Carlos André Viegas Barreto (8712-93FE-685B)

Curriculum Vitae

Carlos André Viegas Barreto

Carlos André Viegas Barreto. Completed the Mestrado in Mestrado em Biologia Celular e Molecular in 2018/09/17 by Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida and Licenciatura in Licenciatura em Ciências Biomédicas in 2016/06/28 by Universidade de Aveiro. Attends the Doutoramento in Doctoral Programme in Experimental Biology and Biomedicine by Universidade de Coimbra Instituto de Investigação Interdisciplinar since 2019/10/10. Is PhD Student in Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular. Published 10 articles in journals. Has 3 section(s) of books. Organized 6 event(s). Participated in 12 event(s). Has received 5 awards and/or honors. Participates and/or participated as Master Student Fellow in 1 project(s). Works in the area(s) of Natural sciences with emphasis on Biological Sciences with emphasis on Molecular Biology and Natural sciences with emphasis on Biological Sciences with emphasis on Biochemistry. In their professional activities interacted with 119 collaborator(s) co-authorship of scientific papers. In his curriculum Ciência Vitae the most frequent terms in the context of scientific, technological and artistic-cultural output are: Inteligência artificial; design computacional e descoberta de fármacos; vias de sinalização; algoritmos de previsão em tempo real; .

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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo: Carlos André Viegas Barreto
Data de nascimento: 1995/12/09
Género: Masculino

Nomes de citação

Barreto, Carlos A.V.

Identificadores de autor

Ciência ID: 8712-93FE-685B
ORCID iD: 0000-0003-1459-7680
Google Scholar ID: SlpPtEoAAAAJ&hl
Researcher Id: F-3995-2018

Endereços de correio eletrónico

cbarreto@cnc.uc.pt (Profissional)

Telefones

Telemóvel

910720653 (Pessoal)

Moradas

Estrada de São Bernardo 189 1º Esquerdo, 3810-175, Aveiro, Aveiro, Portugal (Pessoal)

Websites

carlosavbarreto.github.io (Pessoal)

Domínios de atuação

Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia Molecular
Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Bioquímica

Idiomas

Idioma	Conversação	Leitura	Escrita	Compreensão	Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)

Formação

	Grau	Classificação
2019/10/10 - 2023 Em curso	Doctoral Programme in Experimental Biology and Biomedicine (Doutoramento) Universidade de Coimbra Instituto de Investigação Interdisciplinar, Portugal
2016/08/02 - 2018/09/17 Concluído	Mestrado em Biologia Celular e Molecular (Mestrado) Especialização em Sem especialização Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal "Applying computational tools to the study of GPCRs structure and dynamics" (TESE/DISSERTAÇÃO)	18
2013/09/12 - 2016/06/28 Concluído	Licenciatura em Ciências Biomédicas (Licenciatura) Especialização em Menor em Biomedicina Molecular Universidade de Aveiro, Portugal "n/a" (TESE/DISSERTAÇÃO)	15

Percurso profissional

Ciência

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2023/02/01 - 2023/05/31	Investigador visitante (Investigação)	Icahn School of Medicine at Mount Sinai, Estados Unidos
	Icahn School of Medicine at Mount Sinai, Estados Unidos
2019/01/21 - 2019/10/31	Estagiário de Investigação (Investigação)	CNC.IBILI, Portugal

Outros

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2019/11/01 - Atual	PhD Student	Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
	Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
2017/09/01 - 2018/09/15	Master's Student	Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
	CNC - Data Driven Molecular Design Group, Portugal
2018/04/03 - 2018/05/18	Visiting Student, under the grant from HPC Europa3 Programme	Universiteit Utrecht, Países Baixos

2017/05/02 - 2017/05/26	Trainee, under Laboratory Rotation from Master's Program	Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal

2017/04/03 - 2017/04/28	Trainee, under Laboratory Rotation from Master's Program	Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

2017/01/30 - 2017/02/24	Trainee, under Laboratory Rotation from Master's Program	Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal

2016/07/11 - 2016/07/31	Trainee	Universidade de Aveiro Instituto de Biomedicina, Portugal

2015/01/01 - 2016/05/31	Voluntariado	Unidade de Cuidados Continuados da Santa Casa da Misericórdia de Ílhavo, Portugal

Projetos

Projeto

	Designação	Financiadores
2021/02/01 - 2024/01/31	Descoberta do Interactoma vírus-hospedeiro: uma abordagem guiada por AI e dados multi-ómicos <br> DSAIPA/DS/0118/2020 Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento, Portugal Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal Universidade de Coimbra Instituto de Investigação Clínica e Biomédica de Coimbra, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Em curso
2019/01/21 - 2019/10/31	Membrane proteins - development of new computational approaches and its application to G-protein Coupled Receptors PTDC/QUI-OUT/32243/2017 Bolseiro de Mestrado Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Em curso

Produções

Publicações

Artigo em conferência	Barreto, Carlos; Machuqueiro, Miguel; Bonvin, Alexandre; Moreira, Irina; Barreto, Carlos A.V.; Moreira IS. "Structural and dynamic understanding of the ghrelin receptor high constitutive activity". Trabalho apresentado em MOL2NET 2017, 2017. 10.3390/mol2net-03-05089 Bueschbell, Beatriz; Preto, António; Barreto, Carlos; Schiedel, Anke; Moreira, Irina. "Creating a valid in silico Dopamine D2-receptor model for small molecular docking studies". Trabalho apresentado em MOL2NET 2017, 2017. 10.3390/mol2net-03-05088
Artigo em revista	Caniceiro, Ana B.; Bueschbell, Beatriz; Barreto, Carlos A.V.; Preto, António J.; Moreira, Irina S.. "MUG: A mutation overview of GPCR subfamily A17 receptors". Computational and Structural Biotechnology Journal 21 (2023): 586-600. http://dx.doi.org/10.1016/j.csbj.2022.12.031. 10.1016/j.csbj.2022.12.031 Bueschbell, Beatriz; Magalhães, Pedro R.; Barreto, Carlos A.V.; Melo, Rita; Schiedel, Anke C.; Machuqueiro, Miguel; Moreira, Irina S.. "The World of GPCR dimers – Mapping dopamine receptor D2 homodimers in different activation states and configuration arrangements". Computational and Structural Biotechnology Journal 21 (2023): 4336-4353. http://dx.doi.org/10.1016/j.csbj.2023.08.032. 10.1016/j.csbj.2023.08.032 Caldeira, G. L.; Inácio, A. S.; Beltrão, N.; Barreto, C. A. V.; Rodrigues, M. V.; Rondão, T.; Macedo, R.; et al. "Aberrant hippocampal transmission and behavior in mice with a stargazin mutation linked to intellectual disability". Molecular Psychiatry (2022): http://dx.doi.org/10.1038/s41380-022-01487-w. 10.1038/s41380-022-01487-w Nícia Rosário-Ferreira; Salete J. Baptista; Carlos A. V. Barreto; Filipe E. P. Rodrigues; Tomás F. D. Silva; Sara G. F. Ferreira; João N. M. Vitorino; et al. "In Silico End-to-End Protein–Ligand Interaction Characterization Pipeline: The Case of SARS-CoV-2". ACS Synthetic Biology (2021): https://doi.org/10.1021/acssynbio.1c00368. 10.1021/acssynbio.1c00368 Barreto, Carlos A.V.. "Decoding Partner Specificity of Opioid Receptor Family". Frontiers in Molecular Biosciences 8 (2021): http://dx.doi.org/10.3389/fmolb.2021.715215. 10.3389/fmolb.2021.715215 A. J. Preto; Carlos A. V. Barreto; Salete J. Baptista; José Guilherme de Almeida; Agostinho Lemos; André Melo; M. Nátalia D. S. Cordeiro; et al. "Understanding the Binding Specificity of G-Protein Coupled Receptors toward G-Proteins and Arrestins: Application to the Dopamine Receptor Family". Journal of Chemical Information and Modeling (2020): https://doi.org/10.1021/acs.jcim.0c00371. 10.1021/acs.jcim.0c00371 Carolina Gomes; Diana Ferreira; João P. F. Carvalho; Carlos A. V. Barreto; Joana Fernandes; Marisol Gouveia; Fernando Ribeiro; Ana S. Duque; Sandra I. Vieira. "Current genetic engineering strategies for the production of antihypertensive ACEI peptides". Biotechnology and Bioengineering (2020): https://doi.org/10.1002/bit.27373. 10.1002/bit.27373 Beatriz Bueschbell; Carlos Barreto; António J. Preto; Anke Schiedel; Irina Moreira. "A Complete Assessment of Dopamine Receptor- Ligand Interactions through Computational Methods". Molecules (2019): https://www.mdpi.com/1420-3049/24/7/1196. 10.3390/molecules24071196 Melo R; Lemos A; Preto AJ; Bueschell B; Matos-Filipe P; Barreto C; Almeida JG; et al. "An overview of antiretroviral agents for treating HIV infection in paediatric population.". Current medicinal chemistry (2018): http://europepmc.org/abstract/med/30182840. 10.2174/0929867325666180904123549 Schiedel AC; Kose M; Barreto C; Bueschbell B; Morra G; Sensoy O; Moreira IS. "Prediction and Targeting of Interaction Interfaces in G-protein Coupled Receptor Oligomers.". Current topics in medicinal chemistry (2018): http://europepmc.org/abstract/med/29866008. 10.2174/1568026618666180604082610
Capítulo de livro	Preto, A.J.; Marques-Pereira, C; Baptista, Salete J.; Bueschbell, B.; Barreto, Carlos A.V.; Gaspar, A.T.; Pinheiro, I.; et al. "Targeting GPCRs Via Multi-Platform Arrays and AI". In Comprehensive Pharmacology, 135-162. Elsevier, 2022. Publicado • 10.1016/b978-0-12-820472-6.00048-7 Barreto, Carlos A.V.; Baptista, Salete J.; Bueschbell, Beatriz; Magalhães, Pedro; Preto, António; Lemos, Agostinho; Rosário-Ferreira, Nicia; et al. "Arrestin and G Protein Interactions with GPCRs: A Structural Perspective". In GPCRs as Therapeutic Targets. 2022. Publicado • 10.1002/9781119564782.ch5 Barreto, Carlos A.V.; Baptista, Salete J.; Preto, António José; Matos-Filipe, Pedro; Mourão, Joana; Melo, Rita; Moreira, Irina. "Prediction and targeting of GPCR oligomer interfaces". In Oligomerization in Health and Disease: From Enzymes to G Protein-Coupled Receptors, 105-149. Elsevier, 2020. 10.1016/bs.pmbts.2019.11.007
Poster em conferência	Caniceiro, A. B.; Büschbell, Beatriz; Preto, A.J.; Barreto, Carlos A.V.; Moreira, I.S.. "MUTPROT database: a mutation overview of GPCR sub-family A17 receptors". Trabalho apresentado em Encontro de Jovens Investigadores de Biologia Computacional Estrutural, 2021. Gouveia, R. P.; Barreto, Carlos A.V.; Baptista, Salete J.; Preto, A.J.; Caldeira, Gladys Lima; Carvalho, Ana Luisa; Melo, Rita; Irina de Sousa Moreira. "The study of AMPAR: Stargazin interface through molecular dynamics". Trabalho apresentado em Encontro de Jovens Investigadores de Biologia Computacional Estrutural, 2021. Barreto, Carlos A.V.; Salete J. Baptista; Antonio José Preto; Daniel Silvério; Rita Melo; Irina S. Moreira. "Decoding Partner Specificity in Opioid Receptor Family". Trabalho apresentado em Bioinformatics Open Days, 2021. Barreto, Carlos A.V.; Melo, Rita; Magalhães, Pedro R.; Renault, Pedro; Machuqueiro, Miguel; Moreira, Irina S.. "Understanding Structural and Dynamic Differences of GHSR-Gq nad GHSr-Arr Complexes". Trabalho apresentado em Encontro Jovens Investigadores de Biologia Estrutural e Computacional, 2018.

Atividades

Apresentação oral de trabalho

	Título da apresentação	Nome do evento Anfitrião (Local do evento)
2021/12/21	MODELLER Worskop	Computational Structural Biology Tools Workshop Biodata.pt; ELIXIR-PT (Coimbra, Portugal)
2021/12/20	DRD2 homo-dimers – a world of possibilities	8th Meeting of Young Researchers in Structural Computational Biology (Coimbra, Portugal)
2019/02/25	Applying Computational Tools to the Study of GPCRs Structures and Dynamics	Advanced Course in COMPUTATIONAL BIOLOGY PhD Programme in EXPERIMENTAL BIOLOGY AND BIOMEDICINE at CNC (Coimbra, Portugal)

Organização de evento

	Nome do evento Tipo de evento (Tipo de participação)	Instituição / Organização
2023/12/01 - 2023/12/31	3D-Bioinfo-PT Intermediate Workshop (2023/12/19) Oficina (workshop) (Membro da Comissão Organizadora)
2023/12/01 - 2023/12/31	3D-Bioinfo-PT Annual Meeting (2023/12/18) Encontro (Membro da Comissão Organizadora)
2023/10/01 - 2023/10/31	3D-Bionfo-PT Introductory Workshop (2023/10/20) Oficina (workshop) (Membro da Comissão Organizadora)
2023/06/01 - 2023/06/30	3D-Bioinfo-PT Advanced Workshop (2023/06/15 - 2023/06/16) Oficina (workshop) (Membro da Comissão Organizadora)
2021/06/01 - 2022/01/19	Member of the Organizing Committee of BEB Day 2022 - The Overview Effect (2022/01/18 - 2022/01/19) Simpósio (Membro da Comissão Organizadora)	Universidade de Coimbra, Portugal Universidade de Coimbra Instituto de Investigação Interdisciplinar, Portugal Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
2017/12 - 2017/12	Member of Organizing Committee Encontro de Jovens Investigadores em Biologia Computacional e Estrutural - Edição 2017 (2017/12 - 2017/12) Encontro (Membro da Comissão Organizadora)	Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal

Participação em evento

	Descrição da atividade Tipo de evento	Nome do evento Instituição / Organização
2021/09/09 - 2021/09/10	GROMACS workshop: a collaboration between BioExcel and national eurohpc competence center Oficina (workshop)	GROMACS workshop: a collaboration between BioExcel and national eurohpc competence center Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
2021/04/12 - 2021/04/14	4th ERNEST Conference Conferência	4th ERNEST Conference European Research Network on Signal Transduction , Alemanha
2019/01/25 - 2019/01/25	Encontro sobre Estratégias Inteligentes para Química Computacional Encontro	Universidade de Coimbra Departamento de Química, Portugal
2018/12/21 - 2018/12/21	Encontro de Jovens Investigadores de Biologia Computacional e Estrutural 2018 Encontro	Universidade do Porto Faculdade de Medicina, Portugal
2018/04/23 - 2018/04/23	2018 Bijvoet Tutorial Symposium Simpósio	Bijvoet Center, Países Baixos
2017/12/22 - 2017/12/22	Encontro de Jovens Investigadores de Biologia Computacional e Estrutural 2017 Encontro	Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
2017/11/25 - 2017/11/25	Mind Your Data Conferência	Junior Enterprise for Science and Technology (JEST), Portugal
2017/09/04 - 2017/09/14	2017 Summer School in Computational Biology - from molecules to tissues	Universidade de Coimbra, Portugal
2017/03/29 - 2017/03/31	Glisten Symposium Simpósio	Universidade do Porto Instituto de Investigação e Inovação em Saúde, Portugal
2015/04/01 - 2015/06/30	Programa Municipal "Vocação". Integrei a equipa do Gabinete de Comunicação e Imagem da Câmara Municipal de Ílhavo. Outro	Câmara Municipal de Ílhavo, Portugal
2015/03/12 - 2015/03/14	VI Jornadas Nacionais de Ciências Biomédicas Encontro	Universidade do Algarve, Portugal
2013/07/01 - 2013/07/31	Programa Municipal de Ocupação de Tempos Livres. Integrei a equipa do Gabinete de Ação Social da Câmara Municipal de Ílhavo Outro	Câmara Municipal de Ílhavo, Portugal

Tutoria

	Tópico	Nome do aluno
2021/05/01 - 2021/05/31	Daily co-Advisor of Master Student's Rotation	Guilherme Gabrial
2019/09 - 2019/09	Structural Modeling and Molecular Docking	Computational Biology Summer School selected students (1)
2019/02 - 2019/02	Daily co-Advisor of Master Student's Rotation	Raquel Gouveia
2014/09/24 - 2015/07/15	Mentor on Programa de Tutoria UA	Vários Alunos

Distinções

Prémio

2023	FLAD R&D @ USA Grant 2023 Fundação Luso-Americana para o Desenvolvimento, Portugal
2022	Fulbright Grant for Research with the support of FCT, AY2022/2023 Fulbright Portugal, Portugal
2019	Bolsa de Investigação para Mestre Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
2019	FCT PhD Fellowship Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
2018	Grant from HPC Europa3 Programme (730897)