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Ana Santos is a microbiologist with expertise in clinical microbiology, antimicrobial resistance, and One Health approaches, holding a European PhD in Pharmaceutical Sciences (specialisation in Microbiology) from the Faculty of Pharmacy, University of Porto. Her research addresses the epidemiology, population structure, and genomic determinants of antimicrobial resistance in Enterococcus spp. across clinical, commensal, and environmental contexts. Within this framework, her work has particularly focused on vancomycin-resistant Enterococcus faecium, investigating resistance mechanisms, plasmid dynamics, and the distribution of antimicrobial resistance genes among both healthy individuals and hospitalised patients. She also studies the bacteriocinome of Enterococcus spp., exploring its role in microbial competition and its potential for alternative antimicrobial strategies. Ana has a strong background in classical and molecular microbiology, genomics, and bioinformatic analysis of bacterial whole-genome sequencing data. During a traineeship at the University Medical Center Utrecht (The Netherlands), she received specialised training with the Medical Microbiology Bio-IT group, applying state-of-the-art pipelines and tools for genome assembly and annotation, population structure analysis, pangenomics, GWAS, and plasmid reconstruction. Her research output includes 12 peer-reviewed publications and two under review, including an Editor’s Choice article in Microorganisms. She has presented over 30 communications (oral presentations and posters) at prestigious national and international congresses including the Congress of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ESCMID) and International Meeting on Microbial Epidemiological Markers (IMMEM). Her work has been consistently recognised through four ESCMID travel grants awarded over four consecutive years. She is an active peer reviewer for the Journal of Global Antimicrobial Resistance and has also served as a reviewer for the European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases, Microbial Pathogenesis, and Scientific Reports.
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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Ana Cristina Fidalgo Almeida Santos
Data de nascimento
1996/02/09
Género
Feminino

Nomes de citação

  • Ana C. Almeida-Santos

Identificadores de autor

Ciência ID
1F1A-506E-D0FA
ORCID iD
0000-0001-6711-4780

Endereços de correio eletrónico

  • acfasantos@gmail.com (Profissional)
  • up201404762@up.pt (Profissional)

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Microbiologia
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia Celular
  • Ciências Médicas e da Saúde - Ciências da Saúde - Nutrição e Dietética
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Genética e Hereditariedade
  • Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação - Bioinformática

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês Utilizador independente (B2) Utilizador independente (B2) Utilizador independente (B2) Utilizador independente (B2) Utilizador independente (B2)
Formação
Grau Classificação
2021/04/01 - 2025/06/17
Concluído
 PhD in Pharmaceutical Sciences (Doutoramento)
Especialização em Microbiology
Universidade do Porto Faculdade de Farmácia, Portugal
 Aprovado por unanimidade
2017/09/21 - 2019/12/09
Concluído
 Ciências do Consumo e Nutrição (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Universidade do Porto Faculdade de Ciências da Nutrição e Alimentação, Portugal
"Oral microbiome characterization in patients with type 2 Diabetes Mellitus and diet as an influencing factor" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 17
2014/09/09 - 2017/06/17
Concluído
 Biologia (Licenciatura)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
 15
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2026/05/01 - Atual Investigador (Investigação) Bundesgesundheitsamt Robert von Ostertag-Institut, Alemanha
2025/07 - 2026/04 Pós-doutorado (Investigação) UCIBIO - Applied Molecular Biosciences Unit, Faculty of Pharmacy of Porto, Portugal, Portugal
2021/04/01 - 2025/07/17 Investigador (Investigação) Fellowship funded by FCT - Fundação para a Ciência e a Tecnologia UI/BD/151317/2021, Portugal, Portugal
Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
2016/09/05 - 2017/06/09 Estagiário de Investigação (Investigação) Universidade do Porto Instituto de Investigação e Inovação em Saúde, Portugal
Universidade do Porto Instituto de Investigação e Inovação em Saúde, Portugal

Docência no Ensino Superior

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2026/02/01 - 2026/04/30 Assistente Convidado (Docente Universitário) Universidade do Porto Faculdade de Farmácia, Portugal
Universidade do Porto Faculdade de Farmácia, Portugal

Outras Carreiras

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2020/11 - 2021/03 Assessor (Técnico Superior de Saúde - Laboratório) Centro de Investigação médica da FMUP (CIM-FMUP) / Hospital São João., Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2022 - Atual Exploring the bacteriocinome of human Enterococcus faecium paving avenues towards multidrug-resistant infections targeted therapies
EXPL/SAU-INF/0261/2021
Bolseiro de Doutoramento
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído

Projeto

Designação Financiadores
2025/06 - Atual Dynamics of antimicrobial resistance, gene transfer and temperature variation in Enterococcus spp. from cattle ecosystems in Northern Portugal
DYNAMIC-E-GI2-CESPU-2025
Investigador Pós-doutorado
Cooperativa de Ensino Superior Politécnico e Universitário CRL
Em curso
2024 - Atual APPLE - Assessing Prevalence, Population structure and resistance mechanisms of Linezolid-resistant Enterococci - a multicenter study
ESCMID SG Research Grant APPLE
 European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases
Em curso
2021/04/01 - 2025/03/31 Understanding the plasmidome and bacteriocinome of human contemporary Enterococcus spp. for future targeted therapies against multidrug-resistant infections
UI/BD/151317/2021
10.54499/UI/BD/151317/2021
Bolseiro de Doutoramento
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso

Outro

Designação Financiadores
2023 - 2024 MicroMundo @ UPorto: an educational service-learning project for education in Microbiology.
MicroMundo@UPorto
Em curso
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. Almeida-Santos, Ana C.; Tedim, Ana P.; Duarte, Bárbara; Pereira, Ana P.; Silva, Luís M.; Teixeira, Júlio; Castro, Ana P.; et al. "Twelve years of genomic surveillance of vancomycin-resistant Enterococcus faecium: emergence of linear vanA and bacteriocin-carrying plasmids challenging infection control". Genome Medicine 18 1 (2026): https://doi.org/10.1186/s13073-026-01656-4.
    10.1186/s13073-026-01656-4
  2. Vázquez-Ucha, Juan C.; Almeida-Santos, Ana C.; Velasco, David; Rodríguez-Pallares, Salud; Outeda-García, Michelle; Rodríguez-Coello, Arianna; Fernández, Ana; et al. "Enterococcus thailandicus: Genomic evidence of a potential new player in enterococcal virulence and antimicrobial resistance". New Microbes and New Infections (2026): 101711. https://doi.org/10.1016/j.nmni.2026.101711.
    10.1016/j.nmni.2026.101711
  3. Almeida-Santos, Ana C; Tedim, Ana P; Duarte, Bárbara; Silva, Luís M; Teixeira, Júlio; Castro, Ana P; Novais, Carla; Peixe, Luísa; Freitas, Ana R. "Unnoticed spread of linear VanA-plasmids in vancomycin-variable Enterococcus faecium strains across different regions: a diagnostics challenge". Journal of Antimicrobial Chemotherapy (2025): https://doi.org/10.1093/jac/dkaf409.
    10.1093/jac/dkaf409
  4. Pereira, Ana P.; Ana C. Almeida-Santos; Duarte, Bárbara; Antunes, Patrícia; Peixe, Luísa; Freitas, Ana R.; Novais, Carla. "Insights towards the impact of subinhibitory chlorhexidine on antimicrobial susceptibility and horizontal gene transfer in Enterococcus faecium". Science of The Total Environment 972 (2025): 179064. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2025.179064.
    Publicado • 10.1016/j.scitotenv.2025.179064
  5. Ana C. Almeida-Santos; Carla Novais; Luísa Peixe; Ana R. Freitas. "Vancomycin-resistant Enterococcus faecium: A current perspective on resilience, adaptation, and the urgent need for novel strategies". Journal of Global Antimicrobial Resistance (2025): https://doi.org/10.1016/j.jgar.2025.01.016.
    10.1016/j.jgar.2025.01.016
  6. Ana C. Almeida-Santos; Bárbara Duarte; Ana P. Tedim; Maria J. Teixeira; Joana C. Prata; Rui M. S. Azevedo; Carla Novais; et al. "The healthy human gut can take it all: vancomycin-variable, linezolid-resistant strains and specific bacteriocin-species interplay in Enterococcus spp.". Applied and Environmental Microbiology (2025): https://doi.org/10.1128/aem.01699-24.
    10.1128/aem.01699-24
  7. Ana P. Tedim; Ana C. Almeida-Santos (first author in ex-aequo); Val F. Lanza; Carla Novais; Teresa M. Coque; Ana R. Freitas; Luísa Peixe; Isaac Cann. "Bacteriocin distribution patterns in Enterococcus faecium and Enterococcus lactis : bioinformatic analysis using a tailored genomics framework". Applied and Environmental Microbiology (2024): https://doi.org/10.1128/aem.01376-24.
    10.1128/aem.01376-24
  8. Wagner, Theresa Maria; Pöntinen, Anna Kaarina; Fenzel, Carolin Kornelia; Engi, Daniel; Janice, Jessin; Ana C. Almeida-Santos; Tedim, Ana P; et al. "Interactions between commensal Enterococcus faecium and Enterococcus lactis and clinical isolates of Enterococcus faecium". FEMS Microbes 5 (2024): http://dx.doi.org/10.1093/femsmc/xtae009.
    Publicado • 10.1093/femsmc/xtae009
  9. Belloso Daza, Mireya Viviana; Ana C. Almeida-Santos (first author in ex-aequo); Novais, Carla; Read, Antónia; Alves, Valquíria; Cocconcelli, Pier Sandro; Freitas, Ana R.; Peixe, Luísa. "Distinction between Enterococcus faecium and Enterococcus lactis by a gluP PCR-Based Assay for Accurate Identification and Diagnostics". Microbiology Spectrum 10 6 (2022): http://dx.doi.org/10.1128/spectrum.03268-22.
    Publicado • 10.1128/spectrum.03268-22
  10. Novais, Carla; Ana C. Almeida-Santos; Paula Pereira, Ana; Rebelo, Andreia; Freitas, Ana R.; Peixe, Luísa. "Alert for molecular data interpretation when using Enterococcus faecium reference strains reclassified as Enterococcus lactis". Gene 851 (2022): 146951. http://dx.doi.org/10.1016/j.gene.2022.146951.
    Publicado • 10.1016/j.gene.2022.146951
  11. Freitas, Ana R.; Tedim, Ana P.; Ana C. Almeida-Santos; Duarte, Bárbara; Elghaieb, Houyem; Abbassi, Mohamed S.; Hassen, Abdennaceur; Novais, Carla; Peixe, Luísa. "High-Resolution Genotyping Unveils Identical Ampicillin-Resistant Enterococcus faecium Strains in Different Sources and Countries: A One Health Approach". Microorganisms 10 3 (2022): 632. http://dx.doi.org/10.3390/microorganisms10030632.
    10.3390/microorganisms10030632
  12. Almeida-Santos, Ana C.; Novais, Carla; Peixe, Luísa; Freitas, Ana R.. Autor correspondente: Freitas, Ana R.. "Enterococcus spp. as a Producer and Target of Bacteriocins: A Double-Edged Sword in the Antimicrobial Resistance Crisis Context". Antibiotics 10 10 (2021): 1215. http://dx.doi.org/10.3390/antibiotics10101215.
    10.3390/antibiotics10101215
  13. Ana C. Almeida-Santos; Martins-Mendes, Daniela; Gayà-Vidal, Magdalena; Pérez-Pardal, Lucía; Beja-Pereira, Albano. "Characterization of the Oral Microbiome of Medicated Type-2 Diabetes Patients". Frontiers in Microbiology 12 (2021): http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2021.610370.
    10.3389/fmicb.2021.610370
Poster em conferência
  1. Inês M. Ribeiro; Ana C. Almeida-Santos; Maria J. Teixeira; Alicia Ribeiro; Carla Campos; Nuno V. Brito; Rui Dantas; et al. "Intensive cattle farms as reservoirs of hospital-associated Enterococcus faecium clones and linezolid-resistant enterococci: a One Health concern". Trabalho apresentado em ESCMID GLOBAL 2026 - Congress of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 2026.
  2. Ana C. Almeida-Santos; Juan C. Vázquez-Ucha; Andrea García-Pose; Alejandro Beceiro; Guido Werner; Jennifer K. Bender; Read, Antónia; et al. "Emergence of optrA-mediated linezolid-resistance in human clinical Enterococcus faecalis: an alert for a shifting resistance landscape in hospitals". Trabalho apresentado em ESCMID GLOBAL 2026 - Congress of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 2026.
  3. Miquel Sánchez-Osuna; Ana C. Almeida-Santos; Inmaculada Gómez-Sánchez; Judith Guitart- Matas; Aina Jiménez-Ruiz; Freitas, Ana R; Peixe, L; et al. "Genome-wide association and functional validation reveal a peptidoglycan deacetylase variant driving chlorhexidine stress adaptation in Enterococcus faecalis". Trabalho apresentado em ESCMID GLOBAL 2026 - Congress of the European Society of¿ Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 2026.
  4. Carlos Valiente-Mullor1,; Ana C. Almeida-Santos; Lidia Ruiz-Roldán1,; Regina Antoni; Alejandro Sanz; Estela Giménez; Eva Gonzalez- Barbera; et al. "Post-pandemic expansion of Enterococcus faecium strain ST117-CT7799 with spread of linear plasmids carrying vanA, optrA and cfrD in the Valencia region, Spain (2022–2024)". Trabalho apresentado em ESCMID GLOBAL 2026 - Congress of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 2026, 2026.
  5. Juan. C. Vázquez-Ucha; Ana C. Almeida-Santos; David Velasco; Duarte, Bárbara; Michelle Outeda-García; Read, Antónia; Mariana Romanholo; et al. "Misidentification of Enterococcus lactis as Enterococcus faecium: consequences for clinical diagnosis and antimicrobial stewardship". Trabalho apresentado em ESCMID GLOBAL 2026 - Congress of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 2026, 2026.
  6. Ana C. Almeida-Santos; Ana P. Tedim; Duarte, Bárbara; Luís M. Silva; Júlio Teixeira; Ana P. Castro; Carla Novais; Luísa Maria Vieira Peixe; Ana R. Freitas. "Silent dissemination of identical VanA-carrying linear plasmids in Vancomycin-Variable Enterococcus faecium: A growing diagnostic concern". Trabalho apresentado em ESCMID Global, Vienna, Austria, 2025.
  7. Juan C. Vázquez-Ucha; Ana C. Almeida-Santos; David Velasco; Salud Rodríguez-Pallares; Michelle Outeda-García; Arianna Rodríguez-Coello; Ana Fernández; et al. "Enterococcus thailandicus : Genomic evidence of a potential new player in enterococcal virulence and antimicrobial resistance". Trabalho apresentado em Congress of Microbiology and Biotechnology - MICROBIOTEC'25, 2025.
  8. Juan C. Vázquez-Ucha1; Ana C. Almeida-Santos; Andrea García-Pose; Guido Werner; Jennifer K. Bender; Read, Antónia; Romanholo, Mariana; et al. "Emergence of linezolid-resistant Enterococcus faecalis in Portugal: An alert for a changing resistance landscape in hospitals". Trabalho apresentado em Congress of Microbiology and Biotechnology - MICROBIOTEC'25, 2025.
  9. Ana C. Almeida-Santos; Ana P. Tedim; Duarte, Bárbara; Michael Brilhante; Teresa M. Coque; Novais, Carla; Ana R. Freitas; Luísa Maria Vieira Peixe. "Bacteriocin profiling of Enterococcus faecium and Enterococcus lactis: exploring the dynamic interplay between nosocomial and community isolates". Trabalho apresentado em DLM - Dia do Laboratório de Microbiologia. Faculdade de Farmácia da Universidade do Porto, 2024.
  10. Antunes, Beatriz; Ana C. Almeida-Santos; Read, Antónia; Alves, Valquíria; Novais, Carla; Peixe, L; Freitas, Ana R. "Characterization of vancomycin-resistant Enterococcus faecium causing infections in one Portuguese hospital (2022-2024)". Trabalho apresentado em III 1H-TOXRUN INTERNATIONAL CONGRESS 2024, 2024.
  11. Ana C. Almeida-Santos; Ana P. Tedim; Duarte, Bárbara; Luís M. Silva; Júlio Teixeira; Ana P. Castro; Novais, Carla; Peixe, L; Freitas, Ana R. "A challenge in antibiotic stewardship: detection of vancomycin-variable Enterococcus faecium (VVE) in human clinical and commensal samples (2009-2022)". Trabalho apresentado em III 1H-TOXRUN INTERNATIONAL CONGRESS 2024, 2024.
  12. Ana C. Almeida-Santos; Ana P. Tedim; Bárbara Duarte; Luís M. Silva; Júlio Teixeira; Ana P. Castro; Carla Novais; Luísa Maria Vieira Peixe; Ana Raquel Pinho Freitas. "Vancomycin Variable Enterococcus faecium (VVE) in human clinical and commensal samples: a challenge in antibiotic stewardship". Trabalho apresentado em ESCMID Global, Barcelona, Spain, 2024.
  13. Ana C. Almeida-Santos; Ana P. Tedim; Bárbara Duarte; Michael Brilhante; Teresa M. Coque; Carla Novais; Ana Raquel Pinho Freitas; Luísa Maria Vieira Peixe. "Beyond Antimicrobial Resistance: Competitive interactions and bacteriocin diversity in Enterococcus faecium and Enterococcus lactis". Trabalho apresentado em ESCMID Global, Barcelona, Spain, 2024.
  14. Ana R. Freitas; Ana C. Almeida-Santos; Bárbara Duarte; Antunes, Beatriz; Cabral, Maria; Read, Antónia; Alves, Valquíria; Novais, Carla; Luísa Maria Vieira Peixe. "Are you choosing the right colony? Exploring phenotypic and genotypic variations in clinical Enterococcus pure cultures". Trabalho apresentado em ESCMID Global, Barcelona, Spain, 2024.
  15. Novais, Ângela; Silva, L.; Duarte, Bárbara; Ana C. Almeida-Santos; Novais, Carla; Ana R. Freitas; Luísa Maria Vieira Peixe. "Exploring the potential of FT-IR Spectroscopy and Machine Learning to discriminate between Enterococcus faecium and Enterococcus lactis". Trabalho apresentado em ESCMID Global, Barcelona, Spain, 2024.
  16. Pereira, Ana P.; Ana C. Almeida-Santos; Antunes, Patrícia; Luísa Maria Vieira Peixe; Ana R. Freitas; Novais, Carla. "Impact of sub-inhibitory concentrations of chlorhexidine on in vitro horizontal transfer of vancomycin and linezolid resistance genes in Enterococcus faecium". Trabalho apresentado em ESCMID Global, Barcelona, Spain, 2024.
  17. Novais, Ângela; Silva, Liliana; Duarte, Bárbara; Peixe, L; Ana C. Almeida-Santos; Novais, Carla; Freitas, Ana R. "Discriminating closely related Enterococcus species via FT-IR-based biochemical profiling and machine-learning". Trabalho apresentado em 13th International Meeting on Microbial Epidemiological Markers (IMMEM XIII), 2024.
  18. Ana C. Almeida-Santos; Duarte, Bárbara; Maria J. Teixeira; Ana P. Tedim; Novais, Carla; Luísa Maria Vieira Peixe; Freitas, Ana R. "Enterococcus lactis steals the spotlight: a predominant and highly bacteriocinogenic enterococci species obtained from contemporary faecal samples of healthy humans in Portugal". Trabalho apresentado em 6th International Conference on Enterococci, 2023.
  19. Ana C. Almeida-Santos; Novais, Carla; J. A. Paganini; Malbert R. C. Rogers; Weizhen Xu; Rob JL Willems; Corander, Jukka; et al. "Genomic Insights into Enterococcus faecalis: A Comprehensive Study of Population Structure, Plasmid Distribution, and Source Associations in Portugal". Trabalho apresentado em 6th International Conference on Enterococci. Porto, Portugal, 2023.
  20. Ana C. Almeida-Santos; Duarte, Bárbara; Tedim, Ana P.; Miguel D. Fernández-de-Bobadilla; Silva, L.M.; Ramos, H.; Coque, Teresa M; et al. "Vancomycin-resistant Enterococcus faecium circulating in a Portuguese hospital (2009-2021) challenges classical infection control". Trabalho apresentado em II Toxrun International Congress 2023, 2023.
  21. Ana C. Almeida-Santos; Duarte, Bárbara; Maria João Teixeira ; Ana P. Tedim; Novais, Carla; Luísa Maria Vieira Peixe; Ana R. Freitas. "An update on faecal carriage of Enterococcus species by healthy humans unveils E. lactis as a predominant highly bacteriocinogenic species that can harbor optrA. ePoster flash presentation.". Trabalho apresentado em 33rd European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID), Copenhagen, Denmark, 2023.
  22. Ana C. Almeida-Santos; Duarte, Bárbara; Ana P. Tedim; Fernández-De-Bobadilla MD; Luís M Silva; Helena Ramos; Coque, Teresa M.; et al. "Characterization of vancomycin-resistant Enterococcus faecium from a central hospital over the last decade: fluctuating clones, plasmids and bacteriocins challenge classical infection control. ePoster flash presentation.". Trabalho apresentado em 33rd European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID), Copenhagen, Denmark, 2023.
  23. Ana C. Almeida-Santos; Maria J. Teixeira; Duarte, Bárbara; Novais, Carla; Luísa Maria Vieira Peixe; Ana R. Freitas. "Update on the faecal carriage of enterococci by Portuguese healthy humans unveils Enterococcus lactis as a predominant species". Trabalho apresentado em Dia do laboratório de Microbiologia 2022, FFUP, 2022.
  24. Ana C. Almeida-Santos; Duarte, Bárbara; Ana P. Tedim; Luís M. Silva; Helena Ramos; Teresa M. Coque; Carla Novais; Luísa Peixe; Ana R. Freitas. "Clonal and plasmid dynamics of vancomycin-resistant Enterococcus faecium obtained from a single hospital institution over the last 20 years". Trabalho apresentado em 13th International Meeting on Microbial Epidemiological Markers (IMMEM XIII), 2022.
  25. M. Viviana Belloso Daza; Ana C. Almeida-Santos; Ana R. Freitas; Novais, Carla; Antonia Read; Alves, Valquíria; Pier Sandro Cocconcelli; Luisa Peixe. "PCR-based differentiation of Enterococcus faecium and Enterococcus lactis for accurate clinical diagnosis". Trabalho apresentado em 13th International Meeting on Microbial Epidemiological Markers (IMMEM XIII), 2022.
  26. Ana P. Tedim; Ana C. Almeida-Santos; Val F. Lanza; Novais, Carla; Teresa M. Coque; Ana R. Freitas; Luísa Peixe. "Unveiling the potential of bacteriocins as markers of the ecology of Enterococcus faecium and Enterococcus lactis". Trabalho apresentado em 13th International Meeting on Microbial Epidemiological Markers (IMMEM XIII), 2022.
  27. Maria J. Teixeira; Ana C. Almeida-Santos; Bárbara Duarte; Carla Novais; Ricardo J. Dinis-Oliveira; Luísa Peixe; Ana R. Freitas; et al. "Faecal carriage of enterococci by portuguese healthy humans: preliminary data towards accurate species identification for forensic applications". Trabalho apresentado em APCF-TOXRUN International Congress, 2022.
    10.51126/revsalus.v4isup.355
  28. Ferrás, Cristina; Oliveira, Joana; J. Monteiro; Santos, Ana; K. Bezstarosti. "ATP Availability Limits Mitotic Duration and Impacts Cell Fate Determination". Trabalho apresentado em ASCB/Embo 2019 meeting - Minisymp 21: Regulation of Cell Division, Washington DC, 2019.
  29. Oliveira, Joana; Monteiro, Joana; Santos, Ana; Abreu, Diogo; Ferrás, Cristina. "ATP deprivation during a prolonged mitosis compromises SAC signaling and cell fate determination". Trabalho apresentado em EMBO workshop on Chromosome segregation and aneuploidy, Cascais, 2019.
  30. Oliveira, Joana; Santos, Ana; Ferrás, Cristina. "ATP deprivation during a prolonged mitosis compromises kinetochore structure, SAC signaling and cell fate determination". Trabalho apresentado em ASCB/Embo 2018 meeting, 2018.
  31. Oliveira, Joana; Santos, Ana; Ferrás, Cristina. "ATP deprivation during a prolonged mitosis compromises kinetochore structure, SAC signaling and cell fate determination". Trabalho apresentado em i3S Annual Meeting, Póvoa de Varzim, 2018.
Pré-impressão
  1. Ana P. Tedim; Ana C. Almeida-Santos; Val F. Lanza; Carla Novais; Teresa M. Coque; Ana R. Freitas; Luísa Peixe. "Bacteriocin Distribution Patterns in Enterococcus faecium and Enterococcus lactis: Bioinformatic Analysis Using a Tailored Genomics Framework". 2023. https://doi.org/10.1101/2023.11.13.566347.
    10.1101/2023.11.13.566347
Recurso online
  1. Juan C. Vázquez-Ucha; Ana C. Almeida-Santos; David Velasco; Salud Rodríguez-Pallares; Michelle Outeda-García; Arianna Rodríguez-Coello; Ana Fernández; et al. BioProject PRJNA1265626 (Whole genome sequences of Enterococcus thailandicus). 2026.
  2. Ana C. Almeida-Santos; Ana P. Tedim; Duarte, Bárbara; Pereira, Ana P.; Luis M. Silva; Júlio Teixeira; Ana P. Castro; et al. BioProject PRJNA1229488 (Whole genome sequences of vancomycin resistant Enterococcus faecium). 2025.
  3. Ana C. Almeida-Santos; Ana P. Tedim; Novais, Carla; Luísa Maria Vieira Peixe; Ana R. Freitas. BioProject ID PRJNA1168715 of NCBI (whole genome sequences of vancomycin-variable Enterococcus faecium CCP461, CCP462, CCP463, CCP464, CCP465, CCP466). 2024. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/?term=PRJNA1168715.
  4. Pereira, Ana P.; Ana C. Almeida-Santos; Duarte, Bárbara; Antunes, Patrícia; Peixe, L; Freitas, Ana R; Novais, Carla. Bioproject PRJNA1141278 of NCBI. (Whole genome sequences of Enterococcus faecium M918981, M1241285, SN134, and SN558). 2024. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1141278/.
  5. Ana Almeida-Santos; Ana P. Tedim; Carla Alexandra Novais; Luísa Maria Vieira Peixe; Ana Raquel Pinho Freitas. BioProject ID PRJNA1055432 of NCBI whole genome sequences (21 Enterococcus faecium, 13 E. lactis, 10 E. faecalis, one E. thailandicus). 2023. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/?term=PRJNA1055432..
  6. Mireya Viviana Belloso Daz; Ana C. Almeida-Santos; Ana R. Freitas; Novais, Carla; Antonia Read; Alves, Valquíria; Pier Sandro Cocconcelli; Peixe, L. BioProject PRJNA851953 of NCBI (whole genome sequences of Enterococcus lactis genomes C1041, C1055, HPH55b, HPH67, HPH133, HPH282, HPH288,. 2022.
  7. Freitas A.R.; Tedim,A.P.; Ana Almeida-Santos; Duarte, Bárbara; Elghaieb,H.; Abbassi,M.S.; Hassen,A.; Novais, Carla; Luisa Peixe. Bioproject PRJNA800622 of NCBI. Enterococcus faecium whole genome sequences of 342T, 361T, 464T, 365T, 465T, 349T, 437T, 508T. 2022. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA800622/.
  8. Ana C. Almeida-Santos. BioProject PRJNA679485 (Raw metagenomic data of saliva from healthy and type 2 diabetic individuals). 2020. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA679485/.
Resumo em conferência
  1. Antunes, Beatriz; Ana C. Almeida-Santos; Read, Antónia; Alves, Valquíria; Novais, Carla; Luísa Maria Vieira Peixe; Ana R. Freitas. Autor correspondente: Antunes, Beatriz. "In-depth characterization of vancomycin-resistant Enterococcus faecium from hospitalized patients at a Portuguese hospital, 2022-2023". Trabalho apresentado em 17.º Encontro de Investigação Jovem da Universidade do Porto, 2024.
    Publicado
  2. Ana C. Almeida-Santos; Ana P. Tedim; Duarte, Bárbara; Luís M. Silva; Júlio Teixeira; Ana P. Castro; Novais, Carla; Luísa Maria Vieira Peixe; Freitas, Ana R. "A challenge in antibiotic stewardship: detection of vancomycin-variable Enterococcus faecium (VVE) in human clinical and commensal samples (2009-2022). Scientific Letters, 1(Sup 1). https://doi.org/10.48797/sl.2024.162". Trabalho apresentado em III 1H-TOXRUN INTERNATIONAL CONGRESS 2024, Porto, 2024.
    Publicado • doi.org/10.48797/sl.2024.162
  3. Ana C. Almeida-Santos; Ana P. Tedim; Duarte, Bárbara; Michael Brilhante; Teresa M. Coque; Novais, Carla; Freitas, Ana R; Luísa Maria Vieira Peixe. "Bacteriocin Dynamics in Enterococcus faecium and Enterococcus lactis: Implications for Clinical and Commensal Strain Interactions. Scientific Letters, 1(Sup 1). https://doi.org/10.48797/sl.2024.131". Trabalho apresentado em III 1H-TOXRUN INTERNATIONAL CONGRESS 2024, Porto, 2024.
    Publicado • doi.org/10.48797/sl.2024.131
  4. Beatriz Antunes; Ana C. Almeida-Santos; Antónia Read; Alves, Valquíria; Novais, Carla; Luísa Maria Vieira Peixe; Freitas, Ana R. "Characterization of vancomycin-resistant Enterococcus faecium causing infections in one Portuguese hospital (2022-2024). Scientific Letters, 1(Sup 1). https://doi.org/10.48797/sl.2024.163". Trabalho apresentado em III 1H-TOXRUN INTERNATIONAL CONGRESS 2024, Porto, 2024.
    Publicado • doi.org/10.48797/sl.2024.163
  5. Ana C. Almeida-Santos; Duarte, Bárbara; Maria J. Teixeira; Ana P. Tedim; Novais, Carla; Luísa Maria Vieira Peixe; Freitas, Ana R. "Novel insights into healthy humans’ faecal carriage of enterococci: Enterococcus lactis as a dominant highly bacteriocinogenic species. Scientific Letters: Vol. 1 No. Sup 1 (2023). https://doi.org/10.48797/sl.2023.51". Trabalho apresentado em II TOXRUN International Congress 2023, 2023.
    Publicado
  6. Ana C. Almeida-Santos; Maria J. Teixeira; Duarte, Bárbara; Novais, Carla; Luísa Maria Vieira Peixe; Freitas, Ana R. "Diferenciação precisa de Enterococcus faecium e Enterococcus lactis em fezes de humanos saudáveis indica E. lactis como espécie predominante". Trabalho apresentado em Congresso Internacional de Microbiologia em Língua Portuguesa, 2022.
  7. Maria J. Teixeira; Ana C. Almeida-Santos; Duarte, Bárbara; Novais, Carla; Dinis-Oliveira, Ricardo Jorge; Luisa Peixe; Ana R. Freitas. "Faecal carriage of enterococci by Portuguese healthy humans: preliminary data towards accurate species identification. RevSALUS - Revista Científica Internacional Da Rede Académica Das Ciências Da Saúde Da Lusofonia". Trabalho apresentado em Congresso Internacional da TOXRUN, V Congresso da Associação Portuguesa de Ciências Forenses, XIX Jornadas Científicas de Ciências do Instituto Universitário de Ciências da Saúde, 2022.
  8. Joana Oliveira; Ana Almeida-Santos; Cristina Ferrás. "2018 ASCB Annual Meeting abstracts (ATP deprivation during a prolonged mitosis compromises kinetochore structure, SAC signaling and cell fate determination)". 2018.
    Publicado • 10.1091/mbc.e18-10-0647
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2025/09/17 A 12-year survey of vancomycin-resistant Enterococcus faecium in a tertiary hospital reveals the rise in bac43 prevalence and emergence of linear VanA plasmids 14th International Meeting on Microbial Epidemiological Markers (IMMEM XIV)
(Porto, Portugal)
2024/05/02 Bacteriocin Dynamics in Enterococcus faecium and Enterococcus lactis: Implications for Clinical and Commensal Strain Interactions III 1H-TOXRUN INTERNATIONAL CONGRESS 2024
One Health Toxicology Research Unit (1H-TOXRUN), at Instituto Universitário de Ciências da Saúde (IUCS) and Escola Superior de Tecnologias da Saúde do Tâmega e Sousa (ESTeSTS) (Porto, Portugal)
2024/04/30 Genetic landscape of Enterococcus faecalis in Portugal: population dynamics, plasmid distribution and source correlations Oral presentation at 34rd European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID), Barcelona, Spain
European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (Copenhagen, Dinamarca)
2022/04/24 Vancomycin-resistant Enterococcus faecium causing hospital infections in Porto, Portugal (2009-2020): a retrospective analysis 32th European Congress Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID)
European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (Lisboa, Portugal)
2021/11/23 Analysis of vancomycin-resistant Enterococcus faecium causing hospital infections in Porto, Portugal, over the last decade (online) Microbiotec21 - Congress of Microbiology and Biotechnology 2021 (online)
Sociedade Portuguesa de Microbiologia (Portugal)

Orientação

Título / Tema
Papel desempenhado 		Curso (Tipo)
Instituição / Organização
2025 - Atual From Farm to Fork and beyond: surveillance, transmission and environmental drivers of multidrug-resistant Enterococcus spp. in Northern Portugal
Coorientador
 Doctoral Programme in Biomedical Sciences (Doutoramento)
Instituto Universitário de Ciências da Saúde, Portugal, Portugal
2023/10/04 - 2024/06/26 Phenotypic and genotypic characterization of contemporary Enterococcus faecium from hospital infections
Coorientador de Beatriz Leite Antunes
 Estágio de Investigação em Ciências Biomédicas (Outra)
Instituto Universitário de Ciências da Saúde Unidade de Investigação em Toxicologia, Portugal

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento 		Nome do evento
Instituição / Organização
2025/11/28 - 2025/11/28 Activity for 9th-grade students: a session led by four female researchers who presented the theme “One Health, many sciences: four voices of Microbiology in action.” The session highlighted the growing relevance of antimicrobial resistance, one of the greatest public health challenges today. (https://agcristelo.edu.pt/semana-da-ciencia-tecnologia-e-saude-uma-saude-varias-ciencias/ Semana da Ciência, Tecnologia e Saúde 2025
Escola Básica e Secundária de Cristelo, Portugal
2025/09/17 - 2025/09/20 Attendee and oral communication in the IMMEM XIV (Porto, Portugal)
Conferência
 IMMEM XIV: Microbial Typing from Fundamental to Daily Microbiology
European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Suiça
2025/04/11 - 2025/04/15 Attendee in the ESCMID Global 2025 (Vienna, Austria)
Congresso
 ESCMID Global 2025
European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Suiça
2024/05/02 - 2024/05/03 Attendee III 1H-TOXRUN INTERNATIONAL CONGRESS 2024
Congresso
 III 1H-TOXRUN INTERNATIONAL CONGRESS 2024
Cooperativa de Ensino Superior Politécnico e Universitário CRL, Portugal
2024/04/27 - 2024/04/30 Attendee in the 34th ESCMID Global (Barcelona, Spain)
Congresso
 34th Congress of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ESCMID Global)
European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Suiça
2023/09/11 - 2023/09/14 Attendee ate 6th International Conference on Enterococci
Conferência
 6th International Conference on Enterococci. Porto, Portugal
Universidade do Porto Faculdade de Farmácia, Portugal
2023/04/27 - 2023/04/28 II TOXRUN International Congress 2023
Congresso
 II TOXRUN International Congress 2023: No Boundaries for Toxicology: One Health, One Society, One Planet
Cooperativa de Ensino Superior Politécnico e Universitário CRL, Portugal
2023/04/14 - 2023/04/18 Attendee in the 33rd ECCMID
Congresso
 33rd European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID), Copenhagen, Denmark
European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Suiça
2022/10/27 - 2022/10/27 Attendee in Dia do Laboratório de Microbiologia 2022
Conferência
 Salão Nobre ICBAS/FFUP, Porto, Portugal
Universidade do Porto Faculdade de Farmácia, Portugal
2022/04/23 - 2022/04/26 32nd ECCMID (Lisbon, Portugal)
Congresso
 32nd Congress of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ESCMID Global)
European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Suiça
2022/02/23 - 2022/02/23 Pre-ECCMID Day on Diagnostics
Conferência
 Pre-ECCMID Day on Diagnostics
European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Suiça
2021/11/23 - 2021/11/26 Microbiotec21 - Congress of Microbiology and Biotechnology 2021 (online)
Conferência
 Microbiotec - Conference of Microbiology and Biotechnology 2021
Sociedade Portuguesa de Microbiologia, Portugal

Júri de grau académico

Tema
Tipo de participação 		Nome do candidato (Tipo de grau)
Instituição / Organização
2025/07 Uncovering the genetic diversity of Staphylococcus aureus among healthy university students in Portugal: Implications for Public Health. Research Project carried out in the scope of the Curricular Unit of Research Internship in Biomedical Sciences of the Biomedical Sciences Bachelor’s Degree
Arguente principal
 Bárbara Pinheiro (Outro)
Cooperativa de Ensino Superior Politécnico e Universitário CRL, Portugal
2025/07 Characterization of antimicrobial resistance in Enterococcus spp. isolated from dairy and indigenous cattle from the Northern Portugal. Research Project carried out in the scope of the Curricular Unit of Research Internship in Biomedical Sciences of the Biomedical Sciences Bachelor’s Degree.
Arguente principal
 Alícia Leal Ribeiro (Outro)
Cooperativa de Ensino Superior Politécnico e Universitário CRL, Portugal
2023/07/19 Nasal colonization by Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus in Health Sciences students and analysis of risk factors (Research Project realized on behalf of the Curricular Unit "Metodologia e Projeto em Investigação Forense")
Arguente principal
 Luís Sampaio (Outro)
Cooperativa de Ensino Superior Politécnico e Universitário CRL, Portugal

Arbitragem científica em revista

Nome da revista (ISSN) Editora
2026/05 - Atual International Journal of Infectious Diseases (1878-3511)
2024 - Atual Microbial Pathogenesis (0882-4010)
2023 - Atual Scientific Reports (2045-2322)
2022 - Atual European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases (0934-9723)
2022 - 2025 Journal of Global Antimicrobial Resistance (2213-7165)

Curso / Disciplina lecionado

Disciplina Curso (Tipo) Instituição / Organização
2025/07/04 - 2025/07/12 Bacteriologia Clínica (Theoretical) Análises Clínicas (3ª edição) (Pós-Graduação) Cooperativa de Ensino Superior Politécnico e Universitário CRL, Portugal
2024/06/15 - 2024/06/28 Bacteriologia Clínica (Theoretical) Análises Clínicas (2ª edição) (Pós-Graduação) Cooperativa de Ensino Superior Politécnico e Universitário CRL, Portugal
2021/11 - 2021/12 Bacteriologia (Laboratorial classes) Pharmaceutical Sciences (Mestrado integrado) Universidade do Porto Faculdade de Farmácia, Portugal
2021/06 - 2021/06 Bacteriologia Clínica (Theoretical/Practical classes) Clinical Analysis (Mestrado) Universidade do Porto Faculdade de Farmácia, Portugal
Distinções

Prémio

2026 Antibiotics Travel Award
MDPI AG, Suiça

Outra distinção

2025 Travel grant award attributed for the outstanding quality of the research work presented on the ESCMID Global 2025
European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Suiça
2025 Top rated posters at ESCMID Global 2025 "Silent dissemination of identical VanA-carrying linear plasmids in Vancomycin-Variable Enterococcus faecium: A growing diagnostic concern"
European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Suiça
2024 Travel grant award attributed for the outstanding quality of the research work presented on the 34st ECCMID
European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Suiça
2024 Scholarship application - Full registration to II 1H-TOXRUN INTERNATIONAL CONGRESS 2024
ESCMID Study Group for Food- and Water-borne Infections (EFWISG), Suiça
2023 Travel grant award attributed for the outstanding quality of the research work presented on the 33st ECCMID
European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Suiça
2022 Ana C. Almeida-Santos review highlighted as an Editor's Choice in Microorganisms journal (https://www.mdpi.com/2079-6382/10/10/1215)
MDPI AG, Suiça
2022 Travel grant award attributed for the outstanding quality of the research work presented on the 32st ECCMID
European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Suiça