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João André Figueiredo Pereira. Completed the MsC in Biomedical Engineering in 2017 at the Faculty of Sciences and Technology, Universidade de Coimbra. Currently a PhD Candidate at the University of Coimbra with a Fundação de Ciência e Tecnologia (FCT) funded project entitled "Inducing neuroplasticity in stroke: a connectivity-based neurofeedback approach using functional near-infrared spectroscopy (fNIRS)" currently being developed at Coimbra Institute for Biomedical Imaging and Translational Research (CIBIT). Published 5 articles in journals. Organized 5 events. Participated in 11 events. Co-supervised 2 works of course completion of LSc/BSc. Has received 8 awards and/or honors. Participated as Master Student Fellow in 1 project, and in other 4 projects. Works in the area of Engineering and Technology with emphasis on Medical Engineering. In his professional activities interacted with 22 collaborators co-authorship of scientific papers. In his curriculum Ciência Vitae the most frequent terms in the context of scientific outputs are: functional Magnetic Resonance Imaging (fMRI) ; Neuroimaging; Neurofeedback; functional near-infrared Spectroscpy (fNIRS); Functional Connectivity; Innovation in Healthcare.
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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
João André Figueiredo Pereira

Nomes de citação

  • Pereira, João

Identificadores de autor

Ciência ID
8F1D-AECC-5828
ORCID iD
0000-0001-9620-1904

Endereços de correio eletrónico

  • joaoandrefpereira@gmail.com (Profissional)
  • jpereira@uc.pt (Profissional)

Moradas

  • Universidade de Coimbra, Pólo das Ciências da Saúde Azinhaga de, R. Santa Comba, 3000-548, Coimbra, Coimbra, Portugal (Profissional)

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências da Engenharia e Tecnologias - Engenharia Médica

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Espanhol; Castelhano Utilizador independente (B2) Utilizador independente (B2) Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B2) Utilizador independente (B1)
Alemão Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1)
Formação
Grau Classificação
2019/09/01 - 2023/09/01
Em curso
 Doutoramento em Engenharia Biomédica (Curso de doutoramento (conclusão de unidades curriculares))
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
2012/11/01 - 2017/02/27
Concluído
 Engenharia Biomédica (Mestrado integrado)
Especialização em Imagem e Radiação
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
"Real-time fMRI neurofeedback based on Interhemispheric functional connectivity: a motor imagery paradigm" (TESE/DISSERTAÇÃO)
2011/09/01 - 2012/11/01
Frequentou
 Engenharia Física (Mestrado integrado)
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2017/06/01 - Atual Investigador (Investigação) Coimbra Institute for Biomedical Imaging and Translational Research, Portugal
Universidade de Coimbra Instituto de Ciências Nucleares Aplicadas à Saúde, Portugal

Cargos e Funções

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2015/10/01 - 2016/06/30 Vice-Presidente Núcleo de Estudantes do Departamento de Física da Universidade de Coimbra (NEDF), Portugal
Universidade de Coimbra Departamento de Física, Portugal

Outros

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2019/03/01 - 2019/11/30 Starship Fellow - EITH Health Innovation Fellowship Program 2019 EIT Health, Alemanha
Universidade de Coimbra, Portugal
(...)
2016/04/01 - 2016/06/30 Product Developer Vega Ventures, Portugal
Vega Ventures, Portugal
(...)
2015/09/01 - 2015/09/30 Summer Internship at ICNAS-Produção Universidade de Coimbra Instituto de Ciências Nucleares Aplicadas à Saúde, Portugal
Universidade de Coimbra Instituto de Ciências Nucleares Aplicadas à Saúde, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2021/01/01 - 2024/12/30 Inducing neuroplasticity in stroke: a connectivity-based neurofeedback approach using functional near-infrared spectroscopy (fNIRS)
2020.04899.BD
Bolseiro de Doutoramento
Coimbra Institute for Biomedical Imaging and Translational Research, Portugal

Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2022/06/30 - 2023/06/30 Playback the music of the brain - decoding emotions elicited by musical sounds in the human brain
EXPL/PSI-GER/0948/2021
Investigador
Universidade de Coimbra Instituto de Ciências Nucleares Aplicadas à Saúde, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2021 - 2022 Window to the Brain / Janela para o cérebro
.
Technical development
Coimbra Institute for Biomedical Imaging and Translational Research, Portugal
 Universidade de Coimbra
Em curso
2017/06/01 - 2020/12/23 BIGDATIMAGE-From computational modelling and clinical research to the development of neuroimaging big data platforms for discovery of novel biomarker
CENTRO-01-0145-FEDER-000016
Bolseiro de Mestrado
Concluído

Outro

Designação Financiadores
2019/03/01 - 2019/11/06 EIT Health - Starship Innovation Fellowship Program
Starship Program
Outra
EIT Health, Alemanha

Universidade de Coimbra, Portugal

University of Oxford, Reino Unido

Universidad de Navarra IESE Business School, Espanha

Karolinska Institutet, Suécia

Hospital Sant Joan de Déu, Espanha
Em curso
2016/02/01 - 2017/02/27 BRAINTRAIN: Taking imaging into the therapeutic domain: Self-regulation of brain systems for mental disorders
FP7-HEALTH-2013-INNOVATION-1 - 602186
Outra
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em conferência
  1. Pereira, João; Direito, Bruno; Sayal, Alexandre; Ferreira, Carlos; Castelo-Branco, Miguel. "Optimization of a Motor Imagery Paradigm for Self-modulation of Bilateral Premotor Interhemispheric Functional Connectivity in fMRI Neurofeedback". Trabalho apresentado em XV Mediterranean Conference on Medical and Biological Engineering and Computing – MEDICON 2019, Coimbra, 2019.
    Aceite para publicação • 10.1007/978-3-030-31635-8_212
  2. Fernandes, Tiago; Pereira, João; Direito, Bruno; Sayal, Alexandre; Castelo-Branco, Miguel. "Statistical validation of State-Space Granger Causality with Time-Reverse Surrogate and its boundaries in fMRI data". Trabalho apresentado em 15th International Conference on Computational Intelligence methods for Bioinformatics and Biostatistics, Lisboa, 2018.
Artigo em revista
  1. Pereira, Daniela Jardim; Pereira, João; Sayal, Alexandre; Morais, Sofia; Macedo, António; Direito, Bruno; Castelo-Branco, Miguel. "Functional and structural connectivity success predictors of real time fMRI neurofeedback targeting DLPFC: contributions from central executive, salience and default mode networks". Network Neuroscience (2023): 1-34. http://dx.doi.org/10.1162/netn_a_00338.
    10.1162/netn_a_00338
  2. Schroeder, Philipp A.; Artemenko, Christina; Kosie, Jessica E.; Cockx, Helena; Stute, Katharina; Pereira, João; Klein, Franziska; Mehler, David M. A.. Autor correspondente: Mehler, David M. A.. "Using preregistration as a tool for transparent fNIRS study design". Neurophotonics 10 02 (2023): http://dx.doi.org/10.1117/1.nph.10.2.023515.
    10.1117/1.nph.10.2.023515
  3. Pereira, Daniela Jardim; Sayal, Alexandre; Pereira, João; Morais, Sofia; Macedo, António; Direito, Bruno; Castelo-Branco, Miguel. "Neurofeedback-dependent influence of the ventral striatum using a working memory paradigm targeting the dorsolateral prefrontal cortex". Frontiers in Behavioral Neuroscience 17 (2023): http://dx.doi.org/10.3389/fnbeh.2023.1014223.
    10.3389/fnbeh.2023.1014223
  4. Pereira, João; Bruno Miguel Direito Pereira Leitão (CA13-D8F8-290E); Lührs, Michael; Miguel de Sá e Sousa de Castelo Branco; Teresa Maria da Silva Sousa. "Multimodal assessment of the spatial correspondence between fNIRS and fMRI hemodynamic responses in motor tasks". Scientific Reports 13 1 (2023): http://dx.doi.org/10.1038/s41598-023-29123-9.
    10.1038/s41598-023-29123-9
  5. Ana Carolina Gonçalves Sousa Travassos; Alexandre Sayal Campos (0017-DA99-AAD5); Bruno Miguel Direito Pereira Leitão (CA13-D8F8-290E); Pereira, João; Teresa Maria da Silva Sousa; Castelo-Branco, Miguel. "Assessing MR-compatibility of somatosensory stimulation devices: A systematic review on testing methodologies". Frontiers in Neuroscience 17 (2023): http://dx.doi.org/10.3389/fnins.2023.1071749.
    10.3389/fnins.2023.1071749
  6. Direito, Bruno; Ramos, Manuel; Pereira, João; Sayal, Alexandre; Sousa, Teresa; Castelo-Branco, Miguel. "Directly Exploring the Neural Correlates of Feedback-Related Reward Saliency and Valence During Real-Time fMRI-Based Neurofeedback". Frontiers in Human Neuroscience 14 (2021): http://dx.doi.org/10.3389/fnhum.2020.578119.
    10.3389/fnhum.2020.578119
  7. Rodrigues, Aline Teotonio; Sousa, Camila Tavares; Pereira, João; Figueiredo, Isabel Vitória; Lima, Tácio de Mendonça. "Mobile Applications (Apps) to Support the Hepatitis C Treatment: A Systematic Search in App Stores". Therapeutic Innovation & Regulatory Science (2020): http://dx.doi.org/10.1007/s43441-020-00201-8.
    Publicado • 10.1007/s43441-020-00201-8
  8. Fernandes, Tiago Timóteo; Direito, Bruno; Sayal, Alexandre; Pereira, João; Andrade, Alexandre; Castelo-Branco, Miguel. "The boundaries of State-Space Granger Causality Analysis applied to BOLD simulated data: a comparative modelling and simulation approach". Journal of Neuroscience Methods (2020): 108758. http://dx.doi.org/10.1016/j.jneumeth.2020.108758.
    10.1016/j.jneumeth.2020.108758
  9. Fernandes, Tiago (FE12-299B-14F0); Direito, Bruno (CA13-D8F8-290E); Sayal, Alexandre (0017-DA99-AAD5); Pereira, João; Andrade, Alexandre; Castelo-Branco, Miguel. "The boundaries of State-Space Granger Causality Analysis applied to BOLD simulated data: a comparative modelling and simulation approach". bioarxiv (2020):
    Acesso aberto • Publicado • doi: https://doi.org/10.1101/2020.04.10.033258
  10. Pereira, João. "Self-Modulation of Premotor Cortex Interhemispheric Connectivity in a Real-Time fMRI Neurofeeback Study Using an Adaptive Approach". Brain Connectivity (2019): https://www.liebertpub.com/doi/pdf/10.1089/brain.2019.0697.
    Publicado • https://doi.org/10.1089/brain.2019.0697
Poster em conferência
  1. Pereira, João; Lührs, Michael; Teresa Maria da Silva Sousa (921A-4C43-3CE6); Sorger, Bettina; Goebel, Rainer; Castelo-Branco, Miguel; Bruno Miguel Direito Pereira Leitão (CA13-D8F8-290E). "Assessing the impact of the systemic physiological activity: a multi-paradigm fNIRS study". Trabalho apresentado em sfNIRS 2022, 2022.
  2. Pereira, João; Bruno Miguel Direito Pereira Leitão (CA13-D8F8-290E); Michael Luhrs; Castelo-Branco, Miguel; Teresa Maria da Silva Sousa (921A-4C43-3CE6). Autor correspondente: Pereira, João. "Characterization of Spatial and Temporal Dynamics Between Hemodynamic Responses Measured by fMRI and fNIRS". Trabalho apresentado em Society of fNIRS Virtual Conference 2021, 2021.
  3. Ramos, Manuel; Direito, Bruno; Sayal, Alexandre; Pereira, João; Sousa, Teresa. "Directly exploring the neural correlates of feedback-related reward saliency during fMRI-based Neurofeedback". Trabalho apresentado em real time functional imaging and neurofeedback conference (RT-FIN), 2019.
  4. Pereira, João; Direito, Bruno; Sayal, Alexandre; Ferreira, Carlos. "Self-Modulation of Premotor Cortex Interhemispheric Connectivity in a Real-Time fMRI Neurofeedback Study Using an Adaptive Approach". Trabalho apresentado em Real-time functional imaging and neurofeedback conference (RT-FIN), 2019.
  5. Direito, Bruno; Mouga, Susana; Sayal, Alexandre; Pereira, João; Simões, Marco; Castelo-Branco, Miguel. "Exploring success: understanding individual variability in an rt-fMRI NF clinical trial". Trabalho apresentado em Symposium on Neurofeedback and other neurotechnologies in psychiatry: Braintrain Annual Meeting, 2018.
Pré-impressão
  1. Pereira, Daniela; Morais, Sofia; Sayal, Alexandre; Pereira, João; Meneses, Sofia; Cardoso, Graça Areias; Direito, Bruno; Macedo, Antonio; Castelo-Branco, Miguel. "Neurofeedback Training of Executive Function in Autism Spectrum Disorder: Distinct Effects on Brain Activity Levels and Compensatory Connectivity Changes". 2023. http://dx.doi.org/10.2139/ssrn.4345566.
    10.2139/ssrn.4345566
  2. Schroeder, Philipp A.; Artemenko, Christina; Kosie, Jessica Elizabeth; Cockx, Helena; Stute, Katharina; Pereira, João; Klein, Franziska; Mehler, David Marc Anton. "Using preregistration as a tool for transparent fNIRS study design". 2022. http://dx.doi.org/10.31222/osf.io/zfawx.
    10.31222/osf.io/zfawx
Tese / Dissertação
  1. Pereira, João. "Real-time fMRI neurofeedback based on interhemispheric functional connectivity: a motor imagery paradigm". Mestrado, Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, 2017. https://estudogeral.sib.uc.pt/handle/10316/84359.

Propriedade Intelectual

Pedido provisório de patente
  1. 2019. "Support bar with sensors measuring touch location and force providing information about a person's balance (FRED - Fall Reduction and Evaluation Device)".
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2020/01/20 Connectivity based Neurofeedback to boost neuroplasticity in stroke using fNIRS Research Methods Workshop Presentation
Departamento de Informática da Universidade de Coimbra (Coimbra, Portugal)
2019/12/19 Shed some light on brain function using functional spectroscopy (fNIRS) Equipamentos de Imagiologia Médica
Instituto Superior de Engenharia de Coimbra (Coimbra, Portugal)
2019/09/28 Self-Modulation of Premotor Cortex Interhemispheric Connectivity in a Real-Time Functional Magnetic Resonance Imaging Neurofeedback Study Using an Adaptive Approach 5th Mediterranean Conference on Medical and Biological Engineering and Computing (MEDICON 2019)
(Coimbra, Portugal)
2018/12/10 Functional Magnetic Resonance Imaging Fundamentals and applications (functional Tasks and Neurofeedback ) Biomedical Engineer MSc Class 'Instrumentation for Medical Imaging'
Paulo Crespo
2018/09/25 Exploring success: understanding individual variability in an rt-fMRI NF clinical trial BRAINTRAIN Annual General Meeting and BRAINTRAIN Symposium
(Maastricht)
2018/07/18 Real time functional magnetic resonance imaging fMRI Neurofeedback Presentation to Exchange Students
Faculty of Medicine, University of Coimbra
2018/04/17 Directed functional connectivity in simulated fMRI data and in Neurofeedback task (STIPED WP7) STIPED Anual Meeting presentation of WP7: Mechanisms of clinical efficacy of brain stimulation in children and adolescents
Faculty of Medicine, University of Coimbra
2017/09/15 Activation and functional connectivity based real-time fMRI neurofeedback (fMRI-NF) - BRAINTRAIN project Exchange Students Presentation
Faculty of Medicine, University of Coimbra
2017/07/25 Activation and functional connectivity based real-time fMRI neurofeedback (fMRI-NF) - BRAINTRAIN project Exchange Students Presentation
Faculty of Medicine, University of Coimbra
2017/02/18 Real-time fMRI neurofeedback based on Interhemispheric functional connectivity: a motor imagery paradigm 5th Portuguese Meeting on Bioengineering (ENBENG 2017)
IEEE (Coimbra, Portugal)
2016/12/16 Functional Magnetic Resonance Imaging Fundamentals and applications (Neurofeedback) MSc Biomedical Engineer class 'Instrumentation for Medical Imaging'
Paulo Crespo

Orientação

Título / Tema
Papel desempenhado 		Curso (Tipo)
Instituição / Organização
2021/03/01 - 2021/09/01 Biomedical Engineering applied to the study of the brain - optimization of a Human-Machine Interface (HMI) setup
Coorientador de Laura Gaspar
 Licenciatura em Engenharia Biomédica (Licenciatura/Bacharelato)
Instituto Politécnico de Coimbra Instituto Superior de Engenharia de Coimbra, Portugal
2020/02/17 - 2020/06/30 Characterization of motor network using a multimodal - fNIRS and fMRI - approach
Coorientador de Nelson Martins
 Licenciatura em Engenharia Biomédica (Licenciatura/Bacharelato)
Instituto Politécnico de Coimbra Instituto Superior de Engenharia de Coimbra, Portugal

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação) 		Instituição / Organização
2021/03/06 - 2021/03/06 From Neuroimaging to Brain-Computer Interfaces (BCI) Workshop inserted within ENEEB (National Meeting of Biomedical Engineering Students) 2021 (2021/03/06 - 2021/03/06)
Oficina (workshop) (Coorganizador)
 Coimbra Institute for Biomedical Imaging and Translational Research, Portugal
2021/03/03 - 2021/03/03 Virtual Visit to Coimbra Institute of Biomedical Imaging and Translational Research (CIBIT) inserted within ENEEB (National Meeting of Biomedical Engineering Students) 2021 (2021/03/03 - 2021/03/03)
Oficina (workshop) (Coorganizador)
 Coimbra Institute for Biomedical Imaging and Translational Research, Portugal
2020/01/24 - 2020/01/24 Aliança para o Cancro do Pulmão (2020/01/24 - 2020/01/24)
Mesa-redonda (Membro da Comissão Organizadora)
 Liga Portuguesa Contra o Cancro, Portugal

Pulmonale, Portugal

Sociedade Portuguesa de Pneumologia, Portugal

AstraZeneca AB, Suécia
2018/03/13 - 2018/03/14 Brain Week 2018 (Escola EB 2,3 Martim de Freitas)- grupo MCB (2018/03/13 - 2018/03/19)
Exposição (Outra)
 Universidade de Coimbra Faculdade de Medicina, Portugal
2016/10/24 - 2016/10/25 Medical Devices in Brain Research Symposium – from design to clinical application (2016/10/24 - 2016/10/25)
Simpósio (Outra)
 Universidade de Coimbra, Portugal

CNC.IBILI, Portugal

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento 		Nome do evento
Instituição / Organização
2021/01/25 - 2021/02/06 Virtual fNIRS Training Course 2021 - NIRx
Oficina (workshop)
2020/06/15 - 2020/08/10 HelloAIRIS 2020 - Artificial Intelligence in Healthcare
Oficina (workshop)
EIT Health, Alemanha

Leitat, Espanha

Kungliga Tekniska Högskolan, Suécia
2020/07/20 - 2020/07/23 Neuroprosthetics - Virtual Summer School 2020
Oficina (workshop)
Université de Montréal Faculté de Médecine, Canadá

McGill University Department of Medicine, Canadá

Polytechnique Montréal, Canadá

HEC Montréal, Canadá
2020/06/15 - 2020/06/19 ARTscientific webinar 2020 - Revealing the art of Near Infrared Spectroscopy
Outro
Artinis Medical Systems BV, Países Baixos
2020/04/20 - 2020/04/24 g.tec's BCI & Neurotechnology Spring School 2020
Oficina (workshop)
2020/04/16 - 2020/04/24 NIRx Advanced fNIRS workshop - London
Oficina (workshop)
2020/04/20 - 2020/04/22 NYC Neuromodulation Online 2020 Conference- Invasive and Non-invasive Neuro-Stimulation for Evaluation and Recovery of Motor Function
Conferência
 NYC Neuromodulation Online 2020 Conference
The City College of New York Department of Biomedical Engineering, Estados Unidos
2019/11/15 - 2019/11/15 g.tec's Brain-Computer Interface Workshop
Oficina (workshop)
Universidade de Coimbra Instituto de Sistemas e Robótica, Portugal
2018/04/17 - 2018/04/17 World Health Summit Regional Meeting 2018 ; Global Health Tallk “Artificial Intelligence and Health: Future Perspectives”
Conferência
Universidade de Coimbra, Portugal
2017/04/04 - 2017/04/07 Bial Foundation 12th Symposium "Behind and Beyond the Brain"
Conferência
 Behind and Beyond the Brain
Fundação Bial, Portugal
2015/03/30 - 2015/04/01 Euro Mini Conference on Improving Healthcare : new challenges, new approaches
Universidade de Coimbra, Portugal

Júri de grau académico

Tema
Tipo de participação 		Nome do candidato (Tipo de grau)
Instituição / Organização
2020/07/23 Estudo dos correlatos neuronais da perceção visual e do movimento através espectroscopia funcional de luz próxima ao infravermelho (fNIRS)
Vogal
 Nelson Filipe de Matos Martins (Outro)
Instituto Politécnico de Coimbra Instituto Superior de Engenharia de Coimbra, Portugal

Arbitragem científica em revista

Nome da revista (ISSN) Editora
2020/07/03 - 2020/07/24 F1000Research (2046-1402) F1000 Research Ltd

Curso / Disciplina lecionado

Disciplina Curso (Tipo) Instituição / Organização
2015/02/06 - 2015/02/20 Experimental Radiobiology and Radioprotection (Outros) Universidade de Coimbra Faculdade de Medicina, Portugal

Tutoria

Tópico Nome do aluno
2019/07 - 2019/09 Brain Decoding Bi-stable stimuli using fNIRS Mafalda Ferreira
Distinções

Prémio

2019 The Best Pitch Award - Starship 2019 EIT Health
EIT Health, Alemanha
2019 Junior EIT Health Alumni Pitch Competition - Audience Award
EIT Health, Alemanha
2019 Best Poster Award - "Neural mechanisms in brain-computer interfacing" category - Real-time functional imaging and neurofeedback conference (RT-FIN)
Universiteit Maastricht, Países Baixos
2018 PROT IERA
Universidade de Aveiro Departamento de Engenharia Mecânica, Portugal

Universidade de Aveiro, Portugal
2016 Honorable Mention Award Road Safety Innovation Competition
Portugal’s Automobile Club, Portugal

BP Portugal, Portugal

Associação Nacional de Inovação , Portugal

CRUP - Conselho de Reitores das Universidades Portuguesas, Portugal
2016 Ministry of Science and Technology and Higher Education’s 'Born from Knowledge' finalist
Ministry of Science and Technology and Higher Education’s, Portugal
2016 Honorable mention at “BIG Smart Cities” Final by Public Vote
Vodafone Power Lab, Portugal
2015 Innovation and Technical Entrepreneurship Competition
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal