Brasileiro de Epidemiologia |
| 2024/06/01 - 2024/06/04 | First author of the poster “A Machine Learning Tool to Predict Gene-Phenotype Associations”
presented at the European Human Genetics Conference
Conferência
|
European Human Genetics Conference
European Society of Human Genetics, Áustria
|
| 2023/06/10 - 2023/06/13 | First author of the poster "An automated pipeline for standardized biomedical knowledge
graph construction" in the European Human Genetics Conference, organized by the European
Society of Human Genetics.
Conferência
|
European Human Genetics Conferenc |
| 2019/09/21 - 2019/09/25 | Co-author of the scientific poster "Epidemiologia da resistência antirretroviral do
HIV-1 no brasil entre 2008 e 2017"
Congresso
|
Congresso da Sociedade Brasileira de DST, VIII Congresso Brasileiro de AIDS e III Congresso Latino Americano IST/HIV/AIDS |
| 2019/09/21 - 2019/09/25 | Co-author of the scientific presentation "Epidemiologia molecular do HIV-1 no Brasil:
elevada prevalência do subtipo C na região Sul"
Congresso
|
Congresso da Sociedade Brasileira de DST, VIII Congresso Brasileiro de AIDS e III Congresso Latino AmericanoI ST/HIV/AIDS |
| 2019/06/30 - 2019/07/03 | First author of the scientific poster "Unveiling the synergistic mechanisms of M.
tuberculosis andHIV-1 through SPINET, a protein-protein interaction network analysis
tool"
Congresso
|
Annual Meeting of the European Society of Mycobacteriology |
| 2019/05/11 - 2019/05/11 | Participation on the EVOBIOMED Social Hackthon in collaboration with Banco Alimentar
Contra a Fome, on May 11th.
Outro
|
EVOBIOMED Social Hackthon |
| 2019/03/27 - 2019/03/27 | Participation on the "Laboratórios abertos" initiative during the "Semana da Microbiologia
e Infeção"
Outro
|
Semana da Microbiologia e Infeção |
| 2019/02/20 - 2019/02/22 | First author of the scientific poster " SPINET (Syndemic Protein Interaction NETwork):
a web serverfor HIV, M. tuberculosis and host protein-protein interaction networks"
Congresso
|
Bioinformatics Open Days |
