João Pedro Marques de Sousa (9A1A-538A-FB44)

Curriculum Vitae

João Pedro Marques de Sousa

João Sousa holds a Ph.D. in Chemistry (2024) from the University of Porto's Faculty of Sciences, and a Master's and Bachelor's in Biochemistry (2018, 2016) from both the University of Porto's Faculty of Sciences and the Institute of Biomedical Sciences Abel Salazar. João is currently a Postdoctoral Researcher at REQUIMTE/LAQV in Porto. With 8 peer-reviewed publications, João has contributed to the fields of Chemical and Biological Sciences, with a focus on Biochemistry. João has collaborated with 23 researchers on scientific papers and has actively participated as a Research Fellow in one project. His research experience spans enzymatic engineering, molecular modeling, and computational chemistry, with a strong emphasis on interdisciplinary collaboration.

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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo: João Pedro Marques de Sousa

Nomes de citação

Sousa JPM
João P.M. Sousa

Identificadores de autor

Ciência ID: 9A1A-538A-FB44
ORCID iD: 0000-0002-4915-4946

Telefones

Telemóvel

911766880 (Pessoal)

Domínios de atuação

Ciências Exatas - Química
Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Bioquímica

Idiomas

Idioma	Conversação	Leitura	Escrita	Compreensão	Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês	Utilizador independente (B2)	Utilizador independente (B2)	Utilizador independente (B2)	Utilizador independente (B2)	Utilizador independente (B2)

Formação

	Grau	Classificação
2019/08 - 2024/03 Concluído	Química (Doutoramento) Especialização em Especialidade: Química Teórica e Modelação Molecular Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal "Improvement of an enzymatic cascade for the biosynthesis of opioid drugs" (TESE/DISSERTAÇÃO)
2016 - 2018 Concluído	Bioquímica (Mestrado integrado) Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal Universidade do Porto Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar, Portugal "QM/MM Study of DszB Reaction Mechanism for Crude Oil Biodesulphurization" (TESE/DISSERTAÇÃO)	17
2013 - 2016 Concluído	Bioquímica (Licenciatura) Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal Universidade do Porto Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar, Portugal ""Establishment of an optimized protocol to select subpopulations of endothelial progenitor cells from human peripheral blood"" (TESE/DISSERTAÇÃO)	14

Percurso profissional

Ciência

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2024/03 - Atual	Pós-doutorado (Investigação)	REQUIMTE LAQV Porto, Portugal
	REQUIMTE LAQV Porto, Portugal
2019/08 - 2024/03	Assistente de Investigação (carreira) (Investigação)	Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
	REQUIMTE LAQV Porto, Portugal
2018/12/01 - 2019	Estagiário de Investigação (Investigação)	REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal

Projetos

Bolsa

	Designação	Financiadores
2018/12 - 2019	Estudo do mecanismo catalítico da enzima DszB ICETA 2018-58 Bolseiro de Investigação

Projeto

	Designação	Financiadores
2019/09/01 - 2023/08/31	Improvement of an enzymatic cascade for the biosynthesis of opioid drugs SFRH/BD/144205/2019 Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído

Produções

Publicações

Artigo em revista	João P. M. Sousa; Maria J. Ramos; Pedro A. Fernandes. "The Catalytic Mechanism of Decarboxylation of L-DOPA to Dopamine by Papaver somniferum Aromatic Amino Acid Decarboxylase – A Computational Study". ChemCatChem (2024): https://doi.org/10.1002/cctc.202400762. 10.1002/cctc.202400762 João P. M. Sousa; Maria J. Ramos; Pedro A. Fernandes. "QM/MM Study of the Reaction Mechanism of L-Tyrosine Hydroxylation Catalyzed by the Enzyme CYP76AD1". The Journal of Physical Chemistry B (2024): https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.4c05209. 10.1021/acs.jpcb.4c05209 João Sousa; Nuno Azevedo Oliveira; Pedro Alexandrino Fernandes. "Rational Engineering of (S)-Norcoclaurine Synthase for Efficient Benzylisoquinoline Alkaloids Biosynthesis". Molecules (2023): https://www.mdpi.com/1420-3049/28/11/4265. 10.3390/molecules28114265 João P.M. Sousa; Ramos, Maria J.; Fernandes, Pedro A.. Autor correspondente: Fernandes, Pedro A.. "Modern Strategies for the Diversification of the Supply of Natural Compounds: The Case of Alkaloid Painkillers". ChemBioChem 23 10 (2022): http://dx.doi.org/10.1002/cbic.202100623. 10.1002/cbic.202100623 Neves, Rui P. P.; Ferreira, Pedro; Medina, Fabiola E.; Paiva, Pedro; João P.M. Sousa; Viegas, Matilde F.; Fernandes, Pedro A.; Ramos, Maria J.. "Engineering of PKS Megaenzymes—A Promising Way to Biosynthesize High-Value Active Molecules". Topics in Catalysis 65 1-4 (2021): 544-562. http://dx.doi.org/10.1007/s11244-021-01490-5. 10.1007/s11244-021-01490-5 Pedro Paiva; Fabiola E. Medina; Matilde Viegas; Pedro Ferreira; Rui P. P. Neves; João P. M. Sousa; Maria J. Ramos; Pedro A. Fernandes. "Animal Fatty Acid Synthase: A Chemical Nanofactory". Chemical Reviews (2021): https://doi.org/10.1021/acs.chemrev.1c00147. 10.1021/acs.chemrev.1c00147 João P. M. Sousa; Rui P. P. Neves; Sérgio F. Sousa; Maria J. Ramos; Pedro A. Fernandes. "Reaction Mechanism and Determinants for Efficient Catalysis by DszB, a Key Enzyme for Crude Oil Bio-desulfurization". ACS Catalysis (2020): 9545-9554. https://doi.org/10.1021/acscatal.0c03122. 10.1021/acscatal.0c03122 Sousa, João. "Proteínas Virais no Protein Data Bank". Revista de Ciência Elementar (2020): http://dx.doi.org/10.24927/rce2020.022. 10.24927/rce2020.022 João P. M. Sousa; Pedro Ferreira; Rui P. P. Neves; Maria J. Ramos; Pedro A. Fernandes. "The bacterial 4S pathway – an economical alternative for crude oil desulphurization that reduces CO2 emissions". Green Chemistry (2020): https://doi.org/10.1039/D0GC02055A. 10.1039/D0GC02055A
Poster em conferência	Fernandes, Pedro; Sousa, João; Sousa, Sérgio; Ramos, Maria. "Single vs Multi Conformational QM/MM approach for enzymatic catalysis: The case of study of the HBP Sdesulfinase from the 4S pathway". Trabalho apresentado em EJIBCE: Meeting of Young Researchers in Structural Computational Biology, Porto, Portugal, 2018, 2018. 10.3390/mol2net-04-06091 Sousa, João. "Study of Enzymatic Catalysis: Single Conformation QM/MM vs. Multi-PES approach". Trabalho apresentado em International Conference on Catalysis Science, Engineering & Technology, 2018.
Tese / Dissertação	Sousa, João. "QM/MM Study of DszB Reaction Mechanism for Crude Oil Biodesulphurization". Mestrado, Universidade do Porto Faculdade de Ciências, 2018.

Atividades

Apresentação oral de trabalho

	Título da apresentação	Nome do evento Anfitrião (Local do evento)
2019/02/14	Single Conformational vs. Multi Conformational QM/MM: The desulfination reaction of DszB	IJUP'19 - 12º Encontro de Jovens Investigadores da Universidade do Porto Reitoria da Universidade do Porto (Porto, Portugal)
2018/02/08	"QM/MM Study of DszB Reaction Mechanism for Crude Oil Biodesulfurization"	IJUP'18 - 11º Encontro de Jovens Investigadores da Universidade do Porto Faculdade de Medicina da Universidade do Porto (Porto, Portugal)

Participação em evento

	Descrição da atividade Tipo de evento	Nome do evento Instituição / Organização
2019/09/30 - 2019/10/04	Attended a international summer school dedicated to computational chemistry. The summer school hosted several renowned speakers in the field and lectioned courses in different Conferência	Dynapeutics International Summer School

Tutoria

	Tópico	Nome do aluno
2022/03 - 2023/03	Rational Engineering of (S)-Norcoclaurine Synthase for Efficient Benzylisoquinoline Alkaloids Biosynthesis	Nuno C. S. A. Oliveira