Identificação pessoal

Nome completo

Niccolò Bonacchi

Nomes de citação

• Bonacchi, Niccolò
• Bonacchi, N.

Identificadores de autor

Ciência ID

0612-705C-8295

ORCID iD

0000-0001-5228-6918

Google Scholar ID

https://scholar.google.com/citations?hl=en&user=ii0Eww0AAAAJ

Scopus Author Id

56598047300

Idiomas

Idioma	Conversação	Leitura	Escrita	Compreensão	Peer-review
Italiano	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)
Português	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)
Inglês	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)
Espanhol; Castelhano	Utilizador independente (B1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador independente (B1)	Utilizador independente (B1)
Francês	Utilizador elementar (A1)	Utilizador elementar (A1)	Utilizador elementar (A1)	Utilizador elementar (A1)

	Grau	Classificação
2017/07 Concluído	Ph.D. in Biology | Neuroscience (Doutoramento) Especialização em Especialidade: Neurociências Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal "Spatial goals and actions in the orbitofrontal cortex" (TESE/DISSERTAÇÃO)
2014 - 2014 Concluído	Computational and Cognitive Neuroscience Summer School (Outros) New York University, Estados Unidos
2012 - 2012 Concluído	Course in Laboratory Animal Science - Cat B (Outros) Direcção-Geral de Alimentação e Veterinária, Portugal
2010 Concluído	M.Sc. in Psychobiology (Mestrado) Instituto Universitário de Ciências Psicológicas Sociais e da Vida, Portugal "BEHAVIORAL SUPPRESSION IN A MODIFIED CONFLICT PARADIGM A Framework to Test the Photostimulation of 5-HT" (TESE/DISSERTAÇÃO)	20
2004 Concluído	Rehabilitation and Social Inclusion (Licenciatura) Instituto Universitário de Ciências Psicológicas Sociais e da Vida, Portugal "Attitudes towards people with disabilities - Comparative study between 1st and final year ISPA students. PT: Atitudes face à pessoa com deficiência - Estudo comparativo entre alunos do 1º e último ano do ISPA." (TESE/DISSERTAÇÃO)	16

Ciência

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2023/03/01 - Atual	Investigador (Investigação)	Instituto Superior de Psicologia Aplicada Centro de Investigação William James, Portugal
	Instituto Superior de Psicologia Aplicada Centro de Investigação William James, Portugal
2023 - Atual	Investigador visitante (Investigação)	Fundação Champalimaud, Portugal
	Programa Champalimaud de Neurociências, Portugal
2023 - Atual	Investigador visitante (Investigação)	Max-Planck-Institut für empirische Ästhetik, Alemanha
	Max-Planck-Institut für empirische Ästhetik, Alemanha
2019 - 2022/12/31	Investigador Coordenador (carreira) (Investigação)	Programa Champalimaud de Neurociências, Portugal
2018 - 2018/12/31	Investigador Coordenador (carreira) (Investigação)	University College London Wolfson Institute for Biomedical Research, Reino Unido
	University College London Wolfson Institute for Biomedical Research, Reino Unido
2017/07/27 - 2018/03	Pós-doutorado (Investigação)	Programa Champalimaud de Neurociências, Portugal
2005 - 2007	Investigador (Investigação)	ISCTE-Instituto Universitário de Lisboa Centro de Investigação e Intervenção Social, Portugal

Docência no Ensino Superior

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2023 - Atual	Professor Auxiliar (Docente Universitário)	Instituto Universitário de Ciências Psicológicas Sociais e da Vida, Portugal
	Instituto Universitário de Ciências Psicológicas Sociais e da Vida, Portugal

Outros

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2009/09/15 - 2017/07/26	PhD Student (International Neuroscience Doctoral Programme - INDP) Systems Neuroscience Lab,	Programa Champalimaud de Neurociências, Portugal
2008/06/02 - 2009/09/14	MS Student / Assistant researcher Champalimaud Neuroscience Programme	Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
2005 - 2007	Junior Researcher - European Social Survey (P143B)	Universidade de Lisboa Instituto de Ciências Sociais, Portugal
2005 - 2007	Junior Researcher EUROFOR (Daphne - EU)	Berliner Institut für Vergleichende Sozialforschung eV, Alemanha

Bolsa

	Designação	Financiadores
2023 - Atual	ARC - COGITATE TWCF 0389 Investigador responsável Programa Champalimaud de Neurociências, Portugal	Templeton World Charity Foundation Inc Em curso
2018 - 2022/12/01	The International Brain Laboratory (IBL) Wellcome 209558 Wellcome 216324 Investigador University College London Wolfson Institute for Biomedical Research, Reino Unido Programa Champalimaud de Neurociências, Portugal	Wellcome Trust Simons Foundation Em curso
2010/10/01 - 2013/11/30	CONTEXT DEPENDENT MODULATION OF VALUE SFRH/BD/51259/2010	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2010 - 2012	Context dependent modulation of value SFRH / BD / 51259 / 2010	Secretaria de Estado de Ciência Tecnologia e Ensino Superior
2009/10/01 - 2010/09/30	PROGRAMA GULBENKIAN CHAMPALIMAUD EM NEUROCIÊNCIAS - INTERNATIONAL NEUROSCIENCE DOCTORAL PROGRAM SFRH/BI/33927/2009	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído

Projeto

	Designação	Financiadores
2018/10/01 - 2022/09/30	Odors and memory: neural mechanisms for encoding contextual information in olfactory cortex PTDC/MED-NEU/28509/2017 Fundação Champalimaud, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2019/01/01 - 2019/12/31	Champalimaud Neuroscience Programme UID/NEU/04443/2019 Fundação Champalimaud, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído

Publicações

Artigo em revista	The International Brain Laboratory; Bonacchi, Niccolò; Gaelle Chapuis; Anne K. Churchland; DeWitt, Eric; Mayo Faulkner; Kenneth D. Harris; et al. Autor correspondente: Kenneth D. Harris. "A modular architecture for organizing, processing and sharing neurophysiology data". Nature Methods (2023): http://dx.doi.org/10.1038/s41592-022-01742-6. 10.1038/s41592-022-01742-6 Kobi Snitz; Danielle Honigstein; Reut Weissgross; Aharon Ravia; Eva Mishor; Ofer Perl; Shiri Karagach; et al. "An olfactory self-test effectively screens for COVID-19". Communications Medicine (2022): https://publons.com/wos-op/publon/52618386/. 10.1038/S43856-022-00095-7 Poo, Cindy; Agarwal, Gautam; Bonacchi, Niccolo; Mainen, Zachary F.. "Spatial maps in piriform cortex during olfactory navigation". Nature (2022): https://publons.com/wos-op/publon/53522782/. 10.1038/S41586-021-04242-3 Aguillon, Valeria; Angelaki, Dora E.; Bayer, Hannah; Bonacchi, Niccolo; Carandini, Matteo; Cazettes, Fanny; Chapuis, Gaelle; et al. "Standardized and reproducible measurement of decision-making in mice (vol 10, e63711, 2021)". eLife (2022): https://publons.com/wos-op/publon/56762446/. 10.7554/ELIFE.84310 Matthew R. Whiteway; Frédéric E. Theunissen; Dan Biderman; Yoni Friedman; Mario Dipoppa; E. Kelly Buchanan; Anqi Wu; et al. "Partitioning variability in animal behavioral videos using semi-supervised variational autoencoders". PLOS Computational Biology 17 9 (2021): e1009439-e1009439. https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1009439. 10.1371/journal.pcbi.1009439 Kobi Snitz; Danielle Honigstein; Reut Weissgross; Aharon Ravia; Eva Mishor; Ofer Perl; Shiri Karagach; et al. "Smelling Household-Odorants Effectively Screens for COVID-19". MedRxiv (2021): https://publons.com/wos-op/publon/40807612/. 10.1101/2021.02.18.21251422 Aguillon-Rodriguez, Valeria; Angelaki, Dora; Bayer, Hannah; Bonacchi, Niccolo; Carandini, Matteo; Cazettes, Fanny; Chapuis, Gaelle; et al. "Standardized and reproducible measurement of decision-making in mice". eLife (2021): https://publons.com/wos-op/publon/46523116/. 10.7554/ELIFE.63711 Poo, Cindy; Agarwal, Gautam; Bonacchi, Niccolo; Mainen, Zachary. "A map for odors and space in posterior piriform cortex". Chemical Senses (2020): https://publons.com/wos-op/publon/53522783/. Bonacchi, Niccolò. "Data architecture and visualization for a large-scale neuroscience collaboration". Biorxiv (2019): https://www.biorxiv.org/content/10.1101/827873v1. Acesso aberto Lopes, G.; Bonacchi, N.; Frazão, J.; Neto, J.P.; Atallah, B.V.; Soares, S.; Moreira, L.; et al. "Bonsai: An event-based framework for processing and controlling data streams". Frontiers in Neuroinformatics 9 APR (2015): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84928034273&partnerID=MN8TOARS. 10.3389/fninf.2015.00007
Pré-impressão	Brandon Benson; Julius Benson; Daniel Birman; Niccolò Bonacchi; Matteo Carandini; Joana A Catarino; Gaelle A Chapuis; et al. "A Brain-Wide Map of Neural Activity during Complex Behaviour". 2023. https://doi.org/10.1101/2023.07.04.547681. 10.1101/2023.07.04.547681 Oscar Ferrante; Urszula Gorska-Klimowska; Simon Henin; Rony Hirschhorn; Aya Khalaf; Alex Lepauvre; Ling Liu; et al. "An adversarial collaboration to critically evaluate theories of consciousness". 2023. https://doi.org/10.1101/2023.06.23.546249. 10.1101/2023.06.23.546249 Findling, Charles; Hubert, Felix; Acerbi, Luigi; Benson, Brandon; Benson, Julius; Birman, Daniel; Bonacchi, Niccolò; et al. "Brain-wide representations of prior information in mouse decision-making". 2023. http://dx.doi.org/10.1101/2023.07.04.547684. 10.1101/2023.07.04.547684
Resumo em conferência	Bougrova, Kcenia; Bonacchi, Niccolò; Catarino, Joana A; DeWitt, Eric; Meijer, Guido; Dayan, Peter; Mainen, Zachary; The International Brain Laboratory. "Comparison of neuromodulator signaling in a visual decision-making task". Trabalho apresentado em 51st Annual Meeting of the Society for Neuroscience, San Diego, CA, 2022. Publicado Bonacchi, Niccolò; Chapuis, G.A.; Anne K. Churchland; Kenneth D. Harris; Rossant, Cyrille; Olivier Winter; Miles J. Wells; Mainen, Zachary; The International Brain Laboratory. "The IBL data architecture: tools for storing and accessing divers databases collected at multiple sites". Trabalho apresentado em Society for Neuroscience (SfN), Chicago, 2019. Aceite para publicação Poo, Cindy; Agarwal, Gautam; Bonacchi, Niccolò; Mainen, Zachary. "Conjunctive map for odors and space in posterior piriform cortex". Trabalho apresentado em Society for Neuroscience (SfN), Lisbon, 2019. Aceite para publicação Cindy Poo; Bonacchi, Niccolò; Mainen, Zachary. "Spatial context modulates odor representations in posterior piriform cortex". Trabalho apresentado em 11th FENS Forum of Neuroscience, Berlin, 2018. Bonacchi, Niccolò; Cindy Poo; Cruz, AS; Mainen, Zachary. "Encoding of odor context in posterior piriform cortex". Trabalho apresentado em Computational and Systems Neuroscience (CoSyNe), Salt Lake City, 2016. Aceite para publicação Bonacchi, Niccolò; Cindy Poo; Cruz, AS; Mainen, Zachary. "Orbitofrontal cortex and outcome locations". Trabalho apresentado em Computationam ans Systems Neurosciecnc (CoSyNe), Salt Lake City, 2016. Aceite para publicação Bonacchi, Niccolò; Cindy Poo; Cruz, AS; Mainen, Zachary. "Posterior piriform cortex in an odor-guided spatial navigation task". Trabalho apresentado em Society for Neuroscience (SfN), San Diego, 2016. Bonacchi, Niccolò; Cindy Poo; Cruz, AS; Mainen, Zachary. "Orbitofrontal cortex, reversals, and locations". Trabalho apresentado em Society for Neuroscience (SfN), San Diego, 2016. Aceite para publicação Bonacchi, Niccolò; Cindy Poo; Mainen, Zachary F.. "Spatial goals and actions in the orbitofrontal cortex". Trabalho apresentado em Society fo Neuroscience (SfN), New Orleans, 2012. Aceite para publicação Bonacchi, Niccolò; Mainen, Zachary. "Context dependent modulation of value". Trabalho apresentado em Annual Meeting of Gulbenkian Students, Foz do Arelho, 2012. Aceite para publicação Correia, PA; Dugué, GP; MatiasS; Lörincz, ML; Bonacchi, Niccolò; Audero, E; Lottem, E; Mainen, Zachary. "Testing the link between serotonin and aversive behaviors using optogenetics". Trabalho apresentado em CNP-CRICM Meeting, Lisbon, 2011. Aceite para publicação Bonacchi, Niccolò; Dugué, Guillaume; Mainen, Zachary F.. "Behavioral suppression in a modified conflict paradigm". Trabalho apresentado em Associação Portuguesa de Psicologia Experimental, Lisbon, 2009. Aceite para publicação
Tese / Dissertação	Bonacchi, Niccolò. "Spatial goals and actions in the orbitofrontal cortex". Doutoramento, Universidade Nova de Lisboa, 2017. http://hdl.handle.net/10362/76957.

Outros

Conjunto de dados	Marcelo Armendariz; Katarina Bendtz; Melanie Boly; Bonacchi, Niccolò; Tanya Brown; Diptyajit Das; Sasha Devore; et al. Cogitate iEEG Data. 2024. 10.17617/1.cqyn-9a87 Hal Blumenfeld; Bonacchi, Niccolò; Tanya Brown; Diptyajit Das; Floris de Lange; Rony Hirschhorn; Kyle Sinan Taylan Kahraman; et al. Cogitate fMRI Data. 2024. 10.17617/1.dhjj-er02 Bonacchi, Niccolò; Tanya Brown; Diptyajit Das; Oscar Ferrante; Rony Hirschhorn; Ole Jensen; Kyle Sinan Taylan Kahraman; et al. Cogitate M-EEG Data. 2024. 10.17617/1.wqa3-wk71 Marcelo Armendariz; Katarina Bendtz; Melanie Boly; Bonacchi, Niccolò; Tanya Brown; Diptyajit Das; Sasha Devore; et al. Cogitate iEEG BIDS data. 2024. 10.17617/1.6qpg-gz82 Bonacchi, Niccolò; Tanya Brown; Diptyajit Das; Oscar Ferrante; Rony Hirschhorn; Ole Jensen; Kyle Sinan Taylan Kahraman; et al. Cogitate MEEG BIDS data. 2024. 10.17617/1.nzwp-7j89 Hal Blumenfeld; Bonacchi, Niccolò; Tanya Brown; Diptyajit Das; Floris de Lange; Rony Hirschhorn; Kyle Sinan Taylan Kahraman; et al. Cogitate fMRI BIDS data. 2024. 10.17617/1.8ax5-t263 Cogitate Consortium; Oscar Ferrante; Urszula Górska-Klimowska; Simon Henin; Rony Hirschhorn; Aya Khalaf; Alex Lepauvre; et al. Cogitate XNAT Data Release. 2024. 10.17617/1.k278-n152
Outra produção	Reproducibility of in-vivo electrophysiological measurements in mice. 2022. Laboratory, I.B.; Banga, K.; Benson, J.; Bonacchi, Niccolò; Bruijns, S.A.; Campbell, R.; Chapuis, G.A.; et al. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85133002014&partnerID=MN8TOARS. 10.1101/2022.05.09.491042 Partitioning variability in animal behavioral videos using semi-supervised variational autoencoders. 2021. Matthew R Whiteway; Dan Biderman; Yoni Friedman; Mario Dipoppa; E Kelly Buchanan; Anqi Wu; John Zhou; et al. https://doi.org/10.1101/2021.02.22.432309. 10.1101/2021.02.22.432309 Spatial maps in olfactory cortex during olfactory navigation. 2020. Cindy Poo; Gautam Agarwal; Niccolò Bonacchi; Zachary Mainen. https://doi.org/10.1101/2020.02.18.935494. 10.1101/2020.02.18.935494 Standardized and reproducible measurement of decision-making in mice. 2020. Valeria Aguillon-Rodriguez; Dora E. Angelaki; Hannah M. Bayer; Niccolò Bonacchi; Matteo Carandini; Fanny Cazettes; Gaelle A. Chapuis; et al. https://doi.org/10.1101/2020.01.17.909838. 10.1101/2020.01.17.909838 Data architecture for a large-scale neuroscience collaboration. 2019. Niccolò Bonacchi; Gaelle Chapuis; Anne Churchland; Kenneth D. Harris; Max Hunter; Cyrille Rossant; Maho Sasaki; et al. https://doi.org/10.1101/827873. 10.1101/827873
Software	Cogitate Consortium; Oscar Ferrante; Urszula Górska-Klimowska; Rony Hirschhorn; Aya Khalaf; Alex Lepauvre; Ling Liu (¿¿); David Richter; Bonacchi, Niccolò. "Cogitate-consortium/cogitate-experiment-code: v1.0". 2024. 10.5281/zenodo.14362839 Cogitate Consortium; Oscar Ferrante; Urszula Górska-Klimowska; Rony Hirschhorn; Aya Khalaf; Alex Lepauvre; Ling Liu (¿¿); David Richter; Bonacchi, Niccolò. "Cogitate-consortium/cogitate-experiment-code: v1.0". 2024. 10.5281/zenodo.14362838

Prémio

2009	Merit Diploma Instituto Superior de Psicologia Aplicada Centro de Investigacao, Portugal