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Cláudia Tatiana Freitas Vieira. Concluiu Química pela Universidade do Minho em 2013. Actua na área de Ciências Exactas com ênfase em Química Computacional.
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Tatiana Vieira

Nomes de citação

  • Vieira, Tatiana F.

Identificadores de autor

Ciência ID
0C12-3456-E506
ORCID iD
0000-0001-5137-0798

Endereços de correio eletrónico

  • up201810940@med.up.pt (Profissional)

Moradas

  • Alameda Prof. Hernâni Monteiro, 4200-319, Porto, Porto, Portugal (Profissional)

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Bioquímica
  • Ciências Exatas - Química

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Inglês Utilizador independente (B1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B1)
Espanhol; Castelhano Utilizador elementar (A2) Utilizador independente (B1) Utilizador elementar (A2) Utilizador elementar (A2) Utilizador elementar (A1)
Francês Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1)
Formação
Grau Classificação
2013
Concluído
 Técnicas de Caracterização e Análise Química (Mestrado)
Especialização em Sem especialização
Universidade do Minho, Portugal
"Desenvolvimento e validação de métodos para a caracterização de vinhos por eletroforese capilar" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 17 valores
2011
Concluído
 Bioquímica (Licenciatura)
Universidade da Madeira, Portugal
"Avaliação de Recursos genéticos através do recurso a caracteres e marcadores moleculares e/ou bioquímicos" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 14
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2018/12/01 - Atual Investigador (Investigação) REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal

Outros

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2015/07/01 - 2018/04/30 Research fellow on the project UID/EQU/00511/2013 Dinâmica molecular na área de funcionalização de fármacos anti-tumorais Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal
2014/04/01 - 2015/05/31 Research fellow on the project FCT (EXPL/QEQ-COM/1125/2013) Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2014/01/01 - 2014/04/01 Volunteer, I continued a project started by a PhD student in electrochemistry Universidade do Minho, Portugal
2012/09/01 - 2013/06/01 Trainee in the liquid chromatography laboratory, testing Porto a Douro wines for the presence of specific compounds Instituto dos vinhos do Douro e do Porto, IVDP I.P., Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2018/12/01 - Atual New Drugs Against Biofilm Formation and Development
SFRH/BD/137844/2018
Bolseiro de Doutoramento
REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal

Universidade do Porto Faculdade de Medicina, Portugal

Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal
Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT
Em curso
2015/06/01 - 2018/05/01 Dinâmica molecular na área de funcionalização de fármacos anti-tumorais
UID/EQU/00511/2013
Bolseiro de Investigação
Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia, Portugal
 Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia
Concluído
2015/06 - 2018/05 Dinâmica molecular na área de funcionalização de fármacos anti-tumorais
UID/EQU/00511/2013
 Universidade do Porto Laboratorio de Engenharia de Processos Ambiente Biotecnologia e Energia
2014/03 - 2015/02 Consensus Scoring - An Innovative Method to Find Leads for the Pharmaceutical Industry
Provided by PTCRIS: 134150
134150
 Ministério da Ciência Tecnologia e Ensino Superior

Projeto

Designação Financiadores
2020/01 - Atual Biopesticides and Food Preservatives from Nanoencapsulated Plant Extracts: Biological Evaluation, Molecular Modeling
PTDC/ASP-AGR/30154/2017
Bolseiro de Doutoramento
Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT
Em curso
Produções

Publicações

Artigo em conferência
  1. José Ricardo A. Coelho; Tatiana F. Vieira; Renato B. Pereira; David M. Pereira; Elisabete M. S. Castanheira; António Gil Fortes; Sérgio F. Sousa; Maria José G. Fernandes; Maria Sameiro T. Gonçalves. "Synthesis, Insecticidal Activity and Computational Studies of Eugenol-Based Insecticides". 2022.
    10.3390/ecsoc-26-13649
  2. Miguel A. F. Ribeiro; Tatiana F. Vieira; Maria José G. Fernandes; Renato B. Pereira; David M. Pereira; Elisabete M. S. Castanheira; A. Gil Fortes; Sérgio F. Sousa; M. Sameiro T. Gonçalves. "Synthesis and In Silico Evaluation of Potential Insecticide Activity of Benzamides". 2021.
    10.3390/ecsoc-25-11770
  3. "Development and Validation of a Multi-Level Computational Protocol for Drug Repurposing in the Treatment of Bacterial Infections". 2021.
    10.3390/ecsoc-25-11728
  4. José R. A. Coelho; Tatiana F. Vieira; Renato B. Pereira; David M. Pereira; Elisabete M. S. Castanheira; A. Gil Fortes; Sérgio F. Sousa; Maria José G. Fernandes; M. Sameiro T. Gonçalves. "Eugenol Ester Derivatives: Synthesis, Insecticidal Activity and Computational Studies". 2021.
    10.3390/ecsoc-25-11787
  5. "In Silico Identification of Protein Targets Associated to the Insecticide Activity of Eugenol Derivatives". 2020.
    10.3390/ecsoc-24-08333
  6. Vieira, T.F.; Magalhães, R.P.; Cerqueira, N.M.F.S.A.; Sousa, S.F.. "Evaluation of scoring functions for large scale application of virtual screening in the identification of novel beta-lactamase inhibitors". 2019.
    10.1109/ENBENG.2019.8692567
Artigo em revista
  1. Tatiana F. Vieira; Nuno M. F. S. A. Cerqueira; Manuel Simões; Sérgio F. Sousa. "In silico identification of novel PqsD inhibitors: promising molecules for quorum sensing interference in Pseudomonas aeruginosa". Molecular Systems Design & Engineering (2023): https://doi.org/10.1039/D3ME00107E.
    10.1039/D3ME00107E
  2. Maria José G. Fernandes; Renato B. Pereira; Ana Rita O. Rodrigues; Tatiana F. Vieira; A. Gil Fortes; David M. Pereira; Sérgio F. Sousa; M. Sameiro T. Gonçalves; Elisabete M. S. Castanheira. "Liposomal Formulations Loaded with a Eugenol Derivative for Application as Insecticides: Encapsulation Studies and In Silico Identification of Protein Targets". Nanomaterials (2022): https://doi.org/10.3390/nano12203583.
    10.3390/nano12203583
  3. Delphine Lapaillerie; Cathy Charlier; Véronique Guyonnet-Dupérat; Emilie Murigneux; Henrique S. Fernandes; Fábio G. Martins; Rita P. Magalhães; et al. "Selection of Bis-Indolyl Pyridines and Triphenylamines as New Inhibitors of SARS-CoV-2 Cellular Entry by Modulating the Spike Protein/ACE2 Interfaces". Antimicrobial Agents and Chemotherapy 66 8 (2022): http://dx.doi.org/10.1128/aac.00083-22.
    10.1128/aac.00083-22
  4. Tatiana F. Vieira; Rita P. Magalhães; Manuel Simões; Sérgio F. Sousa. "Drug Repurposing Targeting Pseudomonas aeruginosa MvfR Using Docking, Virtual Screening, Molecular Dynamics, and Free-Energy Calculations". Antibiotics 11 2 (2022): 185-185. https://doi.org/10.3390/antibiotics11020185.
    10.3390/antibiotics11020185
  5. Rita P. Magalhães; Tatiana F. Vieira; André Melo; Sérgio F. Sousa. "Identification of novel candidates for inhibition of LasR, a quorum-sensing receptor of multidrug resistant Pseudomonas aeruginosa, through a specialized multi-level in silico approach". Molecular Systems Design & Engineering (2022): https://doi.org/10.1039/D2ME00009A.
    10.1039/D2ME00009A
  6. Catarina M. M. Coelho; Renato B. Pereira; Tatiana F. Vieira; Cláudia M. Teixeira; Maria José G. Fernandes; Ana Rita O. Rodrigues; David M. Pereira; et al. "Synthesis, computational and nanoencapsulation studies on eugenol-derived insecticides". New Journal of Chemistry (2022): https://doi.org/10.1039/D2NJ01893D.
    10.1039/D2NJ01893D
  7. Tatiana F. Vieira; Rita P. Magalhães; Nuno M. F. S. A. Cerqueira; Manuel Simões; Sérgio F. Sousa. "Targeting Pseudomonas aeruginosa MvfR in the battle against biofilm formation: a multi-level computational approach". Molecular Systems Design & Engineering (2022): https://doi.org/10.1039/D2ME00088A.
    10.1039/D2ME00088A
  8. Renato B. Pereira; Nuno F. S. Pinto; Maria José G. Fernandes; Tatiana F. Vieira; Ana Rita O. Rodrigues; David M. Pereira; Sérgio F. Sousa; et al. "Amino Alcohols from Eugenol as Potential Semisynthetic Insecticides: Chemical, Biological, and Computational Insights". Molecules (2021): https://doi.org/10.3390/molecules26216616.
    10.3390/molecules26216616
  9. Tatiana F. Vieira; Fábio G. Martins; Joel P. Moreira; Tiago Barbosa; Sérgio F. Sousa. "In Silico Identification of Possible Inhibitors for Protein Kinase B (PknB) of Mycobacterium tuberculosis". Molecules 26 20 (2021): 6162-6162. https://doi.org/10.3390/molecules26206162.
    10.3390/molecules26206162
  10. Ana Cláudia Pereira; Débora Ferreira; Cátia Santos-Pereira; Tatiana F. Vieira; Sérgio F. Sousa; Goreti Sales; Lígia R. Rodrigues. "Selection of a new peptide homing SK-BR-3 breast cancer cells". Chemical Biology & Drug Design (2021): https://doi.org/10.1111/cbdd.13816.
    10.1111/cbdd.13816
  11. Carolina M. Natal; Maria José G. Fernandes; Nuno F. S. Pinto; Renato B. Pereira; Tatiana F. Vieira; Ana Rita O. Rodrigues; David M. Pereira; et al. "New carvacrol and thymol derivatives as potential insecticides: synthesis, biological activity, computational studies and nanoencapsulation". RSC Advances (2021): https://doi.org/10.1039/D1RA05616F.
    10.1039/D1RA05616F
  12. Rita P. Magalhães; Tatiana F. Vieira; Henrique S. Fernandes; André Melo; Manuel Simões; Sérgio F. Sousa. "The Biofilms Structural Database". Trends in Biotechnology (2020): https://doi.org/10.1016/j.tibtech.2020.04.002.
    10.1016/j.tibtech.2020.04.002
  13. Tatiana F. Vieira; Sérgio F. Sousa. "Comparing AutoDock and Vina in Ligand/Decoy Discrimination for Virtual Screening". Applied Sciences (2019): https://doi.org/10.3390/app9214538.
    10.3390/app9214538
  14. Vieira, Cláudia Tatiana Freitas. "Tailoring Specialized Scoring Functions For More Efficient Virtual Screening". Frontiers in Drug, Chemistry and Clinical Research (2019): http://dx.doi.org/10.15761/fdccr.1000118.
    10.15761/fdccr.1000118
  15. Vieira, Tatiana F.; Sousa, Sérgio F.; Peres, Joana; Coelho, Manuel. "Analyzing PEGylation through Molecular Dynamics Simulations". ChemistrySelect 3 29 (2018): 8415-8427. http://dx.doi.org/10.1002/slct.201800855.
    Publicado • 10.1002/slct.201800855
  16. Vieira, Tatiana. "A Flow Cytometric and Computational Approaches to Carbapenems Affinity to the Different Types of Carbapenemases". Frontiers in Microbiology (2016):
    10.3389/fmicb.2016.01259
Capítulo de livro
  1. Tatiana F. Vieira; Sérgio F. Sousa. "Receptor-Based Virtual Screening of Large Libraries in a Multi-Level In Silico Approach". 261-267. Springer {US, 2023.
    10.1007/978-1-0716-3147-8_15
  2. Magalhães, Rita P.; Vieira, Tatiana F.; Melo, André; Sousa, Sérgio F.. "In silico development of quorum sensing inhibitors". In Recent Trends in Biofilm Science and Technology, 329-357. Elsevier, 2020.
    10.1016/b978-0-12-819497-3.00015-5
Poster em conferência
  1. Vieira, Tatiana F.; Sousa, Sérgio F.. "Inverted Virtual Screening Approaches for the Identification of Protein Targets for Biologically Active Molecules". Trabalho apresentado em 5th Meeting of Medicinal Biotechnology (5MBtM) and 2nd Iberian Congress on Medicinal Biotechnology (2ICMBt), 2022.
  2. Vieira, Tatiana F.; Sousa, Sérgio F.. "A Multi-Level Computational Approach in the Discovery of New Quorum Sensing Inhibitors for P. aeruginosa.". Trabalho apresentado em Paul Ehrlich (PE) Euro-PhD Network virtual meeting, MedChem2021, 2021.
  3. Vieira, Tatiana F.; Magalhães, Rita P.; Sousa, Sérgio F.. "In silico methodology for the identification of new drugs against biofilm formation in P. aeruginosa". Trabalho apresentado em The 24th meeting of the International Society for Molecular Recognition, Affinity 2021, 2021.
  4. Magalhães, Rita P.; Vieira, Cláudia Tatiana Freitas; Melo, André; Sousa, Sérgio F.. "Comparing Different Scoring Functions for Docking and Virtual Screening against bacterial Quorum-Sensing Receptors". Trabalho apresentado em 7º Encontro de Jovens Investigadores de Biologia Computacional Estrutural (EJIBCE), 2019.
  5. Vieira, Cláudia Tatiana Freitas; Magalhães, Rita P.; Fernandes, Henrique; Simões, Manuel; Sousa, Sérgio F.. "Development of a structural database to inhibit biofilm formation". Trabalho apresentado em 7º Encontro de Jovens Investigadores de Biologia Computacional Estrutural (EJIBCE), 2019.
  6. Sousa, Sérgio F.; Vieira, Cláudia Tatiana Freitas; Magalhães, Rita P.. "Looking into Protein Targets from the Perspective of the Ligand". Trabalho apresentado em Target Validation using Genomics and Informatics (EMBL - Heidelberg, Germany), 2019.
  7. Magalhães, Rita P.; Vieira, Cláudia Tatiana Freitas; Melo, André; Sousa, Sérgio F.. "Optimization of an in silico Virtual Screening Protocol for the Identification of Biofilm Formation Inhibitors in LasR". Trabalho apresentado em XXV Encontro Galego-Português de Química (Santiago de Compostela, Spain), 2019.
  8. Vieira, Cláudia Tatiana Freitas; Magalhães, Rita P.; Sousa, Sérgio F.. "Discovery of Quorum Sensing Inhibitors against P. aeruginosa using Docking and Virtual Screening Strategies". Trabalho apresentado em BImBS 2019 – BioInformatics meets BioSimulations in protein and DNA studies: from theory to practice (Lugano, Switzerland), 2019.
  9. Vieira, Tatiana F.; Magalhães, Rita P.; Sousa, Sérgio F.. "Docking and Virtual Screening strategies for the identification of new drugs against biofilm formation and development". Trabalho apresentado em XI Summer Course in Medicinal Chemistry, FFUP (Porto, Portugal), 2019.
  10. Magalhães, Rita P.; Vieira, Tatiana F.; Melo, André; Sousa, Sérgio F.. "Development of Specialized Virtual Screening Protocols for Inhibition of Quorum Sensing". Trabalho apresentado em IJUP - Encontro de Investigação Jovem, Reitoria da Universidade do Porto, (Porto, Portugal), 2019.
  11. Vieira, Cláudia Tatiana Freitas; Magalhães, Rita; Sousa, Sérgio F.; Cerqueira, Nuno. "Evaluation of Different Scoring Functions for Docking and Virtual Screening against GPCR Drug Targets". Trabalho apresentado em Encontro de Jovens Investigadores de Biologia Computacional e Estrutural (EJIBCE), 2018.
    10.3390/mol2net-04-06078
  12. Magalhães, Rita P.; Vieira, Cláudia Tatiana Freitas; Fernandes, Henrique; Cerqueira, Nuno; Melo, André; Simões, Manuel 1617-CE39-FE0A; Sousa, Sérgio F.. "Creation of a Structural Database for Inhibition of Biofilm Formation". Trabalho apresentado em Encontro de Jovens Investigadores de Biologia Computacional e Estrutural (EJIBCE), 2018.
    10.3390/mol2net-04-06079
  13. Vieira, Tatiana F.; Sousa, Sérgio F.; Peres, Joana; Coelho, Manuel. "PEGylation of Temozolomide (TMZ): A Molecular Dynamics study". Trabalho apresentado em 11th Triennial Congress of the World Association of Theoretical and Computational Chemists (WATOC), 2017.
  14. Vieira, Tatiana F.; Sousa, Sérgio F.. "Development of New Consensus Scoring Functions for Virtual Screening in Metalloproteins". Trabalho apresentado em 2º Simpósio de Química Medicinal da Universidade do Minho, 2015.
  15. Vieira, Tatiana F.; Oliveira, Raquel; Geraldo, Dulce; Marcos, João; Rodrigues, João; Bento, Fátima. "Oxidative modification of proteins induced by electrogenerated HO radicals". Trabalho apresentado em 19th Meeting of Portuguese Electrochemical Society, 16 Iberic Meeting of Electrochemistry, 2014.
  16. Vieira, Tatiana F.; Oliveira, Ana Isabel; Bettencourt, Ana Paula. "Desenvolvimento e validação de um método para a análise de conservantes em vinhos por eletroforese capilar". Trabalho apresentado em III Encontro em Técnicas de Caracterização e Análise Química, 2014.
  17. Vieira, Tatiana F.; Ferreira, Paula. "Novos Hidrogéis peptídicos para aplicações biomédicas". Trabalho apresentado em II Encontro em Técnicas de Caracterização e Análise Química, 2012.
Pré-impressão
  1. Maria José G. Fernandes; Renato B. Pereira; Ana Rita O. Rodrigues; Tatiana F. Vieira; A. Gil Fortes; David M. Pereira; Sérgio F. Sousa; Elisabete M. S. Castanheira; M. Sameiro Gonçalves. "Encapsulation Studies and In Silico Identification of Protein Targets Associated to the Insecticide Activity of Eugenol Derivatives". 2022. https://doi.org/10.20944/preprints202208.0126.v1.
    10.20944/preprints202208.0126.v1
  2. Catarina Coelho; Renato Pereira; Tatiana Vieira; Cláudia Teixeira; Maria Fernandes; Ana Rodrigues; David Pereira; et al. "Synthesis, Computational and Nanoencapsulation Studies on Eugenol-Derived Insecticides". 2022. https://doi.org/10.20944/preprints202203.0354.v1.
    10.20944/preprints202203.0354.v1
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2023/11/22 The Drug to Target Journey: Development of a Reverse Virtual Screening protocol for protein target identification XXVII Encontro Luso Galego de Química
(Porto, Espanha)
2023/06 In silico approaches for the discovery of antimicrobial agents targeting biofilm formation BioData.pt Talk
BioData (Portugal)
2022/12/20 What can computational methods do to help find new molecules with antimicrobial properties? 3D-BioInfo-PT Meeting
3D-BioInfo-PT (Oeiras, Portugal)
2021/12/20 Developed of Inverted Virtual Screening Approaches for the Identification of Protein Targets Associated to the Biological Activity of Specific Molecules VIII EJIBCE (Encontro de Jovens Investigadores de Biologia Computacional Estrutural)
(Coimbra)
2021/10/07 Targeting the PQS system: Discovery of New Quorum Sensing Inhibitors for P. aeruginosa through an in silico methodology e-Conference on Innovation in Microbial Control
Faculdades de Ciências e de Engenharia da Universidade do Porto (Porto)
2020/03/02 Targeting MvfR In the battle against biofilm formation: A molecular docking and virtual screening approach 1st BioSIM Cycle of Conferences: Connecting Computer Simulations with Experimental Research
BioSIM (Porto, Portugal)
2019/02/22 Evaluation of Scoring Functions for Large Scale Application of Virtual Screening in the Identification of Novel Beta Lactamase Inhibitors The 6th IEEE Portuguese Meeting on Bioengineering (ENBENG 2019)
Instituto Superior de Engenharia de Lisboa (Lisboa, Portugal)
2015/05/13 Strategies for Improved Ligand/Decoy Discrimination in Virtual Screening of Large Databases for Drug Discovery Investigação Jovem na Universidade do Porto (IJUP 2015)
Universidade do Porto (Porto, Portugal)

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação) 		Instituição / Organização
2018/12/21 - 2018/12/21 6º Encontro de Jovens Investigadores de Biologia Computacional Estrutural - EJIBCE2018 (2018/12/21 - 2018/12/21)
Encontro (Membro da Comissão Organizadora)
 Universidade do Porto Faculdade de Medicina, Portugal
2015 - 2015 Encontro Investigação Jovem da Universidade do Porto (2015 - 2015)
Encontro (Membro da Comissão Organizadora)
 Universidade do Porto, Portugal
2012/06/08 - 2012/06/08 II Encontro Mestrado de Técnicas Caracterização e Análise Química (2012/06/08 - 2012/06/08)
Encontro (Membro da Comissão Organizadora)
 Universidade do Minho, Portugal

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento 		Nome do evento
Instituição / Organização
2019/10/05 - 2019/10/12 BioInformatics meets BioSimulations in protein and DNA studies: from theory to practice school.
Oficina (workshop)
 BImBS 2019 - BioInformatics meets BioSimulations in protein and DNA studies: from theory to practice
Università della Svizzera Italiana, Suiça
2017/08/27 - 2017/09/01 Congress of theoretical and computational chemistry
Congresso
 11th Triennial Congress of the World Association of Theoretical and Computational Chemists (WATOC)
Ludwig Maximilians Universität München Department Chemie, Alemanha
2016/08/22 - 2016/08/26 Summer school on Molecular Kinetics
Oficina (workshop)
 School on Molecular Kinetics
École Polytechnique Fédérale de Lausanne, Suiça
2015/09/02 - 2015/09/11 Introductory course targeted to students from the M. Sc. to post-doctoral levels with either biological or exact sciences backgrounds who wish to acquire skills in Computational Biology.
Oficina (workshop)
 Summer School in Computational Biology - from molecules to tissues
Universidade de Coimbra Centro de Química de Coimbra, Portugal