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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Nuno Daniel Saraiva Agostinho

Nomes de citação

  • Saraiva-Agostinho, Nuno

Identificadores de autor

Ciência ID
0315-C8C7-6978
ORCID iD
0000-0002-5549-105X
Researcher Id
F-5516-2011

Endereços de correio eletrónico

  • nunoagostinho@medicina.ulisboa.pt (Profissional)

Moradas

  • Instituto de Medicina Molecular, Avenida Professor Egas Moniz, 1649-028, Lisboa, Lisboa, Portugal (Profissional)

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação - Bioinformática

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Formação
Grau Classificação
2017/09/01 - 2022
Em curso
 Ciências Biomédicas (Doutoramento)
Especialização em Biologia Computacional
Universidade de Lisboa Instituto de Medicina Molecular, Portugal
2016/10
Concluído
 Informática (Mestrado)
Especialização em Sem especialização
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
 19/20
2014
Concluído
 Biologia Celular e Molecular (Licenciatura)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
 16/20
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2021/12/06 - Atual Gestão de Ciência e Tecnologia European Bioinformatics Institute, Reino Unido

Outros

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2015/09/01 - 2017/10/25 MSc Thesis (NMorais lab) Universidade de Lisboa Instituto de Medicina Molecular, Portugal
Universidade de Lisboa Instituto de Medicina Molecular, Portugal
2013/03/01 - 2014/08/01 Internship (AAthanasiadis lab) Instituto Gulbenkian de Ciencia, Portugal
Instituto Gulbenkian de Ciencia, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2017/09/01 - 2021/10/31 Revolving around circular RNAs: computational exploration of their biogenesis and function
SFRH/BD/131312/2017
Bolseiro de Doutoramento
Universidade de Lisboa Instituto de Medicina Molecular, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2017/02/10 - 2017/08/31 psichomics: Alternative Splicing Quantification, Analysis and Visualisation in Cancer Data
IMM/BI/3-2017
Bolseiro de Investigação
Universidade de Lisboa Instituto de Medicina Molecular, Portugal
 Universidade de Lisboa Instituto de Medicina Molecular
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. Saraiva-Agostinho N; Barbosa-Morais NL. "Interactive Alternative Splicing Analysis of Human Stem Cells Using psichomics.". Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) (2020): http://europepmc.org/abstract/med/31960379.
    10.1007/978-1-0716-0301-7_10
  2. Nuno Saraiva-Agostinho; Nuno L Barbosa-Morais. "psichomics: graphical application for alternative splicing quantification and analysis". Nucleic Acids Research (2019): https://doi.org/10.1093/nar/gky888.
    10.1093/nar/gky888
  3. Gallego-Paez LM; Bordone MC; Leote AC; Saraiva-Agostinho N; Ascensão-Ferreira M; Barbosa-Morais NL. "Alternative splicing: the pledge, the turn, and the prestige : The key role of alternative splicing in human biological systems.". (2017): http://europepmc.org/abstract/med/28374191.
    10.1007/s00439-017-1790-y
  4. Deng M; Brägelmann J; Kryukov I; Saraiva-Agostinho N; Perner S. "FirebrowseR: an R client to the Broad Institute's Firehose Pipeline.". (2017): http://europepmc.org/abstract/med/28062517.
    10.1093/database/baw160
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2017/02/22 psichomics: Alternative Splicing Quantification, Analysis and Visualisation in Cancer Data Bioinformatics Open Days
(Braga, Portugal)
2016/12/06 Shiny App for Integrated Alternative Splicing Analysis from Large Transcriptomic Datasets European Bioconductor Developer’s Conference
Bioconductor (Basileia, Suiça)

Membro de comissão

Descrição da atividade
Tipo de participação 		Instituição / Organização
2018 - Atual Computational Biology and Bioinformatics Seminars member
Membro
 Universidade de Lisboa Instituto de Medicina Molecular, Portugal
2018 - 2019 PhD workshop committee member
Membro
 Universidade de Lisboa Instituto de Medicina Molecular, Portugal
Distinções

Prémio

2018 Excellent Poster Presentation Award for psichomics: a bioinformatics application for the quantification, analysis and visualisation of alternative splicing from large transcriptomic datasets
Associação Científica Proteomass, Portugal
2016 Member of the “PERSEIDS - Personalising Cancer Therapy through Integrated Modeling and Decision” research and technological project
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
2015 Top first-year student of the Master in Informatics
2009 1st prize of Philosophy for the prose "Porque vivo"

Outra distinção

2011 15th place in the 6th national edition of the Olympics of Biotechnology
2011 High school honour board (2010/2011)